验证HCAR1在RPE中的表达
确定HCAR1在亚视网膜中的定位
通过免疫荧光和RT-PCR检测HCAR1在RPE/脉络膜复合体和原代RPE细胞中的表达。
Endoplasmic Reticulum Stress Delays Choroid Development in the HCAR1 Knockout Mouse
包含体外脉络膜出芽实验、体内基因敲除小鼠模型、蛋白质合成检测、内质网应激通路)及ISRIB干预修复实验等多个独立证据层级。
Hcar1基因敲除小鼠模型 RPE/脉络膜复合体 原代RPE细胞 脉络膜外植体
Hcar1基因敲除小鼠(C57BL/6背景)及其野生型同窝对照 不同出生后时间点:PT7、PT9、PT12、PT15 乳酸(10 mmol/L)和DHBA(80 μmol/L)处理浓度 ISRIB(200 nmol/L)玻璃体腔注射 脉络膜厚度测量(距视神经0-150 μm区域)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定HCAR1在亚视网膜中的定位
通过免疫荧光和RT-PCR检测HCAR1在RPE/脉络膜复合体和原代RPE细胞中的表达。
评估HCAR1缺失对脉络膜发育的影响
通过凝集素染色和共聚焦显微镜测量不同发育时间点的脉络膜厚度。
验证乳酸-HCAR1信号是否直接促进脉络膜血管生成
分离脉络膜或RPE/脉络膜外植体,用乳酸或DHBA处理,观察血管出芽。
确定HCAR1缺失是否影响脉络膜细胞增殖和蛋白质合成
通过Ki-67染色评估增殖,通过OPP掺入实验检测蛋白质合成速率。
探索HCAR1缺失导致脉络膜变薄的分子机制
测量ROS/RNS水平、SOD活性、NRF2表达以及内质网应激标志物和UPR通路蛋白。
验证抑制ISR通路是否能挽救HCAR1缺失引起的脉络膜变薄
对Hcar1−/−和WT小鼠玻璃体腔注射ISRIB,评估脉络膜厚度和生长因子表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 化学处理 | L-乳酸 | Sigma-Aldrich | L7022 |
| 3,5-二羟基苯甲酸 | Sigma-Aldrich | D110000 | |
| 药物处理 | ISRIB | Sigma-Aldrich | SML0843 |
| RNA提取 | RNeasy Plus 微型试剂盒 | Qiagen | 74136 |
| 反转录 | iScript cDNA SuperMix | Bio-Rad | -- |
| 定量PCR | SYBR Green 预混液试剂盒 | Bio-Rad | 1725124 |
| 免疫荧光 | 小鼠RPE65抗体 | Santa Cruz Biotechnology | Sc-390787 |
| 兔HCAR1抗体 | Sigma-Aldrich | SAB1300790 | |
| 罗丹明标记的Griffonia simplicifolia凝集素I | Vector Laboratories | RL-1102 | |
| FITC-鬼笔环肽 | Biotium | 00030 | |
| 兔Ki-67抗体 | Abcam | Ab16667 | |
| Western blot | 小鼠eIF2α (D-3)抗体 | Santa Cruz Biotechnology | Sc-133132 |
| 兔磷酸化eIF2α抗体 | Abcam | Ab32157 | |
| 小鼠BiP抗体 | BD Bioscience | BD 610978 | |
| 小鼠PDI抗体 | Abcam | Ab2792 | |
| 小鼠HSP90抗体 | Santa Cruz Biotechnology | Sc-13119 | |
| 兔磷酸化PERK抗体 | Invitrogen | MA5-15033 | |
| 兔PERK抗体 | Bioss | BS-2469R | |
| 兔ATF4/creb-2 (b3)抗体 | Santa Cruz Biotechnology | Sc-390063 | |
| 兔β-微管蛋白抗体 | Proteintech | 10068-1-AP | |
| 小鼠β-肌动蛋白(C4)抗体 | Santa Cruz Biotechnology | Sc-47778 | |
| 兔NRF2抗体 | Abcam | Ab31163 | |
| 兔磷酸化IRE-1α抗体 | Sigma-Aldrich | S724 | |
| 兔IRE-1α抗体 | Cell Signaling Technology | 3294 | |
| 小鼠XBP-1s抗体 | Cell Signaling Technology | 40435 (E9V3E) | |
| 兔ATF-6抗体 | Abcam | EPR22690-84 | |
| 免疫荧光 | 兔Iba-1抗体 | Abcam | Ab178847 |
| 小鼠podocalyxin抗体 | R & D Biosystems | MAB1556 | |
