患者组织乳酸化水平分析
比较新辅助奥希替尼治疗与否的LUAD组织中整体乳酸化水平差异
收集手术联合或不联合新辅助奥希替尼的晚期EGFR突变LUAD患者组织,用抗Klac免疫荧光和Western blot检测乳酸化水平。
A tumor-derived lactate/ENO1 lactylation feedback loop facilitates osimertinib resistance of lung adenocarcinoma
包含患者组织蛋白质组学、细胞耐药模型、体外功能与机制验证(Co-IP、siRNA、抑制剂)及体内原位异种移植模型,具备多层级验证。
临床LUAD组织(EGFR突变患者) 奥希替尼耐药LUAD细胞系HCC827R/PC-9R PC-9R原位异种移植小鼠模型
患者样本:EGFR突变晚期LUAD患者,接受手术联合或不联合新辅助奥希替尼 细胞模型:HCC827R和PC-9R(长期奥希替尼刺激建立) 乳酸处理:10 mM乳酸/乳酸钠处理24小时 缺氧处理:5% CO2和0.1% O2,12小时 体内模型:PC-9R-luc原位注射至BALB/c裸鼠肺实质,肿瘤体积达200 mm³后给药
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
比较新辅助奥希替尼治疗与否的LUAD组织中整体乳酸化水平差异
收集手术联合或不联合新辅助奥希替尼的晚期EGFR突变LUAD患者组织,用抗Klac免疫荧光和Western blot检测乳酸化水平。
验证奥希替尼耐药细胞中乳酸化和ENO1乳酸化水平的变化
通过长期奥希替尼刺激建立HCC827R和PC-9R耐药细胞,用CCK-8测定IC50,并检测Klac和ENO1乳酸化水平。
验证乳酸是否直接诱导ENO1乳酸化并影响奥希替尼敏感性
用乳酸/乳酸钠处理或缺氧处理,并用草氨酸抑制内源性乳酸产生,检测ENO1乳酸化及IC50变化。
验证MCT1介导乳酸摄取和p300/CBP催化ENO1乳酸化
用CHC抑制MCT或siRNA敲低MCT1,用C646抑制p300/CBP或siRNA敲低p300/CBP,检测ENO1乳酸化变化。
验证ENO1是否介导代谢重编程和乳酸产生,并与关键代谢酶相互作用
用siRNA或ENO1单抗抑制ENO1,检测OCR、葡萄糖浓度和LDH活性,并通过Co-IP检测与PKM1、PKM2、LDHB、MDH2的相互作用。
验证靶向抑制乳酸/ENO1乳酸化反馈环路能否改善体内奥希替尼耐药
将表达荧光素酶的PC-9R细胞原位注射至裸鼠肺实质,建立耐药模型,给予奥希替尼、草氨酸、ENO1单抗或联合治疗,评估肿瘤生长和生存。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | BasalMedia | L110KJ |
| 胎牛血清 | Hyclone | RL09136 | |
| 青霉素-链霉素 | Sangon Biotech | B540732 | |
| L-乳酸 | Sigma-Aldrich | -- | |
| L-乳酸钠 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 草氨酸 | -- | -- | |
| α-氰基-4-羟基肉桂酸 | Sigma-Aldrich | -- | |
| C646 | Sigma-Aldrich | -- | |
| ENO1特异性单克隆抗体 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | -- | -- |
| 免疫荧光 | DAPI | Beyotime | C1002 |
| 抗乳酸化赖氨酸抗体 | Abcam | ab187179 | |
| 抗ENO1抗体 | Abcam | ab190365 | |
| Cy3标记二抗 | Proteintech | SA00009-2 | |
| FITC标记二抗 | Proteintech | SA00003-1 | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013B |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Biosharp | BL521A | |
| PVDF膜 | Millipore | IPVH00010 | |
| HRP标记二抗 | ZSGB-BIO | ZB2301 or ZB2305 | |
| 化学发光检测系统 | Dingguo Changsheng | ECL-0011 | |
| 抗乳酸化赖氨酸抗体 | Jingjie PTM Bio | PTM-1401RM | |
| 抗组蛋白H3抗体 | Proteintech | 68345-1-Ig | |
| 抗β-actin抗体 | Proteintech | 81115-1-RR | |
| 抗PKM1抗体 | Proteintech | 15821-1-AP | |
| 抗PKM2抗体 | Proteintech | 15822-1-AP | |
