诱导EAE模型
建立MS的体内模型,以研究视神经炎。
对WT和Smox KO小鼠皮下注射MOG35-55与CFA的乳化液,并在第0天和第1天腹腔注射PTX。对照组仅注射CFA乳化液。
Proteomic Profiling of Optic Nerves From SMOX-Deficient Mice Identifies Regulators of Neuroinflammation and Axonal Damage in Optic Neuritis
包含EAE动物模型、LC-MS/MS蛋白质组学分析和免疫荧光验证,但机制验证有限,且未进行体外或其他模型验证。
EAE小鼠模型(WT和Smox KO) 视神经组织样本
EAE诱导:MOG35-55乳化剂200 µg/只,皮下注射,含CFA;PTX 100 ng腹腔注射于第0和1天 临床评分:每日评估,0-5分制,盲法,n=6-9只/组,3次独立诱导 蛋白质组学样本:每只小鼠两条视神经合并为一个生物重复,n=4/组,在D17天收集 质谱分析:LC-MS/MS(Orbitrap Fusion Tribrid),数据依赖采集,FDR<1% 差异蛋白筛选:P<0.05,|log2FC|>1,且排除在<70%样本中未检出的蛋白
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立MS的体内模型,以研究视神经炎。
对WT和Smox KO小鼠皮下注射MOG35-55与CFA的乳化液,并在第0天和第1天腹腔注射PTX。对照组仅注射CFA乳化液。
监测EAE诱导后随时间出现的运动功能障碍。
每天对小鼠进行临床评分,采用0-5分六级评分系统。在第17天处死小鼠,收集视神经。
鉴定WT和Smox KO小鼠在EAE条件下视神经蛋白表达的差异。
从视神经提取蛋白,过滤沉淀,还原烷基化,胰酶酶解,然后通过LC-MS/MS分析。利用Proteome Discoverer处理原始数据,进行数据库搜索。
验证RACK1, ACTN4, HMGB1, S100B在视神经中的表达变化。
对视神经冷冻切片进行免疫荧光染色,使用特异性一抗和二抗,通过共聚焦显微镜成像。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 蛋白质提取 | RIPA缓冲液 | -- | -- |
| C18微量离心板 | Harvard Apparatus | -- | |
| 蛋白质组学分析 | Orbitrap Fusion Tribrid质谱仪 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| UltiMate 3000纳升超高效液相色谱系统 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Acclaim PepMap 100 RSLC C18色谱柱 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Proteome Discoverer 2.5 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 免疫荧光 | RACK1抗体 | Thermo Fisher Scientific | PA5-78161 |
| S100B抗体 | Thermo Fisher Scientific | PA1-655 | |
| ACTN4抗体 | Proteintech | 19096-1-AP | |
| HMGB1抗体 | Cell Signaling Technology | 3935 | |
| 驴抗兔二抗 | Thermo Fisher Scientific | A21206 | |
| 动物实验 | EAE诱导试剂盒 | Hooke Laboratories | EK-2110 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| EAE诱导 | MOG35-55剂量200 µg/只,皮下注射;PTX 100 ng腹腔注射于第0和1天;小鼠品系及周龄(雌性C57BL/6J,10-13周),组别及对照 阅读提示:Methods: Animals, Induction of Experimental Autoimmune Encephalomyelitis, and Clinical Scoring |
| 临床评分 | 评分系统(0-5分制),每日盲法评估,评分标准和伦理终点(评分≥4或体重下降>20%需安乐死) 阅读提示:Methods: Animals, Induction of Experimental Autoimmune Encephalomyelitis, and Clinical Scoring; Results及Figure 1图注 |
| 蛋白质组学分析 | 蛋白提取方法(RIPA缓冲液),样本量(n=4/组,每条视神经独立,每鼠两条视神经pooled),LC-MS/MS仪器参数(120分钟梯度,FDR<1%),蛋白保留标准(ΣCoverage ≥10%,缺失值imputation) 阅读提示:Methods: Protein Extraction, LC-MS/MS Analysis, Database Search, and Proteomic Data Processing; Supplementary Methods |
| 免疫荧光分析 | 组织固定和切片(4% PFA固定,30%蔗糖,10 µm切片),抗体稀释及来源,成像设备,量化方法(mean ± SEM,n=3/组) 阅读提示:Methods: Immunofluorescence Staining; Table和Figure 8图注 |