| α-SMA抗体 | Thermo Fisher Scientific | A 2547 | |
| Western blot | 山羊抗兔HRP二抗 | Cell Signaling Technology | 7074S |
| 山羊抗小鼠HRP二抗 | Bio-Rad | 172-1011 | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Invitrogen | -- |
| Fungizone | Thermo Fisher Scientific | 15290026 | |
| 胰蛋白酶 | Sigma-Aldrich | T9201 | |
| I型胶原酶 | Sigma-Aldrich | C0130 | |
| 贴壁因子 | Gibco, Fisher Scientific | S006100 | |
| 免疫荧光 | TritonX-100 | Sigma-Aldrich | T-8787 |
| 金抗淬灭封片剂 | Thermo Fisher Scientific | P36961 | |
| DAPI | Sigma-Aldrich | D9542 | |
| 体外培养 | Matrigel基质胶 | Corning Life Science | -- |
| EBM2培养基 | Lonza | CC-3156 | |
| 组织分离 | Dispase II中性蛋白酶 | Roche | C756V28 |
| Hanks平衡盐溶液 | Invitrogen | 88284 | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Cell Signaling Technology | 9806 |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Roche | 11697498001 | |
| 蛋白定量 | Bradford蛋白定量试剂 | Bio-Rad | 5000006 |
| Western blot | Western Lightning Plus-ECL底物 | PerkinElmer | NEL103E001 EA |
| 蛋白质芯片 | 小鼠生长因子芯片C3 | RayBiotech | -- |
| 氧化应激检测 | OxiSelect体外ROS/RNS检测试剂盒 | Cell Biolabs | STA-347-5 |
| SOD活性检测试剂盒 | Sigma-Aldrich | 19160 | |
| 凋亡检测 | 原位细胞死亡检测试剂盒(TUNEL) | Roche | C755B40 |
| 蛋白质合成检测 | Click-&-Go Plus 488 OPP蛋白质合成检测试剂盒 | Click-Chemistry Tool | 1493 |
| 组织包埋 | OCT包埋剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 漂白 | 过氧化氢 | Sigma-Aldrich | 349887 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型与基因型 | 小鼠品系(C57BL/6)、Hcar1敲除策略(跨膜结构域2替换为IRES-lacZ-neo cassette)、饲养条件、基因型鉴定方法 阅读提示:Materials and Methods: Animals; Genotypic Screening |
| 时间点与年龄 | 明确检测和处理的发育时间点PT7、PT9、PT12、PT15以及部分PT30 阅读提示:Materials and Methods: Animals; Results |
| 化学处理(体外) | l-乳酸浓度(10 mmol/L)、3,5-二羟基苯甲酸浓度(80 μmol/L)、溶剂(PBS)和pH(6.5-7.3) 阅读提示:Materials and Methods: Chemical Preparations |
| 脉络膜厚度测量 | 染色方法(凝集素)、测量位置(距视神经150μm间隔)、图像分析软件和放大倍数 阅读提示:Materials and Methods: Quantification of Choroidal Thickness |
| 体外脉络膜出芽实验 | 外植体制备(含或不含RPE)、Matrigel用量(30 μL)、处理时间(第4~6天)、血管面积测量方法 阅读提示:Materials and Methods: Choroidal Sprout Assay |
| ISRIB干预 | ISRIB浓度(200 nmol/L)、溶剂(DMSO)、注射方式(玻璃体腔)、注射次数和时间(PT7、PT9、PT12)、评估时间(PT9、PT12、PT15) 阅读提示:Materials and Methods: Animals; Results: ISR Inhibitor |