组织样本收集与分组
获取NSCLC和正常肺组织以比较mTOR通路蛋白表达。
收集172例手术切除的NSCLC组织(包括75例鳞癌、77例腺癌、20例其他类型)及56例癌旁正常肺组织、20例正常肺组织作为对照。
Activation of mammalian target of rapamycin pathway confers adverse outcome in nonsmall cell lung carcinoma
基于172例NSCLC肿瘤组织和正常肺组织的免疫组化检测,结合临床随访数据进行单因素和多因素生存分析,但缺乏体外功能实验或动物模型等机制验证。
非小细胞肺癌组织样本(172例手术切除标本) 正常肺组织样本(56例癌旁正常组织及20例正常肺组织)
样本量:172例NSCLC肿瘤组织,其中136例用于所有标志物评估 随访时间:中位随访37.25个月(范围0-86.5个月) 免疫组化评分:半定量评分(0-9分),0-2分为阴性/低表达,2-9分为阳性/高表达 抗体稀释度:p-mTOR 1:100,p-PDK1 1:300,p-Akt1 Ser473 1:50,p-P70S6K 1:300
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
获取NSCLC和正常肺组织以比较mTOR通路蛋白表达。
收集172例手术切除的NSCLC组织(包括75例鳞癌、77例腺癌、20例其他类型)及56例癌旁正常肺组织、20例正常肺组织作为对照。
检测mTOR通路相关蛋白及其磷酸化形式的表达水平。
使用特定一抗对福尔马林固定石蜡包埋组织切片进行免疫组化染色,评估mTOR/p-mTOR、PDK1/p-PDK1、p-Akt1 Ser473/Thr308、P70S6K/p-P70S6K的表达。
定量评估蛋白表达水平并分析其与临床病理特征和预后的关系。
由两位病理学家对染色进行半定量评分(0-9分),结合临床数据(分期、组织学、淋巴结转移等)进行关联分析和生存分析。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 免疫组化 | mTOR (7C10)抗体 | Cell Signaling Technology | 2983 |
| p-mTOR (Ser2448)抗体 | Cell Signaling Technology | 2976 | |
| PDK1抗体 | Signalway Antibody | 21005 | |
| p-PDK1 (Ser241)抗体 | Signalway Antibody | 11005 | |
| p-Akt1 (Ser473)抗体 | Cell Signaling Technology | 3787 | |
| p-Akt1 (Thr308)抗体 | Cell Signaling Technology | 9266 | |
| P70S6K抗体 | Cell Signaling Technology | 2708 | |
| p-P70S6K (Ser424)抗体 | Signalway Antibody | 11284 | |
| EnVision+ 系统 | Dako | K4007 | |
| 抗原修复液(pH 9.0) | Dako Cytomation | -- | |
| 牛血清白蛋白 | -- | -- | |
| 统计软件 | SPSS 13.0 for Windows | SPSS Inc. | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 样本收集 | 样本来源:West China Hospital, Sichuan University;样本数量:172例NSCLC,56例癌旁正常组织,20例正常肺组织;组织类型:鳞癌、腺癌、其他类型 阅读提示:见Materials and Methods中的Tissue Collection部分 |
| 免疫组化染色 | 一抗稀释度:mTOR 1:50, p-mTOR 1:100, PDK1 1:300, p-PDK1 1:300, p-Akt1 Ser473 1:50, p-Akt1 Thr308 1:50, P70S6K 1:60, p-P70S6K 1:300;抗原修复条件:Tris/EDTA缓冲液pH 9.0,95°C水浴30分钟;二抗:EnVision+ System,K4007;DAB显色时间:3-5分钟 阅读提示:见Materials and Methods中的Immunohistochemical Staining部分 |
| 免疫组化评分 | 评分标准:阳性细胞比例(0-3分)乘以染色强度(0-3分),总分0-9;0-2分为阴性/低表达,2-9分为阳性/高表达;由两位病理医生独立评估 阅读提示:见Materials and Methods中的Immunohistochemical Scoring部分 |
| 生存分析 | 随访时间:中位37.25个月(范围0-86.5个月);统计方法:Kaplan-Meier法、log-rank检验、单因素和多因素Cox回归;纳入多因素的变量:性别、肿瘤大小、淋巴结浸润、远处转移、肿瘤分期、p-PDK1、p-mTOR、p-P70S6K 阅读提示:见Materials and Methods中的Statistical Analysis部分及Results中的Multivariate Cox Regression Analysis部分 |