临床样本中CD276表达与预后分析
评估CD276在ESCC患者组织中的表达水平及其与临床病理特征和预后的关系。
通过IHC染色检测两个独立队列(SYSUCC,n=297;FAH-SYSU,n=143)的ESCC组织中CD276表达,并分析其与肿瘤分级、分期、复发、治疗反应及生存期的相关性。
CD276 regulates the immune escape of esophageal squamous cell carcinoma through CXCL1-CXCR2 induced NETs
包含患者组织IHC分析、4NQO诱导的全身及条件性敲除小鼠模型、功能验证(抗体阻断、抑制剂处理)、scRNA-seq及RNA-seq机制研究。
4NQO诱导的CD276全身敲除(CD276-wKO)小鼠ESCC模型 4NQO诱导的K14CreER;CD276flox/flox条件性敲除(CD276-cKO)小鼠ESCC模型 4NQO诱导的CD276过表达(cKI)小鼠ESCC模型 ESCC患者组织样本(SYSUCC和FAH-SYSU队列)
CD276表达水平(IHC评分) 4NQO诱导方案(50 µg/mL,16周,随后正常饮水10周) 他莫昔芬诱导敲除或敲入(1 mg/只/天,连续3天) 抗体或抑制剂处理(抗CXCL1、抗Ly6G、抗NK1.1、GSK484,剂量及频率) NETs形成(H3cit+细胞)、NK细胞浸润(NCR1+)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估CD276在ESCC患者组织中的表达水平及其与临床病理特征和预后的关系。
通过IHC染色检测两个独立队列(SYSUCC,n=297;FAH-SYSU,n=143)的ESCC组织中CD276表达,并分析其与肿瘤分级、分期、复发、治疗反应及生存期的相关性。
研究CD276整体缺失对4NQO诱导的ESCC肿瘤发生和进展的影响。
建立CD276-wKO小鼠,通过4NQO饮水诱导ESCC,比较WT和wKO小鼠的食管病变大小、数量、病理分级、增殖(Ki67)、凋亡(Caspase3)及免疫细胞浸润。
验证肿瘤细胞来源的CD276是否是驱动ESCC进展的主要因素。
构建K14CreER;CD276flox/flox(cKO)小鼠,4NQO诱导ESCC,比较cKO与对照小鼠的肿瘤负荷、病理分级、增殖凋亡及免疫微环境(FCM)。
探讨CD276缺失对肿瘤微环境及信号通路的影响。
对cKO和WT小鼠的ESCC组织进行RNA-seq和scRNA-seq,分析差异表达基因、通路富集及细胞组成变化。
验证CD276通过下调CXCL1抑制ESCC进展。
用抗CXCL1抗体处理4NQO诱导的ESCC小鼠,评估肿瘤负荷和病理分级。
验证CD276通过CXCL1-CXCR2轴促进肿瘤-中性粒细胞互作和NETs形成,并研究NETs对NK细胞的影响。
使用抗Ly6G抗体清除中性粒细胞,使用GSK484(PAD4抑制剂)抑制NETs形成,观察对肿瘤生长和免疫细胞的影响。
验证CD276缺失抑制ESCC进展依赖于NK细胞。
使用抗NK1.1抗体清除NK细胞,评估CD276缺失小鼠的肿瘤负荷和病理分级。
验证CD276过表达促进ESCC进展并伴随NETs增加和NK细胞减少。
构建CD276-cKI小鼠,4NQO诱导ESCC,比较cKI与WT小鼠的肿瘤负荷、病理分级、免疫细胞和NETs。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | K14CreER小鼠 | The Jackson Laboratory | -- |
| Cd276全身敲除小鼠 | Biocytogen | -- | |
| Cd276条件性敲除小鼠 | Biocytogen | -- | |
| Cd276条件性敲入小鼠 | Biocytogen | -- | |
| 他莫昔芬 | Sigma | T5648-1G | |
| 玉米油 | Aladdin | C116025-500ml | |
| 抗体阻断 | CXCL1单克隆抗体 | Invitrogen | MA5-23745 |
| 抗小鼠Ly6G抗体 | BioXcell | BE0075-1 | |
| 抗小鼠NK1.1抗体 | BioXcell | BP0036 | |
| 药物处理 | GSK484 | GLPBIO | GC19184 |
| 抗体阻断 | 抗小鼠CD8α抗体 | Bioxcell | BP0061 |
| 大鼠IgG1同型对照抗体 | BioXcell | BE0088 | |
| 组织学染色 | H&E染色试剂盒 | Solarbio | G1120 |
| 免疫组化 | 柠檬酸钠缓冲液 | Bioss | C02-02002 |
| SABC免疫组化试剂盒 | BOSTER | SA1022 | |
| DAB显色液 | BOSTER | AR1027 | |
| Ki67抗体 | Novus | NB500-170 | |
| Cleaved Caspase-3抗体 | CST | 9661S | |
| CD8a抗体 | Abcam | ab93278 | |
| CXCL1抗体 | Proteintech | 12335-1-AP | |
| NCR1抗体 | Abcam | ab283517 | |
| CD4抗体 | Immunoway | YT0762 | |
