建立AD复发小鼠模型并评估KG预防效果
建立模拟AD复发的动物模型,并验证KG处理是否具有预防复发的作用。
使用MC903诱导AD复发模型,小鼠经过初始12天MC903处理,14天停药恢复期,再连续7天MC903激发。KG组在初始治疗期外用KG乳膏。评估耳厚度、EASI评分、表皮厚度,并通过免疫组化检测CD3、NF-κB p50、TSLP表达。
Retracing from Outcomes to Causes: NRF2-Driven GSTA4 Transcriptional Regulation Controls Chronic Inflammation and Oxidative Stress in Atopic Dermatitis Recurrence
包含MC903诱导的AD复发小鼠模型、体外细胞过表达实验、临床样本验证、转录组测序、双荧光素酶报告基因和ChIP实验,涵盖体内体外多个证据层级并进行功能与机制验证。
MC903诱导的AD复发小鼠模型(C57BL/6小鼠,6-8周龄,雄性) NHEK细胞(正常人表皮角质形成细胞) HaCaT细胞(人永生化角质形成细胞) 293T细胞(用于双荧光素酶报告基因实验)
KG处理对复发模型小鼠的剂量:2.5 mg/耳,外用 MC903诱导复发模型:2 nmol MC903溶于20 μl无水乙醇,每日一次,采用5天-2天间歇-5天方案,之后停药14天,再连续7天激发 TSLP刺激浓度和时间:100 ng/ml,48小时 用于ChIP的NRF2抗体:anti-NRF2 (Cell Signaling Technology, 12721)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立模拟AD复发的动物模型,并验证KG处理是否具有预防复发的作用。
使用MC903诱导AD复发模型,小鼠经过初始12天MC903处理,14天停药恢复期,再连续7天MC903激发。KG组在初始治疗期外用KG乳膏。评估耳厚度、EASI评分、表皮厚度,并通过免疫组化检测CD3、NF-κB p50、TSLP表达。
通过比较复发模型和KG治疗组的基因表达,寻找与AD复发相关的关键通路和靶点。
取第34天耳部皮肤进行RNA-seq,筛选DEGs(P < 0.05, |log2FC| > 0.58),进行KEGG通路富集和GSEA分析。
验证GSTA4在AD复发中的表达变化及其与氧化应激的关系。
通过Western blot检测GSTA家族蛋白表达,IHC检测临床样本GSTA4表达,DHE染色检测小鼠耳部皮肤ROS水平。
在细胞水平验证GSTA4过表达对AD样炎症和ROS的影响。
在NHEK和HaCaT细胞中通过慢病毒感染建立GSTA4过表达稳定株,用TSLP刺激模拟AD炎症,检测Th2细胞因子(IL4, IL13)、TSLP的表达,ROS水平以及炎症信号蛋白(p-ERK, p-STAT1, p-STAT3)的表达。
探究NRF2是否直接调控GSTA4转录,以及KG是否影响这一调控。
通过数据库预测和相关性分析筛选转录因子,使用双荧光素酶报告基因实验和ChIP实验验证NRF2与GSTA4启动子结合,并检测KG处理对启动子活性的影响。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物模型建立 | 卡泊三醇 | MedChemExpress | -- |
| 哈西奈德 | Sinopharm Sanyi | -- | |
| 细胞培养 | EMEM培养基 | Cytiva | SH30024.01 |
| DMEM培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| 聚凝胺 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 嘌呤霉素 | -- | -- | |
| 细胞处理 | 胸腺基质淋巴细胞生成素 | -- | -- |
| 苦甘醇提物 | -- | -- | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Ambion | -- |
| Western blot | 抗GSTA1抗体 | Affinity | DF6514 |
| 抗GSTA2抗体 | Proteintech | 10505-1-AP | |
| 抗GSTA3抗体 | Zenbio | R24520 | |
| 抗GSTA4抗体 | Affinity | DF12203 | |
| 抗NRF2抗体 | Zenbio | 380773 | |
| 抗p-ERK抗体 | Zenbio | 301245 | |
| 抗p-STAT1抗体 | Cell Signaling Technology | 9145 | |
| 抗p-STAT3抗体 | Cell Signaling Technology | 7649 | |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | Abcam | ab8227 | |
| 抗GAPDH抗体 | Epizyme | LF206 | |
| 免疫组织化学 | 抗CD3抗体 | Abcam | ab16669 |
