HH暴露模型及认知行为评估
确定HH暴露是否导致认知障碍及其可逆性
8周龄雄性C57BL/6J小鼠暴露于7000米低压低氧2天,并设置恢复8天组。通过新物体识别(NOR)测试评估短期记忆。
Microglial cholesterol reprogramming drives cognitive impairment under hypobaric hypoxia
包含体外原代小胶质细胞、体内小鼠模型、多组学分析(RNA-seq/ATAC-seq/CUT&Tag)、药理学干预及小胶质细胞特异性基因敲除,并进行功能与机制验证。
小鼠低压低氧模型 原代小胶质细胞 NRF1条件性敲除小鼠 HEK293T细胞
低压低氧暴露条件:7000米,2天,恢复8天 小胶质细胞耗竭:PLX5622饲料(1200 ppm)14天 胆固醇合成抑制:辛伐他汀(20 mg/kg/天)腹腔注射14天 胆固醇转运抑制:U18666A(20 mg/kg)腹腔注射 NRF1敲除:他莫昔芬(100 mg/kg/天)腹腔注射5天
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定HH暴露是否导致认知障碍及其可逆性
8周龄雄性C57BL/6J小鼠暴露于7000米低压低氧2天,并设置恢复8天组。通过新物体识别(NOR)测试评估短期记忆。
检测HH暴露后脑内胆固醇和甘油三酯水平的变化
使用酶法检测脑组织总胆固醇和游离胆固醇水平,使用试剂盒检测甘油三酯。
揭示HH暴露后脑内转录和染色质可及性变化,筛选关键通路
对HH2dR8d小鼠脑组织进行RNA-seq和ATAC-seq,并进行GO富集分析。
确定HH暴露后脑内胆固醇积累的细胞类型
使用Filipin染色与细胞特异性标记物(Iba1、GFAP、NeuN)共标记,分析小胶质细胞、星形胶质细胞和神经元中胆固醇水平。
验证小胶质细胞在HH诱导的胆固醇积累和突触丢失中的作用
给予PLX5622饲料(1200 ppm)14天耗竭小胶质细胞,然后进行HH暴露,检测胆固醇水平、星形胶质细胞胆固醇积累和突触密度。
验证缺氧对小胶质细胞胆固醇合成和脂滴积累的直接影响
原代小胶质细胞在1% O2下培养24小时,并用U18666A或Monacolin J处理,检测胆固醇和脂滴水平。
阐明缺氧诱导胆固醇合成的分子机制
通过RNA-seq/ATAC-seq分析发现HSP90上调,用qPCR和免疫荧光验证;检测SREBP2核转位;用siRNA敲低Hsp90或Srebf2,检测胆固醇和脂滴积累。
验证NRF1作为Hsp90aa1/Hsp90ab1的转录因子
通过JASPAR预测结合位点,CUT&Tag验证结合,双荧光素酶报告基因检测转录活性,并用Cre-GFP慢病毒感染NRF1fl/fl小胶质细胞敲除NRF1,检测HSP90、SREBP2、胆固醇和脂滴。
验证NRF1在HH诱导的胆固醇积累和认知障碍中的作用
利用NRF1fl/flCx3cr1CreERT2小鼠注射他莫昔芬敲除小胶质细胞NRF1,进行HH暴露,检测胆固醇水平、认知行为(MWM和NOR)和突触密度。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | 他莫昔芬 | -- | -- |
| 低压低氧暴露 | ProOx-830 | TOW | -- |
| 药物处理 | U18666A | MCE | HY-107433 |
| 辛伐他汀 | MCE | HY-17502 | |
| 小胶质细胞耗竭 | PLX5622配方饲料 | SYSE | D20010801 |
| 细胞培养 | DMEM/F12培养基 | -- | -- |
| 粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| Glutamax | -- | -- | |
| 青霉素/链霉素 | -- | -- | |
| 转染 | Lipofectamine 2000 | -- | -- |
| 荧光染色 | 菲律宾菌素III | MCE | HY-N6718 |
| 尼罗红 | MCE | HY-D0718 | |
| BODIPY 493/503 | MCE | HY-D1614 | |
| 细胞处理 | 莫纳可林J | MCE | HY-104051 |
| 生化检测 | 总胆固醇检测试剂盒 | 南京建成生物工程 | A111-1-1 |
| 游离胆固醇检测试剂盒 | Solarbio | BC1895 | |
| 实时荧光定量PCR | ChamQ通用SYBR qPCR预混液 | Vazyme | Q711 |
| cDNA合成 | HiScript IV通用型Pro RT预混液 | Vazyme | R433 |
| RNA提取 | Trizol试剂 | -- | -- |
| qPCR仪器 | QuantStudio 6 Flex系统 | -- | -- |
