生成β细胞特异性ATF6α敲除小鼠
建立体内模型以研究ATF6α在β细胞中的特异性作用。
通过将Atf6a floxed小鼠与RIP-Cre小鼠杂交,生成β细胞特异性Atf6a敲除小鼠(RIP-Cre;Atf6afl/fl),并通过PCR和qPCR确认敲除效率。
Activating Transcription Factor 6α Governs Stress-Adaptive Pancreatic β-Cell Mass Expansion by Coordinating Proliferation and Survival
包含体内基因敲除小鼠模型(HFD和妊娠)、体外细胞实验(siRNA敲低和过表达)以及单细胞转录组分析,并通过功能验证(增殖、凋亡)和机制验证(转录状态)支持结论。
β细胞特异性ATF6α敲除小鼠(RIP-Cre;Atf6a fl/fl) MIN6和MIN6Akita细胞系 高脂饮食和妊娠小鼠模型
ATF6α敲除效率(通过PCR和qPCR确认) 饮食模式和喂食时间(ND或HFD从6周龄开始) 免疫组化定量(BrdU、TUNEL、BCM)的样本量(n=3-5或n=4-6) 体外细胞处理(ATF6α siRNA或过表达质粒转染) 单细胞RNA-seq分析方法(聚类和伪时间分析)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立体内模型以研究ATF6α在β细胞中的特异性作用。
通过将Atf6a floxed小鼠与RIP-Cre小鼠杂交,生成β细胞特异性Atf6a敲除小鼠(RIP-Cre;Atf6afl/fl),并通过PCR和qPCR确认敲除效率。
评估ATF6α缺失对BCM扩增、β细胞增殖和凋亡的影响。
对ATF6αfl/fl和ATF6αβKO小鼠进行HFD喂食或诱导妊娠,通过免疫组化染色分析BCM、BrdU标记的增殖和TUNEL标记的凋亡。
在慢性ER应激的β细胞中验证ATF6α对增殖和凋亡的直接作用。
在MIN6和MIN6Akita细胞中通过siRNA敲低或质粒过表达Atf6a,检测增殖标记(Mki67、Pcna)、Ki-67阳性率、MTT增殖、TUNEL凋亡和cleaved caspase-3表达。
解析ATF6α对β细胞转录状态和增殖轨迹的影响。
从ATF6αfl/fl和ATF6αβKO小鼠(ND或HFD)分离胰岛,进行scRNA-seq,鉴定β细胞簇,进行聚类和伪时间分析。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | Atf6a 条件性敲除小鼠 | The Jackson Laboratory | -- |
| 细胞培养 | MIN6细胞 | -- | -- |
| MIN6Akita细胞 | -- | -- | |
| DMEM培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素 | -- | -- | |
| 链霉素 | -- | -- | |
| Lipofectamine 2000转染试剂 | -- | -- | |
| 葡萄糖代谢实验 | 胰岛素ELISA试剂盒 | -- | -- |
| 胰岛分离 | 胶原酶 | -- | -- |
| RNAlater保存液 | -- | -- | |
| 胰岛分泌实验 | Krebs-Ringer碳酸氢盐缓冲液 | -- | -- |
| 免疫组化 | BrdU(5-溴脱氧尿嘧啶核苷) | -- | -- |
| 胰岛素抗体 | -- | -- | |
| DAPI(4',6-二脒基-2-苯基吲哚) | -- | -- | |
| 凋亡检测 | TUNEL凋亡检测试剂盒 | -- | -- |
| Western blot | PVDF膜 | -- | -- |
| 脱脂牛奶 | -- | -- | |
| 增强化学发光检测试剂 | -- | -- | |
| MTT实验 | CellTiter 96非放射性细胞增殖检测试剂盒 | -- | -- |
| 单细胞RNA测序 | Accutase细胞分离液 | -- | -- |
| Chromium Next GEM单细胞5' v2试剂盒 | 10x Genomics | -- | |
| NovaSeq 6000测序仪 | Illumina | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型与饮食干预 | 小鼠品系(Atf6a floxed与RIP-Cre杂交)、饮食类型(ND或HFD)、从6周龄开始喂养、HFD脂肪含量(60 kcal%)、HFD持续周期(12或20周) 阅读提示:Methods: Animals, Glucose Metabolism; Figure 1和2图注 |
| 免疫组化分析 | BrdU给药方式(饮水1 mg/mL,4天)、胰腺取样时间(HFD 12或20周,妊娠GD14.5)、BCM计算公式、胰岛分析数量(>50个胰岛/鼠) 阅读提示:Methods: Immunohistochemistry; Figure 2图注 |
| 体外细胞实验 | 细胞系(MIN6和MIN6Akita)、培养条件(DMEM含25 mmol/L葡萄糖、10%FBS)、转染试剂(Lipofectamine 2000)、siRNA或过表达质粒浓度、处理时间 阅读提示:Methods: Cell Culture, Knockdown, and Overexpression Experiments; Figure 3图注 |
| 单细胞RNA测序 | 样本获取(胰岛分离、每个样本来自两只小鼠)、文库制备试剂盒(Chromium Next GEM Single Cell 5' v2)、测序平台(NovaSeq 6000)、质控标准(nFeature_RNA范围、线粒体基因比例) 阅读提示:Methods: scRNA-seq Analysis; Figure 4图注 |
| 统计设计 | 统计方法(Welch t test或ANOVA)、数据表示(mean ± SD)、显著性水平(P < 0.05) 阅读提示:Methods: Statistical Analysis |