患者样本分析
评估iNOA患者睾丸组织中铁死亡、自噬和血睾屏障的状态。
收集iNOA和OA患者睾丸活检组织,进行HE染色、TEM、RNA-seq和铁水平检测。
RAB3IL1: a key regulator in the autophagy-ferroptosis axis of male infertility†
包含患者样本分析、体外细胞模型、体内动物模型及转录组学等多层级证据,并进行了功能验证和机制验证。
睾丸组织样本(iNOA和OA患者) TM4小鼠支持细胞系 C57BL/6小鼠模型
TM4细胞用6.4 μM erastin处理48小时 小鼠腹腔注射20 mg/kg erastin,持续7天 3-MA浓度:体外120 μM,体内30 mg/kg 患者睾丸组织样本量为iNOA和OA各3例 动物实验每组6只小鼠
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估iNOA患者睾丸组织中铁死亡、自噬和血睾屏障的状态。
收集iNOA和OA患者睾丸活检组织,进行HE染色、TEM、RNA-seq和铁水平检测。
验证erastin能否在小鼠支持细胞中诱导铁死亡。
用erastin处理TM4细胞,检测细胞活力、铁离子水平、脂质过氧化、GPX4活性及超微结构。
探究自噬在erastin诱导的铁死亡中的作用。
使用自噬抑制剂3-MA处理TM4细胞,检测铁死亡和自噬标志物变化。
评估铁死亡对支持细胞细胞骨架和血睾屏障蛋白的影响。
通过免疫荧光和Western blot检测细胞骨架和BTB相关蛋白。
验证erastin诱导的铁死亡对小鼠睾丸功能的影响及3-MA的保护作用。
小鼠腹腔注射erastin和/或3-MA,进行组织学、精子参数、激素水平和BTB完整性分析。
鉴定参与铁死亡的关键调控分子并验证其机制。
对患者睾丸和TM4细胞RNA-seq数据进行联合分析,筛选候选基因,并通过siRNA敲低和过表达验证RAB3IL1对SLC7A11的调控。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM/F-12培养基 | Procell | -- |
| 胎牛血清 | TianHang Biotechnology | -- | |
| 药物处理 | Erastin | MedChemExpress | HY-15763 |
| Ferrostatin-1 | MedChemExpress | HY-100579 | |
| 3-甲基腺嘌呤 | Selleck Chemical | S2767 | |
| 铁水平检测 | 铁检测试剂盒 | Dojindo | I291 |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | Dojindo | CK04 |
| 细胞内Fe2+检测 | FerroOrange | Dojindo | F374 |
| 脂质过氧化检测 | C11-BODIPY (581/591) | Molecular Probes, Invitrogen | -- |
| GPX4活性检测 | GPX4活性检测试剂盒 | Solarbio | BC6265 |
| 自噬通量检测 | mCherry-GFP-LC3B腺病毒 | Beyotime | C3006 |
| RNA-seq | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| NEBNext Ultra RNA文库制备试剂盒 | NEB | #E7530L | |
| 细胞转染 | Lipofectamine 3000 | Thermo Fisher | -- |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | -- |
| 增强型BCA蛋白检测试剂盒 | Beyotime | -- | |
| SDS-PAGE上样缓冲液 | Beyotime | -- | |
| 抗GAPDH抗体 | Proteintech | 10494-1-AP | |
| 抗SLC7A11抗体 | abcam | ab307601 | |
| 抗HO-1抗体 | Proteintech | 10701-1-AP | |
| 抗GPX4抗体 | Proteintech | 67763-1-Ig | |
| 抗FTH1抗体 | Abclonal | A19544 | |
| 抗FTL抗体 | Proteintech | 10727-1-AP | |
| 抗P62抗体 | Proteintech | 18420-1-AP | |
| 抗Beclin1抗体 | Proteintech | 11306-1-AP | |
| 抗LC3B抗体 | Proteintech | 14600-1-AP | |
| 抗N-钙黏蛋白抗体 | Abclonal | A19083 | |
| 抗p (Tyr407) FAK抗体 | Baijia | IPH0674 | |
| 抗p (Tyr397) FAK抗体 | Baijia | IPH0673 | |
| 抗FAK抗体 | Abclonal | A21578 | |
| 抗β-连环蛋白抗体 | Abclonal | A20221 | |
| 抗Occludin抗体 | Proteintech | 13409-1-AP | |
| 抗Connexin43抗体 | Abclonal | A11752 | |
| 抗NUDC抗体 | Baijia | IPB4922 | |
| 抗PDLIM1抗体 | Proteintech | 11674-1-AP | |
| RT-qPCR | HiScript III RT SuperMix for qPCR (+gDNA wiper) | Vazyme | R323-01 |
| SYBR Green RT-qPCR预混液 | Vazyme | Q111-C1 | |
| StepOnePlus实时荧光定量PCR系统 | Applied Biosystems | -- | |
| 免疫荧光 | 抗SOX9抗体 | Abclonal | A19710 |
| 抗Connexin43抗体 | Abclonal | A23928PM | |
| Alexa Fluor 568偶联链霉亲和素 | -- | -- | |
| DAPI | -- | -- | |
| 鬼笔环肽 | -- | -- | |
| 动物实验 | 生物素 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 患者样本收集 | 样本量:iNOA和OA各3例睾丸组织;精液样本:健康供体28例、OAT 11例、iNOA 10例 阅读提示:见Materials and methods 'Patients and sample collection' |
| 细胞培养与铁死亡诱导 | TM4细胞用erastin 6.4 μM处理48小时;DMSO浓度<0.1% 阅读提示:见Materials and methods 'Cell lines and cell culture' |
| 自噬抑制处理 | 3-MA浓度:体外120 μM,体内30 mg/kg 阅读提示:见Materials and methods 'Cell lines and cell culture'及'Animal experiments' |
| 动物实验 | 小鼠品系C57BL/6,雄性和7周龄,体重20-23g;每组6只;erastin剂量20 mg/kg,腹腔注射,连续7天 阅读提示:见Materials and methods 'Animal experiments' |
| 血睾屏障完整性检测 | 生物素示踪法:10 mg/mL生物素溶液,注射50 μL,扩散30分钟 阅读提示:见Materials and methods 'Blood-testis barrier integrity assay' |
| 转录组测序 | DEGs筛选标准:|log2FC|≥1且q<0.05 阅读提示:见Materials and methods 'RNA-sequencing' |