高内涵筛选与结构优化
发现TLR7选择性小分子抑制剂。
基于SEAP报告基因检测对超过10万个小分子化合物进行筛选,获得先导化合物S1,并通过构效关系优化得到TH-407b。
Targeting toll-like receptor 7 as a therapeutic development strategy for systemic lupus erythematosus
包含细胞水平功能验证(SEAP、RT-PCR、ELISA、Western blot)、体外结合与结构机制验证(ITC、交联、cryo-EM)、患者PBMC离体验证、MRL/lpr小鼠体内药效及毒理实验。
HEK-Blue hTLR7细胞 RAW 264.7细胞 THP-1细胞 SLE患者PBMC MRL/lpr小鼠
TH-407b在HEK-Blue hTLR7细胞中的IC50为0.23 ± 0.03 μmol/L 采用SEAP报告基因检测TLR7活性 体外ITC结合实验显示KD为5.1 μmol/L MRL/lpr小鼠治疗给药剂量为100 mg/kg口服每日两次 SLE患者PBMC中检测TNF-α、IL-6、IL-1β水平
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
发现TLR7选择性小分子抑制剂。
基于SEAP报告基因检测对超过10万个小分子化合物进行筛选,获得先导化合物S1,并通过构效关系优化得到TH-407b。
验证TH-407b对TLR7信号通路的抑制作用。
在HEK-Blue hTLR7细胞和RAW 264.7细胞中,用R848激活TLR7后检测IL-8、TNF-α、IL-6水平及下游蛋白表达。
探究TH-407b与TLR7的结合模式及抑制机制。
通过ITC测量结合亲和力,交联实验检测受体二聚化,并解析cryo-EM结构。
评估TH-407b对SLE患者PBMC中炎症因子的抑制作用。
从SLE患者分离PBMC,经TH-407b处理后检测TNF-α、IL-6、IL-1β水平。
验证TH-407b在自身免疫性狼疮小鼠模型中的治疗效果。
MRL/lpr小鼠口服TH-407b或HCQ,监测生存率、皮肤病变、脾脏重量、自身抗体水平及肾组织病理。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞实验 | RPMI 1640培养基 | Thermo Scientific | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| HEK-Blue hTLR7细胞 | Invitrogen | hkb-htlr7 | |
| R848 | Invivogen | -- | |
| ELISA | BD OptEIA人TNF、IL-6和IL-1β ELISA试剂盒 | BD Biosciences | -- |
| 小鼠TNF-α和IL-6 OptEIA ELISA试剂盒 | BD Biosciences | -- | |
| 小鼠ANA和抗ds-DNA抗体ELISA试剂盒 | Jiangsu Meibiao Biotechnology Co., Ltd. | -- | |
| RT-PCR | Trizol试剂 | Invitrogen | 15596026 |
| iScript cDNA合成试剂盒 | Bio-rad | 1708890 | |
| iTaq Universal SYBR Green Supermix | Bio-Rad | 1725120 | |
| Western blot | TRAF3抗体 | CST | 4729 |
| IKBα抗体 | Bioss | 1287R | |
| p-IKBα抗体 | Bioss | 52169R | |
| GAPDH抗体 | CST | 2118 | |
| PVDF转印膜 | Merck Millipore | -- | |
| Thermo SuperSignal West Pico试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 蛋白表达纯化 | 果蝇S2细胞 | -- | -- |
| IgG Sepharose | GE Healthcare | -- | |
| 蛋白纯化 | HiLoad 26/600 Superdex 200 pg柱 | GE Healthcare | -- |
| ITC | MicroCal iTC200 | Malvern Panalytical | -- |
| cryo-EM | Quantifoil网格(R1.2/R1.3 300目,铜) | -- | -- |
| Vitrobot Mark IV | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Titan Krios G3i显微镜 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Gatan K3直接电子探测器 | Gatan | -- | |
| 组织学分析 | 蔡司Axio Scan. Z1 | Zeiss | -- |
| 药代动力学 | TH-407b | -- | -- |
| S15 | -- | -- | |
| 急性毒性评估 | TH-407b | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 体外活性测定 | HEK-Blue hTLR7细胞传代密度和状态;化合物浓度梯度;R848浓度2 μg/mL;孵育时间20-24小时;SEAP检测波长620 nm;细胞活力检测孵育时间不超过2小时 阅读提示:Methods 2.4和2.5节,Figure 1A |
| 细胞因子检测 | RAW 264.7细胞处理条件(R848浓度2 μg/mL,TH-407b浓度梯度);ELISA试剂盒和操作流程;PBMC分离和培养条件(密度3×10^6 cells/mL,RPMI 1640,处理24小时);ELISA检测TNF-α、IL-6、IL-1β 阅读提示:Methods 2.1和2.8节,Figure 1C和Figure 5 |
| Western blot | 细胞处理(RAW 264.7用R848 2 μg/mL,THP-1用TL8-506 1 μg/mL);抗体稀释比例1:1000;二抗1:5000;蛋白上样量;电泳和转膜条件(100 mA 1小时);化学发光检测 阅读提示:Methods 2.9节,Figure 1D |
| 结合实验 | ITC参数:温度298 K,缓冲液(40 mmol/L citrate/NaOH pH 4.8, 150 mmol/L NaCl);滴定序列(单次0.4 μL,18次2 μL,间隔180秒);蛋白浓度80 μmol/L,配体浓度1 mmol/L;交联实验:TLR7蛋白25 μmol/L,glutaraldehyde 20 mmol/L,20°C 30分钟;SDS-PAGE分析 阅读提示:Methods 2.11和2.12节,Figure 2A和2B |
| 结构解析 | cryo-EM样品制备:蛋白与配体浓度、交联条件、缓冲液;电镜数据收集参数(放大倍数105,000×,剂量57.9 e/Ų,像素大小0.83 Å);数据处理流程和分辨率标准 阅读提示:Methods 2.13和2.14节,Figure 3 |
| 动物实验 | MRL/lpr小鼠周龄和性别(14周龄雌性);分组和数量(每组12只);给药途径(口服);TH-407b剂量100 mg/kg每日两次,HCQ剂量100 mg/kg每日一次;治疗时间4周;监测指标(生存率、体重、皮肤病变、脾脏重量、抗ds-DNA抗体水平、肾脏病理) 阅读提示:Methods 2.2节,Figure 6 |
| 毒理实验 | 急性毒性实验剂量范围(0-1000 mg/kg)和观察时间(7天);长期毒性实验剂量(100 mg/kg每日两次)和观察时间(28天);观察指标(生存率、体重、器官病理) 阅读提示:Methods 2.17和2.18节 |