Wnt5a敲除小鼠模型构建与表型分析
评估Wnt5a缺失对苗勒管发育的影响
使用Wnt5a+/- 小鼠杂交获得Wnt5a-/- 胚胎,在18.5 dpc收集样本,观察生殖道形态并测量子宫角长度。
Wnt5a Regulates Embryonic Müllerian Duct Development Through the Non-Canonical Wnt PCP Pathway
包含Wnt5a敲除小鼠模型、免疫荧光、Wnt信号PCR芯片及单细胞RNA测序等多层级验证,并有功能与机制研究。
Wnt5a-/- 小鼠胚胎苗勒管 野生型小鼠胚胎苗勒管
Wnt5a-/- 小鼠模型(C57BL/6背景) 18.5 dpc 样本采集时间点 PH3 增殖标志物免疫荧光 RT2 Profiler PCR Array 检测Wnt通路基因 单细胞RNA测序(10X Genomics平台)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估Wnt5a缺失对苗勒管发育的影响
使用Wnt5a+/- 小鼠杂交获得Wnt5a-/- 胚胎,在18.5 dpc收集样本,观察生殖道形态并测量子宫角长度。
确定苗勒管发育缺陷是否由增殖减少或凋亡增加引起
通过免疫荧光染色检测增殖标志物PH3和凋亡标志物cleaved CASP3、H2AX。
鉴定Wnt5a调控的主要信号通路
使用RT2 Profiler PCR Array检测Wnt通路基因表达,并用实时PCR验证PCP通路基因。
在单细胞水平解析Wnt5a缺失对苗勒管细胞类型和分子机制的影响
对18.5 dpc子宫角进行单细胞RNA测序,鉴定细胞簇并分析差异表达基因。
验证Wnt5a-/- 前部子宫角是否转化为输卵管
通过免疫荧光检测输卵管标志物FOXL2在子宫前部的表达,并分析Hox基因表达变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 基因表达分析 | RNA保存液 | Invitrogen | -- |
| RNA提取 | RNAeasy微型试剂盒 | Qiagen | -- |
| 基因表达分析 | RT2 Profiler PCR芯片 | Qiagen | -- |
| 实时荧光定量PCR | SYBR Green PCR预混液 | Applied Biosystems | -- |
| cDNA合成 | 高效cDNA反转录试剂盒 | Applied Biosystems | -- |
| 实时荧光定量PCR | QuantStudio3实时荧光定量PCR系统 | Applied Biosystems | -- |
| 免疫荧光 | CDH1抗体 | BD Biosciences | 610182 |
| PH3抗体 | Abcam | 5176 | |
| LAMA抗体 | Sigma | L9393 | |
| PAX2抗体 | BioLegend | 901001 | |
| SMA抗体 | Sigma | A2547 | |
| CTNBB1抗体 | Millipore | 05-665 | |
| VIM抗体 | Abcam | 92547 | |
| JUN抗体 | Cell Signaling | 9165 | |
| FOS抗体 | Novus Biologicals | NBP1-89065 | |
| 磷酸化JUN抗体 | Abcam | ab32385 | |
| FOXL2抗体 | Novus Biologicals | NB100-1277 | |
| H2AX抗体 | Abcam | ab26350 | |
| 共聚焦显微镜 | Zeiss | -- | |
| 图像处理 | ImageJ | -- | -- |
| 单细胞RNA测序 | DMEM/F12培养基 | Stemcell | -- |
| 胶原酶 | -- | -- | |
| 透明质酸酶 | -- | -- | |
| 胰蛋白酶-EDTA | -- | -- | |
| 改良Hanks平衡盐溶液 | Stemcell | -- | |
| 脱氧核糖核酸酶I | Stemcell | -- | |
| 10X Genomics Chromium控制器 | 10X Genomics | -- | |
| 单细胞3'文库和凝胶微珠试剂盒v3.1 | 10X Genomics | PN-1000121 | |
| Chromium单细胞芯片G | 10X Genomics | PN-1000120 | |
| 文库质量控制 | Agilent BioAnalyzer 2100 | Agilent | -- |
| 高灵敏度DNA试剂盒 | Agilent | 5067-4626 | |
| 文库定量 | KAPA文库定量试剂盒 | KAPA Biosystems | KK4824 |
| Life Technologies ViiA 7实时荧光定量PCR仪 | Life Technologies | -- | |
| 单细胞RNA测序 | Illumina NextSeq-500 | Illumina | -- |
| Illumina NovaSeq 6000 | Illumina | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型 | Wnt5a-/- 小鼠的遗传背景(C57BL/6)、年龄(18.5 dpc) 阅读提示:2.1 Mouse Strains |
| 基因表达分析 | RNA提取方法、PCR阵列类型、参考基因(Tbp)、生物学重复数(3) 阅读提示:2.2 RNA Expression Analyses |
| 免疫荧光 | 抗体稀释比例、抗原修复方法、图像采集和量化方法 阅读提示:2.3 Histology and Immunofluorescence |
| 单细胞RNA测序 | 组织消化方法、目标细胞数、测序平台、数据分析参数(如fold change和FDR阈值) 阅读提示:2.4 Single-Cell RNA Sequencing, 2.5 Analysis of Single-Cell RNA Sequencing |