开发选择性神经蛋白酶体抑制剂
验证iBEp和SulfoMG作为细胞不可渗透的神经蛋白酶体抑制剂的特异性和有效性。
合成iBEp(Biotin-PEG24-Epoxomicin)和SulfoMG(磺酸化MG132衍生物),通过PAMPA、MDCK、GFPu降解、LC3-GFP、蛋白酶体bounceback等实验验证其不可渗透性及对膜蛋白酶体的选择性抑制。
Neuroproteasomes regulate endogenous tau paired helical filament formation in an APOE genotype- and age-dependent manner
包含体外原代神经元、体内小鼠模型、患者样本等多个独立证据层级,并通过抑制剂处理、免疫印迹、电镜、免疫组化及磷酸化蛋白组学进行了功能验证和机制验证。
原代小鼠皮层和海马神经元 hTau-KI小鼠(人源化Tau敲入) hTau/ApoE双敲入小鼠(E2、E3、E4) 人脑组织样本(BA4和BA7区域)
iBEp浓度:1 μM(体外),6.4 μM(海马内注射) 处理时间:原代神经元12小时,小鼠72小时 Sarkosyl不溶性Tau的生化分级和免疫印迹检测 电镜观察PHF形态及免疫金标记 AT8(pTau S202/T205)免疫组化及Thioflavin S染色
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证iBEp和SulfoMG作为细胞不可渗透的神经蛋白酶体抑制剂的特异性和有效性。
合成iBEp(Biotin-PEG24-Epoxomicin)和SulfoMG(磺酸化MG132衍生物),通过PAMPA、MDCK、GFPu降解、LC3-GFP、蛋白酶体bounceback等实验验证其不可渗透性及对膜蛋白酶体的选择性抑制。
探究神经蛋白酶体抑制是否导致内源性Tau蛋白进入sarkosyl不溶性组分。
用iBEp或SulfoMG处理原代神经元,通过sarkosyl分级分离和免疫印迹检测可溶性及不溶性Tau水平。
验证神经蛋白酶体抑制是否在体内诱导Tau PHF形成。
对hTau-KI小鼠海马CA1区立体定向注射iBEp,72小时后通过sarkosyl分级分离、免疫印迹和负染电镜检测不溶性Tau和PHF结构。
验证神经蛋白酶体抑制形成的Tau聚集体是否具有AD相关特征。
通过磷酸化蛋白组学检测Tau磷酸化位点,免疫组化检测AT8(pTau S202/T205)和Thioflavin S染色,以及免疫电镜验证PHF结构。
通过蛋白质组学鉴定神经蛋白酶体的相互作用蛋白,并寻找与ApoE及相关受体的关联。
使用20S-FLAG转基因小鼠,通过FLAG亲和纯化膜和胞质组分中的蛋白,进行TMT标记的质谱分析,鉴定神经蛋白酶体富含的相互作用蛋白。
确定ApoE亚型是否差异调节神经蛋白酶体的膜定位。
使用ApoE2/3/4敲入小鼠海马组织进行表面生物素化,以及在原代神经元中孵育脂化或非脂化的ApoE重组蛋白,通过表面生物素化和抗体喂养实验检测神经蛋白酶体膜定位。
探究ApoE基因型和年龄是否通过神经蛋白酶体影响Tau聚集的易感性。
分析人脑样本中APOE基因型与神经蛋白酶体水平的关系;检测不同年龄WT小鼠神经蛋白酶体水平;使用hTau/ApoE双敲入神经元进行iBEp剂量曲线,量化Tau聚集阈值。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | 埃博霉素 | Selleckchem | S7038 |
| MG132 | Selleckchem | S2619 | |
| 亮抑酶肽 | Thermo | 78435 | |
| Sarkosyl提取 | N-月桂酰肌氨酸 | Sigma | 61747 |
| 免疫沉淀 | 抗FLAG M2亲和凝胶 | Sigma | F1804 |
| 免疫分析 | 抗Tau抗体(R2295) | Virginia Lee | -- |
| AT8抗体 | ThermoFisher | MN1020 | |
| 抗pTau抗体(CP13) | Peter Davies | -- | |
| 抗NeuN抗体 | Sigma | ABN78 | |
| 表面生物素化 | 磺基-NHS-LC-生物素 | Thermo Fisher | -- |
| 链霉亲和素琼脂糖珠 | ThermoFisher | 20353 | |
| 免疫组织化学 | 硫黄素S | Sigma | T1892 |
| 细胞培养 | Neurobasal培养基 | Gibco | 21103049 |
| B-27补充剂 | Gibco | -- | |
| Neurobasal-A培养基 | Gibco | 10888022 | |
| 转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | 11668019 |
| 蛋白酶体活性检测 | Suc-LLVY-AMC底物 | Enzo Life Sciences | BML-P802 |
| RNA提取 | RNeasy小提试剂盒 | Qiagen | 74624 |
| cDNA合成 | iScript cDNA合成试剂盒 | Bio-Rad | 1708890 |
| qPCR | PowerUp SYBR Green预混液 | ThermoFisher | A25742 |
| 电泳 | Criterion TGX凝胶 | Bio-Rad | 5671034 |
| 蛋白质定量 | RC DC蛋白定量试剂盒 | Bio-Rad | 5000121 |
| 成像 | CSU-W1 SoRa共聚焦显微镜 | Nikon | -- |
| 电镜 | Hitachi HT7800透射电镜 | Hitachi | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 药物处理 | iBEp浓度、处理时间、细胞类型 阅读提示:Methods: Drug treatments |
| Sarkosyl提取 | 裂解液成分、离心力、时间 阅读提示:Methods: Sarkosyl extraction |
| 立体定向注射 | 注射坐标、注射体积、药物浓度、小鼠品系 阅读提示:Methods: Stereotaxic Surgery |
| 免疫组织化学 | 抗体浓度、切片厚度、染色条件 阅读提示:Methods: Immunohistochemistry |
| 表面生物素化 | 生物素浓度、孵育时间、试剂来源 阅读提示:Methods: Surface Biotinylation and Streptavidin Pulldown |