| PI3K抗体 | Affinity | AF5112 | |
| AKT抗体 | Proteintech | 66444-1-Ig | |
| 免疫荧光 | MPO抗体 | Immunoway | YM6663 |
| H3cit抗体 | Abcam | ab5103 | |
| DAPI | -- | -- | |
| 单细胞RNA测序 | 小鼠肿瘤解离试剂盒 | Miltenyi Biotec | 130-096-730 |
| gentleMACS解离器 | Miltenyi Biotec | 130-093-235 | |
| Chromium单细胞3' v3 | 10x Genomics | -- | |
| RNA测序 | FreeZol试剂 | Vazyme | R711-02 |
| MGISEQ-500测序平台 | MGI Technology | MGISEQ-500 | |
| 流式细胞术 | CD45抗体 | Tonbo Biosciences | 60-0451 |
| CD3抗体 | Tonbo Biosciences | 20-0032 | |
| CD8a抗体 | Tonbo Biosciences | 75-0081 | |
| CD4抗体 | Biolegend | 100510 | |
| GZMB抗体 | Biolegend | 372212 | |
| CD25抗体 | Tonbo Biosciences | 50-0251 | |
| FOXP3抗体 | Tonbo Biosciences | 55-5773 | |
| CD11b抗体 | Tonbo Biosciences | 85-0112 | |
| Ly6G抗体 | Tonbo Biosciences | 50-1276 | |
| F4/80抗体 | Invitrogen | 45-4801-80 | |
| NK1.1抗体 | Tonbo Biosciences | 80-5941 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型建立 | 4NQO浓度(50 µg/mL)、处理时间(16周)、后续正常饮水时间(10周)、小鼠性别和周龄(6周龄雄性) 阅读提示:Materials and methods, Animal assay |
| 基因敲除/敲入诱导 | 他莫昔芬剂量(1 mg/只/天,连续3天)、给药方式(腹腔注射) 阅读提示:Materials and methods, Animal assay |
| 抗体阻断处理 | 抗体种类、剂量(抗CXCL1 8 mg/kg;抗Ly6G 500 µg/只;抗NK1.1 100 µg/只;抗-CD8 100 µg/只;IgG对照10 mg/kg)、给药频率(抗IgG每周三次,其他每周两次)、持续时间(4周) 阅读提示:Materials and methods, Animal assay |
| 抑制剂处理 | GSK484剂量(4 mg/kg)、给药频率和持续时间(每周两次,共4周)、给药方式(腹腔注射) 阅读提示:Materials and methods, Animal assay |
| 组织学检测 | IHC评分标准(Q=P×I,强度0-3)、Ki67、Caspase3、CD4、CD8、NCR1、CXCL1、PI3K、AKT抗体稀释倍数 阅读提示:Materials and methods, Immunohistochemistry |
| 免疫荧光检测 | MPO和H3cit抗体稀释倍数(1:200)、NETs标记(H3cit)、中性粒细胞标记(MPO) 阅读提示:Materials and methods, Immunofluorescence |
| 流式细胞术 | 组织解离方法和抗体组合(CD45, CD3, CD8a, CD4, GZMB, CD25, FOXP3, CD11b, Ly6G, F4/80, NK1.1)及稀释倍数 阅读提示:Materials and methods, Tissue dissociation and FCM analysis |
| 单细胞RNA测序 | 组织解离方法(Mouse Tumor Dissociation Kit, gentleMACS)、测序平台(10x Genomics Chromium Single Cell 3' v3)、样本数量(1对照,2cKO) 阅读提示:Materials and methods, scRNA-seq dataset analysis |
| RNA测序 | RNA提取试剂(FreeZol)、测序平台(MGISEQ-500)、参考基因组(GRCm38)、差异表达分析软件(DESeq2) 阅读提示:Materials and methods, RNA-seq analysis |
| 统计分析 | 统计方法(log-rank test, two-tailed unpaired Student's t-test, one-way ANOVA with Tukey's multiple comparison test)、显著性水平(n.s., *p<0.05, **p<0.01, ***p<0.001)、实验重复次数(三次) 阅读提示:Materials and methods, Statistical analyses |