分析GLUT1在肺癌中的表达及预后价值
评估GLUT1在肺癌组织中的表达及其与患者预后的关联,并探究其在肿瘤微环境细胞亚群中的分布。
利用GEPIA数据库分析SLC2A1表达及生存曲线;对GSE131907单细胞RNA-seq数据进行无监督聚类,鉴定成纤维细胞亚群并比较肿瘤与正常组织中的基因表达。
Cancer-associated fibroblast-derived extracellular vesicles loaded with GLUT1 inhibitor synergize anti-PD-L1 to suppress tumor growth via degrading matrix stiffness and remodeling tumor microenvironment
包含体外细胞实验(CAFs、LLC、NIH/3T3)、体内小鼠模型(皮下肿瘤)、流式细胞术、免疫荧光、单细胞RNA-seq及公共数据库分析,并进行了功能验证和机制验证,证据层级丰富。
小鼠皮下肿瘤模型(LLC+CAF) TGF-β诱导的CAF模型(NIH/3T3) 人肺腺癌组织样本 TCGA及scRNA-seq数据集(LUAD)
GLUT1抑制剂BAY-876的剂量(0.01-0.1 μM)和IC50值(CAFs 0.01022 μM,LLC 0.05033 μM) cEV-B6的给药剂量(低剂量20 μg/小鼠,高剂量40 μg/小鼠)和给药频率(每两天一次) 皮下肿瘤模型中LLC和CAF的接种量(2×10^5 LLC和1×10^5 CAF) 体外TGF-β诱导CAF的条件(10 ng/mL,24小时) 联合治疗中抗PD-L1的剂量(100 μg/小鼠,每两天一次)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估GLUT1在肺癌组织中的表达及其与患者预后的关联,并探究其在肿瘤微环境细胞亚群中的分布。
利用GEPIA数据库分析SLC2A1表达及生存曲线;对GSE131907单细胞RNA-seq数据进行无监督聚类,鉴定成纤维细胞亚群并比较肿瘤与正常组织中的基因表达。
验证GLUT1抑制剂BAY-876能否抑制CAFs和肿瘤细胞的代谢、降低细胞活性并逆转CAF活化表型。
TGF-β诱导NIH/3T3成纤维细胞为CAFs;用不同浓度BAY-876处理CAFs和LLC细胞,检测细胞活力、凋亡、GLUT1表达、乳酸分泌和葡萄糖消耗。
制备CAF来源的细胞外囊泡(cEVs)并负载GLUT1抑制剂BAY-876,表征其物理化学性质及细胞摄取能力。
通过血清饥饿和紫外照射诱导CAFs产生cEVs,超速离心分离cEVs和cEV-B6,用NTA、Zeta电位、透射电镜和Western blot表征,并用DiL标记检测细胞摄取。
检测cEV-B6对CAFs和肿瘤细胞的杀伤作用、代谢影响以及功能机制。
用不同浓度cEV-B6处理CAFs和LLC,检测细胞活力、凋亡、葡萄糖消耗和乳酸产生,并进行转录组分析。
评估cEV-B6在体内对肿瘤生长的抑制效果及其对肿瘤微环境的影响。
建立LLC和CAF共接种的皮下肿瘤模型,给予PBS、BAY-876、cEVs、低剂量和高剂量cEV-B6治疗,检测肿瘤体积、体重、GLUT1表达及CAF标志物。
探究cEV-B6与抗PD-L1联合治疗是否能增强抗肿瘤免疫并改善免疫抑制微环境。
在皮下肿瘤模型中给予cEV-B6和抗PD-L1联合治疗,监测肿瘤生长、体重和生理指标,分析免疫细胞浸润。
研究cEV-B6及联合治疗对肿瘤组织中免疫细胞亚群、功能状态和空间分布的影响。
流式细胞术分析DC、巨噬细胞、T细胞、NK细胞等亚群及功能分子;免疫荧光染色评估CD8+ T细胞浸润和αSMA、胶原I表达。
验证cEVs和cEV-B6在体内的肿瘤靶向性,并评估其系统性毒性。
用DiR标记cEVs和cEV-B6,活体成像观察其在肿瘤和主要器官的分布;检测主要脏器H&E染色和血清生化指标。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco BRL/Life Technologies | -- |
| RPMI 1640培养基 | Gibco BRL/Life Technologies | -- | |
| 胎牛血清 | Newzerum | -- | |
| 转化生长因子-β | Peprotech | -- | |
| 粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子 | Peprotech | -- | |
| 白细胞介素-2 | Peprotech | -- | |
| 白细胞介素-4 | Peprotech | -- | |
| 药物处理 | BAY-876 | -- | -- |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂 | Biosharp | BS350B |
| 细胞凋亡检测 | 钙黄绿素-AM/碘化丙啶 | Beyotime | C2015S |
| 膜联蛋白V-FITC/碘化丙啶 | Yeason | 40302ES60 | |
| Western blot | 抗αSMA抗体 | Proteintech | 14395-1-AP |
| 抗FAP抗体 | Affinity | AF0739 | |
| 抗GLUT1抗体 | Proteintech | 66290-1-Ig | |
| 抗GAPDH抗体 | Proteintech | 60004-1-Ig | |
| 抗CD63抗体 | Affinity | AF5117 | |
