检测山羊早期妊娠子宫中m6A和METTL3表达水平
确定m6A修饰及METTL3在山羊早期妊娠子宫中的表达变化。
收集不同妊娠天数(D0-D25)的山羊子宫,使用m6A RNA甲基化定量试剂盒检测总RNA m6A水平,RT-qPCR检测METTL3 mRNA水平,原位杂交和免疫组化检测METTL3 mRNA和蛋白的定位与表达。
METTL3 promotes proliferation of goat endometrial epithelial cells by regulating CTGF in an m6A-dependent manner†
包含体内模型(妊娠山羊、去卵巢激素注射模型)和体外细胞模型(原代EECs、HEK293T),进行了功能验证(敲低/过表达)、机制验证(MeRIP、荧光素酶报告基因)和回复实验(CTGF敲低)。
山羊原代子宫内膜上皮细胞(EECs) 去卵巢山羊激素注射模型 妊娠山羊子宫组织 HEK293T细胞
METTL3表达水平:通过siRNA敲低或pcDNA3.1-METTL3过表达验证。 总RNA及CTGF mRNA m6A水平:使用m6A RNA甲基化定量试剂盒和MeRIP检测。 METTL3对CTGF 3'UTR的靶向作用:通过荧光素酶报告基因实验验证。 CTGF在METTL3促进EEC增殖中的作用:通过CTGF siRNA敲低进行功能回复实验。 EEC增殖检测:使用EdU实验和PCNA蛋白表达水平评估。
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定m6A修饰及METTL3在山羊早期妊娠子宫中的表达变化。
收集不同妊娠天数(D0-D25)的山羊子宫,使用m6A RNA甲基化定量试剂盒检测总RNA m6A水平,RT-qPCR检测METTL3 mRNA水平,原位杂交和免疫组化检测METTL3 mRNA和蛋白的定位与表达。
验证性激素能否调控METTL3在山羊子宫和EECs中的表达。
对去卵巢山羊注射雌二醇(E2)或孕酮(P4)后,通过免疫组化和Western blot检测子宫中METTL3蛋白水平。对原代EECs给予不同浓度E2或P4处理,RT-qPCR检测METTL3 mRNA水平。
确定METTL3是否影响山羊EEC增殖。
在EECs中转染METTL3 siRNA(siMETTL3)或pcDNA3.1-METTL3(oe-METTL3),通过Western blot检测METTL3和PCNA蛋白水平,EdU实验检测细胞增殖率。
探究METTL3是否调控CTGF mRNA的m6A修饰水平。
通过MeRIP结合RT-qPCR检测METTL3敲低后CTGF mRNA的m6A富集变化。使用m6A RNA甲基化定量试剂盒检测总RNA m6A水平。
确定METTL3是否直接靶向CTGF mRNA的3'UTR区域。
构建包含CTGF 5'UTR、CDS、3'UTR的野生型(WT)和3'UTR突变型(MUT)荧光素酶报告质粒,与pcDNA3.1-METTL3共转染HEK293T细胞,检测荧光素酶活性。
验证CTGF是否为METTL3促进EEC增殖的下游效应分子。
在EECs中共转染oe-METTL3和CTGF siRNA(siCTGF),通过Western blot检测CTGF和PCNA蛋白水平,EdU实验检测细胞增殖率。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM/F12培养基 | 未明确说明 | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 胶原酶II | Biosharp | -- | |
| 胰蛋白酶 | Sigma-Aldrich | -- | |
| Triton X-100 | -- | -- | |
| 牛血清白蛋白 | -- | -- | |
| DAPI | -- | -- | |
| Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | -- | |
| 细胞增殖检测 | EdU实验试剂盒 | RiBoBio | -- |
| Hoechst 33342 | -- | -- | |
| RNA提取和RT-qPCR | HiPure总RNA提取试剂盒 | Magen | -- |
| Nanodrop® 2000分光光度计 | Thermo-Scientific | -- | |
| GoScript™逆转录Mix | Promega | -- | |
| SYBR Green预混液 | TaKaRa | -- | |
| Applied Biosystems® 7500实时荧光定量PCR系统 | Applied Biosystems | -- | |
| RNA m6A定量 | EpiQuik m6A RNA甲基化定量试剂盒 | Epigentek | -- |
| MeRIP | EpiQuik m6A RNA富集试剂盒 | Epigentek | -- |
| High Capacity cDNA逆转录试剂盒 | Applied Biosystems | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | -- |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | -- | |
| PVDF膜 | -- | -- | |
| ECL化学发光液 | Biosharp | -- | |
| 免疫组织化学 | DAB显色试剂 | ORiGene | -- |
| 激素处理 | 17β-雌二醇 | Sigma-Aldrich | -- |
| 孕酮 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 荧光素酶实验 | Dual-Glo荧光素酶检测系统 | Promega | -- |
| 抗体 | 抗CK-18抗体 | Boster | BM0032 |
| 抗波形蛋白抗体 | Boster | BM0135 | |
| 兔抗小鼠IgG H&L (FITC)二抗 | Bioss | bs-0296R | |
| 抗METTL3抗体 | Proteintech | 15073-1-AP | |
| 抗PCNA抗体 | ABclonal | A13336 | |
| 抗CTGF抗体 | Proteintech | 25474-1-AP | |
| 抗GAPDH抗体 | Abcam | ab22555 | |
| 小鼠抗兔IgG/HRP二抗 | Bioss | bs-0295M | |
| 山羊抗兔IgG/HRP二抗 | Bioss | bs-0295G | |
| 细胞培养 | pcDNA3.1载体 | Invitrogen | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型和样品收集 | 妊娠天数分组(D0、D6、D16、D19、D25),每组动物数(n=5) 阅读提示:Materials and methods - Animals and tissue collection |
| 激素处理 | 去卵巢山羊激素注射剂量(E2 50μg/mL,P4 500mg/mL)和处理时间(24小时);EECs激素处理浓度(0.1-100 nM)和时间(24小时) 阅读提示:Materials and methods - Goat ovariectomy and hormone injection, Hormone treatment |
| 细胞培养 | 原代EECs分离方法、培养基(DMEM/F12+10%FBS)、培养条件(37°C、5% CO2)、消化条件(0.25%胰蛋白酶) 阅读提示:Materials and methods - Goat primary EECs |
| 细胞转染 | siRNA浓度(100 nM)、质粒量(6 μg)、转染试剂(Lipofectamine 2000) 阅读提示:Materials and methods - Cell transfection |
| MeRIP | 使用EpiQuik m6A RNA Enrichment Kit,RT-qPCR使用10 ng RNA 阅读提示:Materials and methods - Methylated RNA immunoprecipitation |