建立限菌小鼠模型
建立母体营养不足和不同供体微生物定植的小鼠模型,以研究其对后代生长的影响
将4周龄无菌小鼠从Taconic获得,过渡至M8饮食,3天后用健康(HD)或生长迟缓(SD)人婴儿粪便微生物灌胃,持续到8周。部分母鼠也暴露于M8饮食(MU组),部分母鼠未暴露(NMU组)。然后与雌鼠合笼,后代断奶时给M8饮食。
Maternal undernutrition exacerbates microbiota-driven growth stunting through pre- and postnatal effects
实验包含体外模型(限菌小鼠)、动物模型、饮食干预、交叉抚养、16S rRNA测序、组织学、蛋白定量等多层次验证,并明确功能验证(生长表型)和机制验证(微生物群与IGF-1)
限菌C57BL/6NTac小鼠 健康供体(HD)和生长迟缓供体(SD)人婴儿粪便微生物定植小鼠模型 母体营养不足(MU)与非母体营养不足(NMU)小鼠模型 交叉抚养小鼠模型
母体饮食暴露:M8饮食(低蛋白和微量营养素缺乏)与营养充足饮食(NS) 微生物定植:健康供体(HD)或生长迟缓供体(SD)粪便微生物灌胃 断奶后饮食:M8饮食或NS饮食 交叉抚养:出生后立即由HD或SD母鼠抚养 检测指标:尾长、体重、肝脏IGF-1、回肠组织形态学
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立母体营养不足和不同供体微生物定植的小鼠模型,以研究其对后代生长的影响
将4周龄无菌小鼠从Taconic获得,过渡至M8饮食,3天后用健康(HD)或生长迟缓(SD)人婴儿粪便微生物灌胃,持续到8周。部分母鼠也暴露于M8饮食(MU组),部分母鼠未暴露(NMU组)。然后与雌鼠合笼,后代断奶时给M8饮食。
评估母体营养不足对后代生长和存活的影响
记录后代存活率、尾长、体重,从出生至8周持续测量,并测量股骨长度。
评估肠道形态变化,以关联环境性肠功能障碍(EED)
取回肠组织固定、染色,进行组织学评分(肠上皮损伤和绒毛架构),并定量绒毛长度、肌层厚度、绒毛/隐窝比。
分析母体营养不足对后代肠道微生物组成的影响
提取粪便DNA,对V3-V4区域16S rRNA测序,进行α多样性和β多样性分析,比较不同组间的菌属丰度。
评估生长激素轴的变化
收集肝脏和血清,通过ELISA检测IGF-1水平,并归一化至总蛋白。
区分产前和产后微生物暴露对生长的影响
将无菌小鼠亲本不接触微生物,后代出生后立即交给HD或SD母鼠抚养,或让HD和SD母鼠的后代互换抚养,记录生长、微生物组和肠道形态。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 微生物定植 | L-半胱氨酸盐酸盐 | MilliporeSigma | C7880 |
| 甘油 | MilliporeSigma | G7893 | |
| 饮食准备 | Malawi-8饮食 | Dyets, Inc | M-8 |
| LabDiet 5021可高压锅消毒小鼠繁殖鼠粮 | LabDiet, Inc | RHI5021CGP | |
| 饮食无菌检测 | 脑心浸液 | BD Difco | 241830 |
| 营养肉汤 | BD Difco | 234000 | |
| 沙氏葡萄糖 | BD Difco | 210950 | |
| 羊血 | Thermo Fisher | R54016 | |
| 组织处理 | 中性缓冲福尔马林 | MilliporeSigma | HT501128 |
| 乙醇 | MilliporeSigma | 459844 | |
| 蛋白质提取 | HALT蛋白酶抑制剂混合物 | Thermo Fisher | 78429 |
| T-PER组织蛋白提取试剂 | Thermo Fisher | 78510 | |
| 裂解基质F管 | MP Biomedicals | 6540440 | |
| 蛋白质定量 | Pierce™ BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher | 23227 |
| ELISA检测 | 小鼠/大鼠IGF-I/IGF-1 DuoSet ELISA试剂盒 | R&D Systems | DY791 |
| TMB底物溶液 | R&D Systems | DY999 | |
| 硫酸 | MilliporeSigma | 339741 | |
| 96孔板 | Corning | 3599 | |
| Tecan酶标仪 | -- | -- | |
| DNA提取 | ZymoBIOMICS™ DNA小提试剂盒5 | Zymo Research | D4300 |
| DNA纯化 | Zymo-Spin™ III-HRC过滤器 | Zymo Research | C1058-50 |
| 16S文库制备 | Quick-16S试剂盒 | Zymo Research | D6421-PS1 |
| DNA定量 | Qubit™ 1×双链DNA宽范围定量试剂 | Thermo Fisher | Q33266 |
| 测量 | 数显卡尺 | Fisherbrand | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型建立 | 小鼠品系:C57BL/6NTac无菌小鼠;年龄:4周起始;饮食:M8饮食或NS饮食;微生物定植:HD或SD粪便灌胃;母体暴露:MU组母鼠4-8周喂M8饮食;NMU组母鼠不直接暴露。 阅读提示:STAR Methods: Gnotobiotic mice; Colonization and diets |
| 生长测量 | 尾长测量方法(活体使用卡尺,死后使用标尺);体重测量频率(每周);股骨长度测量方法。 阅读提示:STAR Methods: Histopathology and anthropometry |
| 肠道组织学 | 回肠组织固定、切片、H&E染色;组织学评分标准;量化参数(绒毛长度、肌层厚度、隐窝长度)。 阅读提示:STAR Methods: Histopathology and anthropometry; Figure 1F |
| 微生物组分析 | 粪便样本采集时间点;DNA提取方法;16S rRNA V3-V4区测序;生物信息学分析流程(Qiime2、Silva数据库、R包)。 阅读提示:STAR Methods: Microbial sequencing; Sequencing quality control |
| IGF-1检测 | 肝脏和血清样本采集;蛋白质提取方法;ELISA方法;归一化方法。 阅读提示:STAR Methods: Protein quantification |
| 交叉抚养实验 | 无菌亲本处理;新生儿转移时间;抚养母鼠类型;断奶时间。 阅读提示:STAR Methods: Gnotobiotic mice; Results: Postnatal microbiota exposure |