验证GBA1突变细胞中的溶酶体功能障碍
评估GBA1突变对溶酶体功能的影响
测量了患者来源的成纤维细胞和iPSC-多巴胺能神经元中的GCase活性、溶酶体酸化和蛋白酶活性。
Targeting lysosomal pH restores mitochondrial quality control in GBA1-mutant Parkinson's disease
研究包含多层级验证:患者来源细胞模型(成纤维细胞和iPSC-多巴胺能神经元)、功能验证(线粒体自噬、生物能学)、机制验证(V-ATPase组装FLIM-FRET)及药理学干预(雷帕霉素、酸性纳米颗粒)。
GBA1-PD患者来源的皮肤成纤维细胞 GBA1-PD患者iPSC来源的多巴胺能神经元 CRISPR校正的同基因对照iPSC系
细胞类型:GBA1-E326K或N370S突变的患者来源成纤维细胞和iPSC-多巴胺能神经元,以及匹配的同基因对照 处理条件:200 nM雷帕霉素或180 µg/mL酸性纳米颗粒处理12-16小时 关键检测:溶酶体pH(Lysosensor Yellow/Blue DND 160)、线粒体膜电位(TMRM)、线粒体自噬(mt-Keima) 机制验证:通过FLIM-FRET测量ATP6V1B2-mNeonGreen与ATP6Voa3-mScarlet的相互作用
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估GBA1突变对溶酶体功能的影响
测量了患者来源的成纤维细胞和iPSC-多巴胺能神经元中的GCase活性、溶酶体酸化和蛋白酶活性。
评估GBA1突变对线粒体形态和功能的影响
测量了线粒体膜电位、形态、耗氧率和呼吸链复合物水平。
探究溶酶体功能障碍与线粒体功能障碍之间的机制联系
检测了线粒体自噬通量,并分析了自噬相关蛋白和超微结构。
探究溶酶体pH升高的分子机制
检测了V-ATPase亚基的表达和组装,以及MTORC1的磷酸化状态。
测试通过恢复溶酶体pH是否能挽救细胞功能障碍
使用雷帕霉素和酸性纳米颗粒处理细胞,评估溶酶体pH、线粒体自噬和线粒体功能。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM (1×) + GlutaMAX™基础培养基 | Gibco | 61965-059 |
| 胎牛血清 | Gibco | 10270098 | |
| 抗生素-抗真菌剂 | Gibco | 15240096 | |
| 0.25%胰蛋白酶-EDTA | Gibco | 25200056 | |
| mTeSR Plus培养基 | STEMCELL Technologies | 100-0276 | |
| 0.5 mM EDTA | Gibco | 15575020 | |
| 神经分化 | Neurobasal培养基 | Gibco | 21103049 |
| B27添加剂 | Gibco | 17504044 | |
| Glutamax添加剂 | Gibco | 35050-038 | |
| DMEM-F12培养基 | Gibco | 10565018 | |
| N2添加剂 | Gibco | 17502048 | |
| MEM非必需氨基酸 | Gibco | 11140-050 | |
| β-巯基乙醇 | Gibco | 21985-023 | |
| 人胰岛素溶液 | Sigma | I9278 | |
| SB431542 | Tocris Bioscience | 1614/10 | |
| CHIR99021 | Tocris Bioscience | 4423 | |
| 分散酶 | Gibco | 17105041 | |
| Accutase | Gibco | A1110501 | |
| 化合物E | Enzo Lifesciences | ALX-270-415-C250 | |
| 药物处理 | 雷帕霉素 | Sigma | R0395 |
| 琥珀酸二乙酯 | Merck Millipore | 112402 | |
| 转染 | Xtremegene-HP转染试剂 | Merck Millipore | 6366236001 |
| 慢病毒包装 | Lenti-X转染试剂 | Takara | 631231 |
| 活细胞成像 | Lysosensor Yellow/Blue DND 160 | Invitrogen | L7545 |
| 溶酶体pH校准 | 尼日利亚霉素 | Sigma | N7143 |
| 溶酶体蛋白酶活性检测 | DQRed BSA | Invitrogen | D12051 |
| 线粒体膜电位检测 | 四甲基罗丹明甲酯(TMRM) | Thermo Scientific | T668 |
| 溶酶体共定位检测 | LysoTracker Blue DND-22 | Invitrogen | L7525 |
