临床样本微塑料检测
确认结直肠癌患者肿瘤组织和血液中是否存在微塑料,并分析其特征。
采用LDIR和Py-GC/MS技术对患者肿瘤组织和血液样本进行微塑料检测,分析其类型、尺寸分布、形态及浓度,并评估与患者生存期的相关性。
Tumour-infiltrating microplastics disrupt the JAK-STAT-microbiota axis to promote immunotherapy resistance in colorectal cancer
包含临床样本检测、细胞实验、两种动物模型、转录组与16S rRNA测序等多层级证据,并有功能验证与机制研究。
HCT116、SW480、CT26、MC38结直肠癌细胞系 AOM-DSS诱导的原位结直肠癌小鼠模型 CT26皮下移植瘤小鼠模型 结直肠癌患者肿瘤组织和血液样本
微塑料暴露剂量:200 mg/mL聚苯乙烯微塑料溶液,经饮水给予; 动物模型:AOM-DSS原位模型及CT26皮下移植瘤模型,均使用BALB/c小鼠; 抗PD-L1治疗:200 μg/只/次,每3天一次,原位模型共5次,皮下模型共6次; 微塑料摄取机制:主要通过网格蛋白介导的内吞作用,抑制剂Pitstop 2和Dynasore可阻断摄取; 微塑料暴露时间:原位模型暴露超过10周,皮下模型暴露14天。
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确认结直肠癌患者肿瘤组织和血液中是否存在微塑料,并分析其特征。
采用LDIR和Py-GC/MS技术对患者肿瘤组织和血液样本进行微塑料检测,分析其类型、尺寸分布、形态及浓度,并评估与患者生存期的相关性。
探究结直肠癌细胞对聚苯乙烯微塑料的摄取机制及在细胞内的分布。
使用荧光标记的PS-MPs(Cy5-MPs)与人结直肠癌细胞系(HCT116、SW480)和小鼠细胞系(CT26、MC38)共培养,通过激光共聚焦显微镜观察MPs与溶酶体和线粒体的共定位,并通过内吞抑制剂评估摄取途径。
评估长期微塑料暴露对结直肠癌进展及抗PD-L1免疫治疗疗效的影响。
建立AOM-DSS诱导的结直肠癌原位模型和CT26皮下移植瘤模型,分别给予微塑料或水,并在模型后期进行抗PD-L1治疗,比较肿瘤负荷、体重变化及病理损伤。
揭示微塑料诱导免疫治疗耐药的分子机制,特别是JAK-STAT通路的变化。
对原位肿瘤组织进行RNA-seq,分析差异表达基因和通路;用Western blot、RT-qPCR和ELISA验证JAK-STAT通路关键蛋白和细胞因子表达。
验证JAK-STAT通路在微塑料诱导免疫抑制中的作用。
使用JAK-STAT激动剂2-NP或构建STAT1组成性激活的过表达细胞系,评估能否逆转微塑料对JAK-STAT通路和IFN-γ靶基因的抑制作用。
评估微塑料对肿瘤组织中CD8+和CD4+ T细胞浸润及功能的影响。
对原位和皮下肿瘤组织进行多重免疫荧光染色,检测CD4、CD8、IFN-γ和GZMB表达,量化T细胞浸润水平。
探究微塑料暴露对结直肠癌小鼠肠道菌群组成和多样性的影响。
收集小鼠粪便,进行16S rRNA基因测序,分析菌群多样性、组成差异及功能预测。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 微塑料检测 | 8700 LDIR化学成像系统 | Agilent Technologies | -- |
| 热裂解-气相色谱/质谱系统 | Shimadzu | QP2020NX, | |
| 微塑料表征 | 多角度粒度及高灵敏度Zeta电位分析仪 | Brookhaven | NanoBrook |
| 微塑料摄取 | 蔡司LSM 900 + Airyscan2激光共聚焦显微镜 | Zeiss | LSM |
| 微塑料表征 | 透射电子显微镜 | Hitachi | HT-7800 |
| 活体成像 | IVIS SPECTRUM小动物活体光学成像系统 | Perkin Elmer | -- |
| 组织学分析 | Akoya Vectra Polaris全组织多色荧光定量成像系统 | Akoya | -- |
| Western blot | ChemiDoc成像系统 | Bio-Rad | -- |
| RT-qPCR | NanoDrop One分光光度计 | Thermo Scientific | -- |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| RPMI 1640培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| 细胞摄取 | Hoechst 33342染料 | Yeasen | 40731ES10 |
| 溶酶体绿色荧光探针 | Yeasen | 40738ES50 | |
| 线粒体绿色荧光探针 | Yeasen | 40742ES50 | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime Biotechnology | P0013B |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | New Cell & Molecular Biotech | P002 | |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime Biotechnology | P0012S | |
| SDS-PAGE凝胶 | ACE Biotechnology | ET15412Gel | |
