建立基因工程髓母细胞瘤小鼠模型并实施放疗
在小鼠原位模型中评估FLASH和标准质子束放疗的肿瘤控制效果。
利用Math1-Cre;SmoM2小鼠诱导髓母细胞瘤,使用小动物放疗平台立体定向输送FLASH(~100 Gy/s)或标准(0.7 Gy/s)质子束,照射10 Gy,监测生存。
FLASH radiation reprograms lipid metabolism and macrophage immunity and sensitizes medulloblastoma to CAR-T cell therapy
包含基因工程小鼠肿瘤模型、体外巨噬细胞极化实验、单细胞和批量RNA测序、流式细胞术、CAR-T细胞治疗实验等多个独立证据层级,并有功能验证和机制验证。
Math1-Cre;SmoM2基因工程小鼠髓母细胞瘤模型 小鼠骨髓来源巨噬细胞 人PBMC来源巨噬细胞 GL261同基因小鼠胶质瘤模型
辐射剂量率:FLASH约100 Gy/s,标准0.7-0.9 Gy/s;细胞5 Gy,小鼠10 Gy 肿瘤模型:Math1-Cre;SmoM2基因工程小鼠,SmoM2为SmoW539L突变 巨噬细胞极化诱导:LPS 100 ng/ml(M1)或IL-4 20 ng/ml(M2)处理2天 CAR-T细胞治疗:GD2 CAR-T细胞静脉注射5×10^6个细胞/只,照射后5天给药
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
在小鼠原位模型中评估FLASH和标准质子束放疗的肿瘤控制效果。
利用Math1-Cre;SmoM2小鼠诱导髓母细胞瘤,使用小动物放疗平台立体定向输送FLASH(~100 Gy/s)或标准(0.7 Gy/s)质子束,照射10 Gy,监测生存。
比较FLASH和标准放疗对肿瘤免疫细胞组成和功能的影响。
通过单细胞RNA测序和流式细胞术分析肿瘤中巨噬细胞、T细胞等免疫细胞的变化。
在体外直接评估FLASH辐射对巨噬细胞极化和功能的影响。
从小鼠骨髓和人PBMC诱导巨噬细胞,照射5 Gy(FLASH或标准),再用LPS或IL-4诱导M1/M2极化,通过流式、RT-PCR、ELISA检测表型和细胞因子,并与T细胞共培养检测T细胞功能。
阐明FLASH辐射影响PPARγ活性和精氨酸酶1表达的机制。
检测ROS生成、PPARγ活性、oxLDL水平、脂质氧化酶表达,并使用ROS清除剂验证ROS依赖机制。
验证FLASH放疗能否增强GD2 CAR-T细胞对髓母细胞瘤的治疗效果。
在髓母细胞瘤模型中,先照射(FLASH或标准)再注射GD2 CAR-T细胞,监测生存、CAR-T浸润及功能。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | Life Technologies | -- |
| 细胞因子处理 | 重组小鼠CSF1 | PeproTech | 315-02 |
| 脂多糖 | Sigma-Aldrich | LPS25 | |
| 重组小鼠IL-4 | BioLegend | 574302 | |
| 药物处理 | TEMPO | Targetmol | T5363 |
| DMTU | Targetmol | T40615 | |
| 单细胞RNA测序 | 胶原酶II | Invitrogen | 17101-015 |
| 脱氧核糖核酸酶 | Sigma-Aldrich | D4527 | |
| 10x Genomics Chromium单细胞3' v3试剂盒 | 10x Genomics | -- | |
| CellRanger | 10x Genomics | -- | |
| Seurat | -- | -- | |
| 批量RNA测序 | TRIzol试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| RNeasy Plus微型试剂盒 | QIAGEN | 74136 | |
| TruSeq mRNA链特异性试剂盒 | Illumina | -- | |
| RNA Nano芯片 | Agilent | -- | |
| RNA Pico芯片 | Agilent | -- | |
| DNA Nano芯片 | Agilent | -- | |
| 2100生物分析仪 | Agilent | -- | |
| NovaSeq测序仪 | -- | -- | |
| Kallisto | -- | -- | |
| tximport | -- | -- | |
| EdgeR | -- | -- | |
| 细胞培养 | ACK裂解缓冲液 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 胎牛血清 | Life Technologies | -- | |
| 巨噬细胞分化 | 重组人CSF1 | BioLegend | 574806 |
| 巨噬细胞极化 | 重组人IL-4 | Peprotech | 200-04 |
| T细胞共培养 | CFSE | BioLegend | 423801 |
| 流式细胞术 | 抗小鼠CD3抗体 | BioLegend | 100203/100233 |
| 抗小鼠CD4抗体 | BioLegend | 100540 | |
| 抗小鼠CD8a抗体 | BioLegend | 100706/100708/100733 | |
| 抗小鼠CD45抗体 | BioLegend | 103133/103134 | |
| 抗小鼠F4/80抗体 | BioLegend | 123107 | |
| 抗小鼠CD206抗体 | BioLegend | 141719 | |
| 抗小鼠CD80抗体 | BioLegend | 104713, 375403 | |
| 抗小鼠CD86抗体 | BioLegend | 105005 | |
| 抗小鼠CD86抗体 | Miltenyi Biotec | 130-102-604 | |
| 抗小鼠IFNγ抗体 | BioLegend | 505825 | |
| 抗小鼠颗粒酶B抗体 | BioLegend | 372211 | |
| 抗小鼠Ki67抗体 | Thermo Fisher Scientific | 17-5698-80 | |
| 抗小鼠LAG3抗体 | eBioscience | 11-2231-80 | |
| 抗小鼠LAG3抗体 | BioLegend | 125225/125209 | |
| 抗小鼠PD1抗体 | BioLegend | 135223 | |
