检测RUNX2和SOX9在cNCC中的时空表达
验证RUNX2是否在骨软骨分化前表达于第一鳃弓cNCC中
对E11.5胚胎进行免疫荧光染色,检测RUNX2和SOX9蛋白;使用Sox9GFP和Runx2GFP报告小鼠观察荧光表达。
A RUNX2 reporter is expressed prior to osteochondral differentiation and models metaphyseal dysplasia with maxillary hypoplasia and brachydactyly
包括免疫荧光、流式细胞术、RNA-seq、骨骼染色、组织学等体外和体内实验,含功能验证和机制验证。
小鼠胚胎第一鳃弓cNCC细胞 Runx2GFP/GFP小鼠 Runx2+/GFP小鼠 小鼠胫骨生长板软骨细胞
Runx2GFP等位基因的3'UTR插入不影响内源序列但导致RUNX2蛋白上调1.51倍 E11.5第一鳃弓中RUNX2表达早于SOX9 Runx2GFP/GFP小鼠出生后生长缺陷、上颌发育不全和短指 胫骨生长板中柱状和肥大软骨细胞压缩 RNA-seq显示骨发育相关基因表达改变
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证RUNX2是否在骨软骨分化前表达于第一鳃弓cNCC中
对E11.5胚胎进行免疫荧光染色,检测RUNX2和SOX9蛋白;使用Sox9GFP和Runx2GFP报告小鼠观察荧光表达。
确定RUNX2表达细胞的亚群及分化状态
使用Runx2-Cre和RosaTomato报告基因,结合流式细胞术和FACS分选GFP+细胞,进行qRT-PCR和RNA-seq。
确定RUNX2剂量上调对出生后骨骼发育的影响
对P0、P5、P10和断奶期小鼠进行骨骼染色、体重测量和组织学分析。
验证RUNX2上调及其对软骨细胞和成骨细胞的影响
通过免疫荧光和免疫组化检测P10生长板和颅底骨中RUNX2表达,测量生长板厚度和肥大细胞面积。
揭示RUNX2上调导致的分子通路改变
对E11.5 BA、E13.5下颌和P5颅骨进行RNA-seq,进行差异表达分析和GSEA。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 小鼠构建 | IRES-EmGFP cassette | -- | -- |
| 免疫荧光 | RUNX2抗体 | Cell Signaling | 12556S |
| RUNX2抗体 | Santa Cruz | sc-390351 | |
| Osterix抗体 | Santa Cruz | sc-393325 | |
| Alexa-488偶联GFP抗体 | BioLegend | 338008 | |
| 流式细胞术 | DAPI | -- | -- |
| RNA-seq | Trizol试剂 | Thermo-Fisher | 15596026 |
| RT-qPCR | ProtoScript II | NEB | M0368L |
| SYBR Green | Biorad | 1725201 | |
| 组织学 | 伊红Y | Fisher Scientific | 17372871 |
| 脱钙液 | StatLab | 14141 | |
| 免疫组织化学 | SignalStain Boost检测试剂 | Cell Signaling | -- |
| SignalStain DAB底物 | Cell Signaling | -- | |
| 细胞培养 | 地衣芽孢杆菌蛋白酶 | Sigma | P5380 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 小鼠模型 | Runx2GFP等位基因的插入策略和genotyping方法 阅读提示:Materials and methods: Mice |
| 免疫荧光 | 一抗稀释比例和抗原修复条件 阅读提示:Materials and methods: Embryonic immunofluorescence and Antigen retrieval |
| 流式细胞术 | 组织解离条件和流式抗体 阅读提示:Materials and methods: Fluorescent reporter analyses and flow cytometry |
| 骨骼染色 | 固定和染色时间 阅读提示:Materials and methods: Alizarin red and alcian blue staining |
| 组织学分析 | 生长板厚度测量方法 阅读提示:Materials and methods: Immunofluorescence and immunohistochemistry quantitation |