验证DISC1与PDZ-RhoGEF及活性RhoA的相互作用
确定DISC1是否影响PDZ-RhoGEF与GTP结合RhoA的关联,以及DISC1是否能与活性RhoA结合。
在HEK293T细胞中过表达Myc标签的DISC1和/或PDZ-RhoGEF,使用Rhotekin-RBD beads分离RhoA-GTP,并通过抗Myc抗体探测pull-down产物。同时,在HEK293T细胞和鼠脑组织(mPFC、海马)匀浆中检测内源性DISC1与RhoA-GTP的相互作用。
The Mechanisms by Which RhoA Activity and Associated Synaptic Effects Are Controlled by the DISC1 Scaffolding-Like Protein
包含体外生化实验(RhoA-GTP pull-down、结构域作图、亚细胞分级)、培养神经元形态学分析以及小鼠mPFC体内敲低实验等多个证据层级,并进行了功能与机制验证。
HEK293T细胞 原代培养皮层神经元 小鼠内侧前额叶皮层(mPFC)
HEK293T细胞中DISC1与PDZ-RhoGEF及活性RhoA的相互作用 PDZ-RhoGEF的PDZ和DH结构域对与DISC1结合和功能的重要性 培养皮层神经元中ΔPDZ构建体对树突棘密度和形态的增强效应 小鼠mPFC中AAV1介导的DISC1敲低对突触体P2组分中截短LIMK磷酸化的增强效应
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定DISC1是否影响PDZ-RhoGEF与GTP结合RhoA的关联,以及DISC1是否能与活性RhoA结合。
在HEK293T细胞中过表达Myc标签的DISC1和/或PDZ-RhoGEF,使用Rhotekin-RBD beads分离RhoA-GTP,并通过抗Myc抗体探测pull-down产物。同时,在HEK293T细胞和鼠脑组织(mPFC、海马)匀浆中检测内源性DISC1与RhoA-GTP的相互作用。
确定PDZ-RhoGEF上DISC1结合所需的关键区域。
在HEK293T细胞中共表达HA-DISC1和各种Myc标签的PDZ-RhoGEF截短构建体(全长、ΔPDZ、ΔPDZ-RGS、ΔPH、ΔDH-PH、ΔActin),通过免疫共沉淀评估各构建体与DISC1的结合能力。
确定DISC1结合对PDZ-RhoGEF膜定位和其激活RhoA能力的影响。
在HEK293T细胞中过表达全长或截短的PDZ-RhoGEF(±DISC1),进行亚细胞分级分离成膜和胞质部分,检测各构建体的分布。同时,使用RhoA-GTP pull-down assay评估各构建体激活RhoA的能力。
确定削弱DISC1结合(ΔPDZ)是否增强PDZ-RhoGEF对树突棘及树突形态的负面影响。
在成熟培养皮层神经元(DIV21-23)中转染GFP或GFP加全长PDZ-RhoGEF、ΔPDZ或ΔDH-PH构建体,4天后固定,进行免疫染色和共聚焦成像,利用NeuronStudio分析树突棘密度、形态及树突复杂度。
确定体内DISC1敲低是否增加RhoA下游信号通路的活性。
给小鼠双侧mPFC分别输注AAV1-scrambled shRNA或AAV1-DISC1 shRNA,6周后取脑,分离mPFC,进行亚细胞分级分离(WCL、S2、P2),通过Western blot检测DISC1水平及磷酸化LIMK(Thr505/Thr508)的水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养与转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | 11668027 |
| 细胞培养 | Neurobasal培养基 | Gibco | 21-103-049 |
| B-27补充剂 | Gibco | 17-504-044 | |
| 青霉素/链霉素 | Corning | 01-051-0 | |
| 药物处理 | DL-2-氨基-5-膦酰基戊酸(APV) | Fisher Scientific | 01-051-0 |
| 生化实验 | 蛋白酶/磷酸酶抑制剂混合物 | Fisher Scientific | PI78440 |
| 牛血清白蛋白 | Research Products International | A30075 | |
| 免疫染色 | 正常驴血清 | Jackson ImmunoResearch | 017-000-121 |
| RhoA激活检测 | 活性RhoA检测试剂盒 | Cytoskeleton | BK036 |
| 免疫共沉淀 | 免疫共沉淀试剂盒 | ThermoFisher | 26149 |
| Ras激活检测 | 活性Ras检测试剂盒 | Cytoskeleton | BK008 |
| Western blot | 抗肌动蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 4970 |
| 抗DISC1抗体 | GeneTex | GTX89158 | |
| 抗Myc标签抗体 | Cell Signaling Technology | 2276 | |
| 抗HA标签抗体 | Cell Signaling Technology | 3724 | |
| 抗PDZ-RhoGEF抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-166740 | |
| 抗RhoA抗体 | Cell Signaling Technology | 2117 | |
| 抗AF6/afadin抗体 | Cell Signaling Technology | 13531 | |
| 免疫染色 | 抗GFP抗体 | Aves Labs | GFP-1010 |
| Western blot | 抗磷酸化LIMK (Thr508)/LIMK2 (Thr505)抗体 | Cell Signaling Technology | 3841 |
| 抗LIMK1抗体 | Cell Signaling Technology | 3842 | |
| 抗微管蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 3873 | |
| 免疫染色 | 二抗 驴抗鸡AlexaFluor488 | Jackson ImmunoResearch | 703-545-155 |
| 动物实验 | C57BL/6J小鼠 | Jackson Laboratories | IMSR_JAX:000664 |
| 病毒注射 | AAV1 DISC1 shRNA | VectorBuilder | VB250402-1107xxw |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 蛋白相互作用实验 | 使用的细胞类型(HEK293T)、转染的构建体(全长或截短PDZ-RhoGEF、DISC1)、抗体(抗Myc、抗HA)、RhoA-GTP pull-down试剂盒(Cytoskeleton BK036) 阅读提示:Methods中Co-Immunoprecipitations、RhoA and Ras Activation Assay,以及Figure 1、2图注 |
| 亚细胞分级实验 | 分离的膜和胞质组分、检测的蛋白(DISC1、PDZ-RhoGEF、Actin、α-tubulin) 阅读提示:Methods中Subcellular fraction相关描述,以及Figure 3图注 |
| 培养神经元形态学实验 | 皮层神经元培养条件(E18大鼠)、转染时间(DIV21-23)、转染试剂(Lipofectamine 2000)、固定时间(转染后4天)、成像设备(Keyence BZ-X700E) 阅读提示:Methods中Primary Neuronal Transfection、Dendrite and dendritic spine imaging and analysis,以及Figure 4、5图注 |
| 体内敲低实验 | 小鼠品系(c57BL/6J)、年龄(12-16周)、注射病毒(AAV1-shRNA)、注射部位(mPFC)、分析时间(6周后)、亚细胞分级(WCL、S2、P2)及检测蛋白(DISC1、磷酸化LIMK) 阅读提示:Methods中Experimental mice及Statistics,以及Figure 6图注 |