| 抗小鼠Tim3抗体 | BioLegend | 134009 | |
| 抗小鼠CD11b抗体 | BioLegend | 101206/101212 | |
| 抗人CD206抗体 | BioLegend | 321109 | |
| 抗小鼠NK1.1抗体 | BioLegend | 156505 | |
| 抗小鼠TMEM119抗体 | Thermo Fisher Scientific | 25-6119-80 | |
| 抗人CD25抗体 | BioLegend | 101915/302610 | |
| 抗人GD2抗体 | BioLegend | 357324 | |
| FACSCanto II流式细胞仪 | BD Biosciences | -- | |
| FlowJo软件 | -- | -- | |
| RT-PCR | SuperScript III第一链合成系统 | Thermo Fisher Scientific | 12574026 |
| powerSYBR Green PCR预混液 | Applied Biosystems | 4367659 | |
| QuantStudio 6 Flex实时PCR系统 | Applied Biosystems | -- | |
| ROS检测 | 细胞ROS检测试剂盒 | Abcam | ab113851 |
| ELISA | 蛋白定量试剂盒 | Bio-Rad | 5000006 |
| 小鼠PPARγ ELISA试剂盒 | Biorbyt | orb775497 | |
| 人PPARγ ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-H1361 | |
| 小鼠oxLDL试剂盒 | Biorbyt | orb782036 | |
| 人oxLDL试剂盒 | Elabscience | E-EL-H6021 | |
| 小鼠TNF ELISA试剂盒 | Proteintech | KE10002 | |
| 小鼠IL-1β ELISA试剂盒 | Proteintech | KE10003 | |
| Synergy H4多功能酶标仪 | BioTek | -- | |
| 转录因子活性检测 | 转录因子活性谱芯片 | Signosis | FA-1102 |
| 免疫印迹 | NP-40裂解缓冲液 | -- | -- |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Roche | 11697498001 | |
| 4-20%预制SDS-PAGE凝胶 | Bio-Rad | 456-1094 | |
| 抗精氨酸酶1抗体 | Santa Cruz | sc-20150 | |
| 抗GAPDH抗体 | Cell Signaling | 5174 | |
| HRP标记的二抗 | Bio-Rad | -- | |
| 增强化学发光显色试剂 | GE Healthcare | RPN2232 | |
| ChemiDoc成像系统 | Bio-Rad | -- | |
| 免疫荧光 | 抗原修复液 | DAKO | S1699 |
| 抗GD2抗体 | BioLegend | 357302 | |
| Alexa Fluor 488标记IgG | Life Technologies | -- | |
| Axio Imager显微镜 | Zeiss | -- | |
| AxioCam 506单色CCD相机 | Zeiss | -- | |
| 统计 | Prism软件 | GraphPad | -- |
| CAR-T细胞制备 | gentleMACS组织处理器 | Miltenyi Biotech | -- |
| 70µm无菌过滤器 | NETA | 410-0002-OEM | |
| EasySep小鼠T细胞分离试剂盒 | StemCell | 19851 | |
| 抗CD3ε抗体 | BioLegend | 100302 | |
| 抗CD28抗体 | BioLegend | 102102 | |
| 重组人IL-2 | Peprotech | 212-12 | |
| Retronectin重组人纤连蛋白片段 | Takara | T100A | |
| Lipofectamine 2000转染试剂 | Life Technologies | 11668-019 | |
| 生物素化蛋白L | Life Technologies | 29997 | |
| 放疗 | 回旋加速器产生的230 MeV质子束 | IBA | -- |
| EBT3胶片 | Ashland Advanced Materials | -- | |
| Advanced Markus电离室 | PTW Freiburg | -- | |
| 示波器 | Tektronix | -- | |
| 动物实验 | C57/B6小鼠 | Jackson laboratory | -- |
| 腔肠素 | Furimazine | -- | |
| GL261胶质瘤细胞 | PerkinElmer | 134246 | |
| 荧光素 | GoldBio | -- | |
| IVIS 200 Spectrum成像系统 | -- | -- | |
| 含EDTA的PBS | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 放疗 | 质子束剂量、剂量率(FLASH约100 Gy/s,标准0.7 Gy/s)、照射方式、细胞/小鼠的剂量 阅读提示:Methods:Stereotactic RT |
| 巨噬细胞极化 | 巨噬细胞来源、LPS和IL-4浓度、处理时间、照射剂量 阅读提示:Methods:Mouse and human Mϕ isolation and treatment |
| CAR-T细胞治疗 | CAR-T细胞类型、输注细胞数量、输注时间、放疗与CAR-T的间隔 阅读提示:Methods:CAR-T cells;Animal model and treatment;Figure 6a |
| 生存分析 | 样本量、统计方法、终点时间 阅读提示:Methods:Statistics and reproducibility;Figure 1b, 6b |
| 单细胞RNAseq | 组织消化酶、细胞过滤、建库试剂盒、测序平台、数据分析软件及版本 阅读提示:Methods:Single-cell RNAseq |