| 抗LDHB抗体 | Proteintech | 14824-1-AP | |
| 抗MDH2抗体 | Proteintech | 15462-1-AP | |
| 蛋白A/G琼脂糖珠 | -- | -- | |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | Dojindo | CK04 |
| 奥希替尼 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 蛋白质组学 | 胰蛋白酶 | -- | -- |
| 二硫苏糖醇 | -- | -- | |
| Strata X SPE柱 | -- | -- | |
| C18 ZipTips | Millipore | -- | |
| Easy-nLC1000超高效液相色谱系统 | Bruker Daltonics | -- | |
| timsTOF Pro质谱仪 | Bruker | -- | |
| 耗氧率检测 | Seahorse XF24细胞外通量分析仪 | Seahorse Bioscience | -- |
| XF24 V7多孔板 | -- | -- | |
| 葡萄糖浓度检测 | 葡萄糖检测试剂盒 | Beyotime | S0201S |
| LDH活性检测 | LDH活性检测试剂盒 | Elabscience | E-BC-K046-M |
| 动物实验 | BALB/c裸鼠 | Sibeifu Biotechnology | -- |
| 草氨酸钠 | -- | -- | |
| Bruker In-Vivo Xtreme II成像系统 | Bruker | -- | |
| 免疫组织化学 | 抗Ki67抗体 | Proteintech | 27309-1-AP |
| 抗LDHB抗体 | Proteintech | 14824-1-AP |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 患者样本分析 | 纳入标准:EGFR突变晚期LUAD患者;新辅助奥希替尼有效(部分或完全缓解);每组例数(n=10) 阅读提示:Materials and methods: Patient samples; Figure legends Fig. 1 |
| 耐药细胞模型建立 | 细胞系(HCC827和PC-9);奥希替尼刺激浓度和时间(长期) 阅读提示:Materials and methods: Cell culture and treatment; Figure legend Fig. 1E |
| 乳酸处理 | 乳酸和乳酸钠浓度(10 mM);处理时间(24小时) 阅读提示:Materials and methods: Cell culture and treatment; Figure legend Fig. 3F |
| 缺氧处理 | 氧气浓度(0.1%);CO2浓度(5%);处理时间(12小时) 阅读提示:Materials and methods: Cell culture and treatment; Figure legend Fig. 3A |
| MCT抑制 | CHC浓度(3 mM);处理时间(2小时);si-MCT1转染浓度(10 nM)和时间(24小时) 阅读提示:Materials and methods: Cell culture and treatment; Transfection; Figure legend Fig. 4A |
| p300/CBP抑制 | C646浓度(5 µM);处理时间(2小时);si-p300/si-CBP转染条件 阅读提示:Materials and methods: Cell culture and treatment; Transfection; Figure legend Fig. 4E-I |
| ENO1抑制 | si-ENO1浓度(10 nM)和处理时间(24小时);ENO1 mAb浓度(100 μg/ml)和处理时间(6小时) 阅读提示:Materials and methods: Cell culture and treatment; Transfection; Figure legend Fig. 5 |
| 细胞活力检测 | 细胞接种密度(2×10^4/孔);奥希替尼处理时间(24小时);CCK-8孵育时间(2小时);检测波长(450 nm) 阅读提示:Materials and methods: Cell viability assay |
| 体内动物模型 | 细胞数量(5×10^5);注射部位(肺实质);小鼠品系(BALB/c裸鼠);起始治疗肿瘤体积(200 mm³);给药途径和剂量(奥希替尼5 mg/kg每日灌胃;草氨酸钠300 mg/kg每日腹腔;ENO1 mAb 20 mg/kg每周两次静脉);治疗时长(4周) 阅读提示:Materials and methods: In vivo orthotopic xenograft models; Figure legend Fig. 6 |