| 抗TSG101抗体 | Proteintech | 28283-1-AP | |
| 抗EpCAM抗体 | Proteintech | 21050-1-AP | |
| 抗β-微管蛋白抗体 | Proteintech | 10094-1-AP | |
| RT-qPCR | RNAiso Plus | Takara | 9109 |
| cDNA合成试剂盒 | Vazyme | R23301 | |
| 代谢检测 | 葡萄糖检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | A154-1-1 |
| 乳酸检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | A019-2-1 | |
| 细胞系 | NIH/3T3细胞系 | Procell life Science & Technology | CL-0171 |
| LLC细胞系 | American Type Culture Collection | CRL-1642 | |
| 免疫荧光染色 | 牛血清白蛋白 | Servicebio | G5001-100G |
| 流式分析 | 抗PD-L1抗体 | MCE | HY-P99145 |
| 体内成像 | DiR荧光染料 | AAT Bioquest | 100068-60-8 |
| 流式分析 | CD45抗体 | Biolegend | 103115 |
| CD11b抗体 | Biolegend | 101237 | |
| CD80抗体 | Biolegend | 104708 | |
| CD86抗体 | Biolegend | 105012 | |
| F4/80抗体 | Biolegend | 123110 | |
| CD206抗体 | Biolegend | 141720 | |
| 佛波醇12-肉豆蔻酸酯13-乙酸酯 | Solarbio | P6741-1mg | |
| 离子霉素 | Aladdin | 1139530-1mg | |
| CD3e抗体 | Biolegend | 100326 | |
| CD4抗体 | Biolegend | 100406 | |
| CD8抗体 | Biolegend | 100751 | |
| NK1.1抗体 | Biolegend | 156525 | |
| FOXP3抗体 | Biolegend | 126404 | |
| IFN-γ抗体 | Biolegend | 505839 | |
| 颗粒酶B抗体 | Biolegend | 372215 | |
| 组织消化 | IV型胶原酶 | Solarbio | C810-100mg |
| 透明质酸酶 | Solarbio | H8030-100mg |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养和CAF诱导 | NIH/3T3细胞培养条件、TGF-β浓度和刺激时间、CAF和LLC细胞系来源(需核对Procell和ATCC货号) 阅读提示:Materials and methods - Cell culture; Immunofluorescence staining |
| 体外GLUT1抑制实验 | BAY-876浓度范围(0.01-0.1 μM)、处理时间(24 h)、细胞密度(CAFs/NIH-3T3 5000细胞/孔,LLC 8000细胞/孔) 阅读提示:Materials and methods - Cell viability assay; Results - Inhibition of GLUT1 results in deactivated metastasis and normalization of CAFs phenotype |
| cEV和cEV-B6的制备 | 血清饥饿条件、BAY-876浓度(100 nM)、紫外照射剂量和时间(300 J/m²,30 min)、超速离心参数(800 rpm 10 min, 2000×g 30 min, 16,000×g 60 min) 阅读提示:Materials and methods - Preparation of cEVs and cEV-B6 |
| cEV-B6的体内给药 | 皮下肿瘤模型建立(LLC 2×10^5,CAF 1×10^5)、给药剂量(cEVs 20 μg/小鼠,cEV-B6低剂量20 μg/小鼠,高剂量40 μg/小鼠,BAY-876 0.03 mg/小鼠)、给药频率(每两天一次,共5次) 阅读提示:Materials and methods - The therapeutic effectiveness of cEV-B6 in vivo models; Figure 4F |
| 联合免疫治疗 | 抗PD-L1剂量(100 μg/小鼠)、给药开始时间(第三次干预时)、给药频率(每两天一次,共3次) 阅读提示:Materials and methods - The therapeutic effectiveness of cEV-B6 in vivo models; Figure 5A |
| 肿瘤组织免疫细胞分析 | 组织消化方法(胶原酶IV和透明质酸酶浓度)、染色抗体克隆号及浓度、刺激条件(PMA和ionomycin浓度) 阅读提示:Materials and methods - Flow cytometry landscape of immune cells in tumor tissue after different treatment |