| 溶酶体富集 | 组织和培养细胞溶酶体富集试剂盒 | Thermo Scientific | 89839 |
| 蛋白质印迹 | RIPA裂解缓冲液 | Sigma-Aldrich | R0278 |
| 蛋白酶抑制剂 | Roche | 4693116001 | |
| 磷酸酶抑制剂 | Roche | 4906837001 | |
| 蛋白质定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Scientific | 23227 |
| 蛋白质印迹 | NuPAGE 4×上样缓冲液 | Invitrogen | NP0007 |
| MOPS电泳缓冲液 | Invitrogen | NP0001 | |
| PVDF膜 | Merck Millipore | IPFL00010 | |
| Superblock封闭缓冲液 | Invitrogen | 37545 | |
| IRDye® 680RD山羊抗小鼠IgG | Li-COR Biosciences | 926-68070 | |
| IRDye® 800CW山羊抗兔IgG | Li-COR Biosciences | 926-32211 | |
| 免疫染色 | 洋地黄皂苷 | -- | -- |
| Alexa Fluor 488/594/647偶联二抗 | -- | -- | |
| 线粒体分离 | 线粒体分离缓冲液(MIB1) | -- | -- |
| 无脂肪酸BSA | -- | -- | |
| 呼吸测量 | Seahorse XF细胞线粒体压力测试试剂盒 | Agilent | 103015-100 |
| Seahorse XF96细胞培养微孔板 | Agilent | 102416-100 | |
| Seahorse XF基础培养基 | Agilent | 103334-100 | |
| 谷氨酰胺 | Gibco | 25030081 | |
| 葡萄糖 | Gibco | A2494001 | |
| 寡霉素 | -- | -- | |
| FCCP | -- | -- | |
| Hoechst 33342 | Thermo Scientific | 62249 | |
| 透射电子显微镜 | 环氧树脂(Araldite Kit CY212) | Agar Scientific Ltd. | -- |
| 成像设备 | Carl Zeiss LSM 880共聚焦激光扫描显微镜 | Carl Zeiss | -- |
| JEOL1400透射电子显微镜 | JEOL | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞模型 | 使用GBA1-E326K或N370S突变患者来源的成纤维细胞和iPSC-多巴胺能神经元,以及匹配的同基因对照;确认细胞系来源和伦理审批(Table S1) 阅读提示:Materials and methods - Cell lines and ethics committee approval, Table S1 |
| 神经元分化 | 遵循特定的iPSC向多巴胺能神经元分化的步骤,包括使用SB431542、dorsomorphin、CHIR99021、purmorphamine等因子;分化时间至70-75天 阅读提示:Materials and methods - Human pluripotent stem cell-derived DA neurons |
| 药物处理 | 雷帕霉素使用浓度200 nM,处理12-16小时;酸性纳米颗粒使用浓度180 µg/mL,处理12-16小时;确保药物和NPs的制备和储存条件一致 阅读提示:Materials and methods - NP, rapamycin and diethyl succinate treatment |
| 溶酶体pH测量 | 使用Lysosensor Yellow/Blue DND 160染色,浓度3 µM,染色4分钟;根据文献建立pH校准曲线(使用Monensin和Nigericin) 阅读提示:Materials and methods - Lysosensor Yellow/Blue DND 160, Lysosomal pH measurement; Figure legends for Fig. 1d and Fig. 5a |
| 线粒体自噬测量 | 使用mt-Keima报告基因,在成像前72-96小时转导细胞;使用458 nm和561 nm激发,并计算543/458 nm荧光比值 阅读提示:Materials and methods - Measurement of mitophagy using mt-Keima reporter; Figure legends for Fig. 3a and Fig. 5c |