患者样本分析
探究AIEC定植与肠上皮细胞脂质过氧化和铁死亡标志物的关联
收集CD患者末端回肠黏膜,根据AIEC定植分组,通过Western blot检测GPX4、FTH,免疫组化检测4-HNE、GPX4和TUNEL。
PUFAs add fuel to Crohn's disease-associated AIEC-induced enteritis by exacerbating intestinal epithelial lipid peroxidation
包含患者样本、体外细胞模型、多个体内小鼠模型(DSS、AVNM、WT),并进行了功能验证(GPX4过表达)和机制验证(Ferrostatin-1抑制铁死亡)。
CD患者末端回肠黏膜样本 Caco-2细胞系(人结肠腺癌细胞) DSS诱导结肠炎小鼠模型 AVNM小鼠模型 C57BL/6J WT小鼠模型
AIEC菌株LF82的感染复数(MOI)和感染时间(MOI=50,3小时) AA和DHA的处理浓度(20 μM) DSS小鼠模型:2% DSS饮水5天,AIEC灌胃剂量2×10^9 CFU,AA 10 mg AVNM小鼠模型:抗生素鸡尾酒预处理7天,AIEC灌胃2×10^9 CFU,每3天一次,AA 10 mg Ferrostatin-1给药剂量:2.5 μmol/kg腹腔注射
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
探究AIEC定植与肠上皮细胞脂质过氧化和铁死亡标志物的关联
收集CD患者末端回肠黏膜,根据AIEC定植分组,通过Western blot检测GPX4、FTH,免疫组化检测4-HNE、GPX4和TUNEL。
评估AIEC感染对肠上皮细胞LPO和铁死亡的影响,以及PUFA的调节作用
Caco-2细胞感染LF82(AIEC)或K12(非致病菌),并加AA、DHA、POA处理,检测LPO、铁死亡标志物和细胞活力。
验证GPX4在AIEC诱导的LPO和铁死亡中的保护作用
在Caco-2细胞中过表达GPX4,检测AIEC和AA处理下的LPO、细胞死亡、Fe2+水平及铁死亡标志物。
验证AIEC与AA联合对DSS诱导结肠炎的加重作用
DSS诱导结肠炎小鼠,灌胃AIEC和/或AA,评估体重、DAI、结肠长度、病理评分及AIEC定植。
验证AIEC与AA单独或联合能否诱导肠炎
AVNM小鼠(抗生素预处理)和WT小鼠,灌胃AIEC和/或AA,评估肠炎指标、LPO和铁死亡标志物。
验证铁死亡在AIEC+AA诱导肠炎中的因果关系
在AVNM小鼠模型中,腹腔注射Ferrostatin-1,评估肠炎严重程度、LPO和铁死亡标志物。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | MEM培养基 | Cytiva HyClone | -- |
| DMEM培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | PAN-Seratech | -- | |
| 青霉素-链霉素混合液 | Gibco | -- | |
| 细菌培养 | LB肉汤 | -- | -- |
| 细菌分离 | 麦康凯琼脂 | Solarbio | -- |
| 庆大霉素 | Sigma | -- | |
| 细胞感染 | 花生四烯酸 | MCE | -- |
| 二十二碳六烯酸 | MCE | -- | |
| 棕榈油酸 | MCE | -- | |
| Z-VAD-FMK | MCE | -- | |
| 坏死性凋亡抑制剂-1 | MCE | -- | |
| Ferrostatin-1 | MCE | -- | |
| 动物实验 | 葡聚糖硫酸钠 | MP Bio-medicals | -- |
| 氨苄西林 | Psaitong | -- | |
| 万古霉素 | Psaitong | -- | |
| 新霉素 | Psaitong | -- | |
| 甲硝唑 | Psaitong | -- | |
| 免疫印迹 | RIPA裂解液 | -- | -- |
| PVDF膜 | Bio-Rad | -- | |
| 抗GPX4抗体 | Proteintech | 67763-1-Ig | |
| 抗FTH抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-376594 | |
| 抗4-HNE抗体 | Bioss | bs-6313R | |
| 抗PTGS-2抗体 | Abclonal | A1253 | |
| ECL免疫印迹试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 免疫组化 | 抗F4/80抗体 | Proteintech | 28463-1-AP |
| 抗GPX4抗体 | Proteintech | 67763-1-Ig | |
| 抗TNF-α抗体 | Proteintech | 17590-1-AP | |
| 抗IL-6抗体 | Elabscience | E-AB-40021 | |
| 抗CXCL1抗体 | Proteintech | 12335-1-AP | |
| 抗Gr-1抗体 | Proteintech | 65140-1-Ig | |
| 抗ZO-1抗体 | Proteintech | -- | |
| 抗EPCAM抗体 | Proteintech | 21050-1-AP | |
| TUNEL染色 | TUNEL染色试剂盒 | Beyotime | -- |
| ELISA | 人4-HNE ELISA试剂盒 | ELK Biotechnology | -- |
| 基因过表达 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Invitrogen | 11668030 |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | Beyotime | -- |
| 脂质过氧化检测 | BODIPY 581/591 C11探针 | Invitrogen | D3861 |
| 流式细胞仪(BD LSRFortessa) | BD | -- | |
| Fe2+检测 | FerroOrange探针 | Dojindo | -- |
| 实时荧光定量PCR | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| qScript cDNA合成预混液 | -- | -- | |
| SYBR预混液 | -- | -- | |
| Light Cycler 96实时荧光定量PCR仪 | Roche | -- | |
| 显微镜 | 共聚焦显微镜(Zeiss LSM 880) | Zeiss | -- |
| 荧光显微镜 | Olympus | -- | |
| 微孔板检测 | 微孔板光度计 | Biotek | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 患者样本分析 | AIEC定植状态、样本数量、GPX4和FTH蛋白表达、4-HNE和TUNEL染色 阅读提示:Materials and methods: Patients; Figure 1 |
| 体外AIEC感染 | AIEC菌株(LF82)、MOI=50、感染时间3小时、AA/DHA浓度20 μM、检测指标 阅读提示:Materials and methods: Cell infection studies; Figure 2 |
| GPX4过表达 | GPX4过表达质粒、转染试剂、转染效率验证 阅读提示:Materials and methods: GPX4 overexpression; Figure 4 |
| DSS小鼠模型 | 小鼠品系、年龄、DSS浓度和天数、AIEC灌胃剂量和频率、AA剂量 阅读提示:Materials and methods: Mouse infection procedure (DSS mice); Figure 5 |
| AVNM小鼠模型 | 抗生素种类和剂量、预处理时间、AIEC灌胃剂量和频率、AA剂量 阅读提示:Materials and methods: Mouse infection procedure (AVNM mice); Figure 6 |
| WT小鼠模型 | AIEC灌胃剂量和频率、AA喂养时间 阅读提示:Materials and methods: Mouse infection procedure (WT mice); Figure S4 |
| Ferrostatin-1干预 | Ferrostatin-1剂量(2.5 μmol/kg)、给药途径(腹腔注射)、给药时间(7天) 阅读提示:Materials and methods: Mouse infection procedure (Ferrostatin-1 treatment); Figure 8 |