| PVDF膜 | Beyotime Biotechnology | FFP39 | |
| 抗体稀释液 | New Cell & Molecular Biotech | WB500D | |
| ECL化学发光检测试剂盒 | New Cell & Molecular Biotech | P10300 | |
| RT-qPCR | TRIzol试剂 | Invitrogen | 15596018 |
| Evo M-MLV逆转录预混试剂盒 | Accurate Biotechnology | AG11728 | |
| SYBR Green Pro Taq HS预混qPCR试剂盒 | Accurate Biotechnology | AG11718 | |
| 药物处理 | 氧化偶氮甲烷 | MP Biomedicals | 183971 |
| 右旋糖酐硫酸钠 | MCE | HY-116282 | |
| Dynasore(发动蛋白抑制剂) | MCE | HY-15304 | |
| Pitstop 2(网格蛋白抑制剂) | MCE | HY-115604 | |
| EIPA(Na+/H+交换抑制剂) | MCE | HY-101840 | |
| 2-NP(JAK-STAT激动剂) | MCE | HY-W013523 | |
| 免疫治疗 | 抗小鼠PD-L1 (B7-H1) InVivo抗体 | Selleck | A2115 |
| Western blot | 抗GAPDH抗体 | Proteintech | 60004-1-Ig |
| 抗JAK2抗体 | Abcam | ab108596 | |
| 抗磷酸化JAK2 (Tyr1007/1008)抗体 | Abcam | ab32101 | |
| 抗STAT1抗体 | Cell Signaling Technology | 14994 | |
| 抗磷酸化STAT1 (Tyr701)抗体 | Cell Signaling Technology | 9167 | |
| 抗STAT3抗体 | Abcam | ab68153 | |
| 抗磷酸化STAT3 (Tyr705)抗体 | Abcam | ab76315 | |
| 免疫组化 | 抗Ki67抗体 | Abiowell | AWA11025 |
| 免疫荧光 | 抗CD4抗体 | Abcam | ab183685 |
| 抗CD8抗体 | Abcam | ab217344 | |
| 抗GZMB抗体 | Abcam | ab255598 | |
| 抗IFN-γ抗体 | Proteintech | 29788 | |
| 微塑料处理 | 聚苯乙烯微塑料(50 nm) | Jiangsu Zhichuan Technology Co., Ltd. | -- |
| 荧光标记Cy5微塑料 | Jiangsu Zhichuan Technology Co., Ltd. | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本微塑料检测 | 样本来源、患者纳入标准、LDIR检测条件(如消化时间、温度、MQ阈值、粒径范围)和Py-GC/MS检测条件(如裂解温度、色谱柱、升温程序)需核对。 阅读提示:Materials and methods 中 Sample collection, Laser direct infrared (LDIR) imaging, Pyrolysis‒gas chromatography/mass spectrometry (Py‒GC‒MS) 部分 |
| 细胞摄取实验 | 细胞系(HCT116、SW480、CT26、MC38)及其来源、培养条件、MP-Cy5浓度、共培养时间、内吞抑制剂(Pitstop 2、Dynasore)及浓度、溶酶体/线粒体探针及浓度。 阅读提示:Materials and methods 中 Cell culture, Cell uptake and localization 部分 |
| 动物模型 | 动物品系、性别、年龄、体重、造模方法(AOM剂量、DSS浓度及周期)、微塑料暴露浓度(200 mg/mL)及途径(饮水)、抗PD-L1抗体剂量(200 μg/只)及给药方案(次数、间隔)、各组动物数量(原位n=6,皮下n=5)。 阅读提示:Materials and methods 中 Mouse orthotopic tumour model, Mouse subcutaneous tumour model 部分 |
| 分子检测 | Western blot 中蛋白上样量(20 μg)、抗体稀释比例、孵育条件和内参(GAPDH);RT-qPCR 中引物序列、内参基因;ELISA 中标准品稀释和操作步骤。 阅读提示:Materials and methods 中 Western blot analysis, RT-qPCR analysis, ELISA 部分 |
| 组织学与免疫荧光 | 组织固定、脱水、包埋、切片厚度(4 μm)、抗原修复方法(EDTA或枸橼酸缓冲液)、一抗孵育条件、TSA染料使用顺序。 阅读提示:Materials and methods 中 Histological analysis, Multiplex immunofluorescence staining 部分 |
| 16S rRNA测序 | 粪便样本采集时间点、DNA提取方法、PCR扩增引物(如515F/806R)、测序平台、生物信息学分析流程(QIIME2参数)。 阅读提示:Materials and methods 中 16S rRNA sequencing analysis 部分 |