| 荧光显微镜 | 蔡司Axio Observer 7(带Apotome 3) | Zeiss | -- |
| 共聚焦显微镜 | 徕卡SP8 | Leica | -- |
| 免疫荧光 | 抗NRF1抗体 | CST | 69432 S |
| 抗HSP90β抗体 | Selleck | F1132 | |
| 抗PLIN2抗体 | Proteintech | 80362-2-RR | |
| 抗Iba1抗体 | Osaisbiofarm | OB-PGP049 | |
| 抗GFAP抗体 | CST | 3670 | |
| 抗P2RY12抗体 | Osaisbiofarm | OB-PRT120 | |
| 抗SREBP2抗体 | Santa Cruz | sc-13552 | |
| 抗TUJ1抗体 | Proteintech | 66375-1-lg | |
| 抗NeuN抗体 | Osaisbiofarm | OB-PGP006-T | |
| 抗PSD95抗体 | Proteintech | 20665-1-AP | |
| 抗突触素抗体 | Proteintech | 67864-1-Ig | |
| 驴抗小鼠Alexa 488 | Jackson | 715-545-150 | |
| 山羊抗小鼠Cy3 | Jackson | 115-165-003 | |
| 驴抗兔Alexa 488 | Jackson | 711-545-152 | |
| 抗兔Cy3 | Jackson | 711-165-003 | |
| 驴抗大鼠Alexa 647 | Jackson | 706-165-148 | |
| 核染色 | DAPI | -- | -- |
| CUT&Tag | Hyperactive Universal CUT&Tag分析试剂盒(Illumina Pro) | Vazyme | TD904 |
| 抗NRF1抗体 (ab175932) | Abcam | ab175932 | |
| 双荧光素酶报告基因 | 双荧光素酶报告基因检测系统 | Vazyme | DL101-01 |
| 数据分析 | GraphPad Prism 8.0 | -- | -- |
| 图像分析 | FIJI/ImageJ | -- | -- |
| 测序服务 | Illumina NovaSeq平台 | Novogene | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型与低压低氧暴露 | 小鼠品系、性别、年龄;低压低氧设备参数(7000米,2天);恢复条件(8天常氧) 阅读提示:见Materials and methods: Animals and treatments; Simulated high-altitude exposure |
| 药物处理 | 药物剂量、给药途径、给药时间;溶剂对照 阅读提示:见Materials and methods: U18666A-induced intracranial cholesterol accumulation model; Simvastatin-mediated inhibition |
| 小胶质细胞耗竭 | PLX5622饲料浓度(1200 ppm)和喂食时间(14天);HH暴露时间 阅读提示:见Materials and methods: PLX5622-induced microglial depletion |
| 体外细胞实验 | 原代小胶质细胞分离和培养条件;缺氧处理(1% O2, 24h);药物浓度(U18666A 5 µM, Monacolin J 2.5 µM);转染条件(siRNA序列、转染试剂) 阅读提示:见Materials and methods: Cell culture and treatment; Microglia treatment; Construction of siHsp90ab1 or siSrebf2 primary microglia |
| 分子机制验证 | NRF1敲除策略(他莫昔芬剂量、时间);病毒转染MOI;CUT&Tag抗体和试剂盒;双荧光素酶报告基因载体 阅读提示:见Materials and methods: Construction of NRF1-knockout primary microglia; CUT&Tag; HEK293T cell culture and dual-luciferase reporter assay |
| 行为学检测 | NOR测试参数(适应时间、探索时间、间隔时间);MWM训练和测试参数(平台直径、隐蔽平台、天数) 阅读提示:见Materials and methods: Cognitive behavioral assay; MWM |
| 生化检测 | 脑组织胆固醇测定试剂盒及方法;组织处理步骤 阅读提示:见Materials and methods: Brain tissue lipid content assay |