| 抗NF-κB p50抗体 | Abcam | ab32360 | |
| 抗TSLP抗体 | Proteintech | 13778-1-AP | |
| 抗NRF2抗体 | Abcam | ab62352 | |
| 过氧化物酶标记的山羊抗兔IgG(H+L) | Jackson ImmunoResearch | 111-035-003 | |
| 免疫荧光 | DAPI染色液 | Sigma-Aldrich | D9542 |
| 抗CD4抗体 | Abcam | ab213215 | |
| 抗CD69抗体 | Abcam | ab233396 | |
| ROS检测 | 活性氧检测试剂盒 | Elabscience | E-BC-K138-F |
| 二氢乙啶 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 流式细胞术 | CD45-BV421抗体 | BioLegend | 30-F11 |
| CD3-FITC抗体 | BioLegend | 17A2 | |
| CD4-PerCP抗体 | BioLegend | RM4-5 | |
| CD8-PE抗体 | BioLegend | 53-6.7 | |
| 活率染料APC-Cy7 | Invitrogen | 65-0865-14 | |
| CD69-PE/Cy7抗体 | BioLegend | H1.2F3 | |
| BD LSRFortessa X-20流式细胞仪 | BD Biosciences | -- | |
| RNA-seq | Agilent扫描仪(G2505C) | Agilent Technologies | -- |
| 质粒构建 | BglII限制性内切酶 | Thermo Fisher Scientific | ER00815 |
| SalI限制性内切酶 | Thermo Fisher Scientific | ER0641 | |
| pProUTR-Reporter载体 | HarO | TProUTRRep01 | |
| 双荧光素酶报告基因 | 双荧光素酶报告检测系统 | Promega | -- |
| ChIP实验 | 抗NRF2抗体(ChIP级) | Cell Signaling Technology | 12721 |
| 正常兔IgG | Cell Signaling Technology | 2729 | |
| KG质量控制 | 甘草苷标准品 | Yuanye Bio-Technology | B20414 |
| 氧化苦参碱标准品 | Yuanye Bio-Technology | S31408 | |
| 槐定碱标准品 | Yuanye Bio-Technology | B50585 | |
| Vanquish超高效液相色谱系统 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Orbitrap Q Exactive HFX质谱仪 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 细胞活力检测 | 细胞计数试剂盒-8 | -- | -- |
| Multiskan Spectrum酶标仪 | Thermo Fisher Scientific | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型建立 | MC903剂量、给药方式、给药时间、小鼠品系、性别、年龄、组别设置、KG和HC剂量 阅读提示:Materials and Methods - Animals and treatment, Figure 1a |
| 转录组测序 | 样本来源、RNA提取方法、测序平台、DEGs筛选阈值 阅读提示:Materials and Methods - RNA sequencing and bioinformatics analysis, Figure 2a, Supplementary Figure S2 |
| 细胞实验 | 细胞系来源、培养基、TSLP刺激浓度和时间、GSTA4/NRF2过表达方法、ROS检测方法 阅读提示:Materials and Methods - Cell culture and treatment, Transfection, Figure 3, Supplementary Figure S6 |
| 双荧光素酶报告基因实验 | 启动子片段构建、转染细胞系、KG处理浓度、报告基因检测系统 阅读提示:Materials and Methods - Luciferase report assay, Figure 4f-g |
| ChIP实验 | 细胞类型、抗体、引物序列、PCR条件 阅读提示:Materials and Methods - Chromatin immunoprecipitation PCR, Figure 4h-i |
| 临床样本 | 样本来源、分组、染色方法 阅读提示:Materials and Methods - Clinical samples, Figure 2f, Supplementary Figure S5 |