检测BBB破坏和微胶质细胞活化
明确dMCAO后同侧丘脑VPN是否出现BBB破坏及其与微胶质活化的关系。
通过scRNA-seq分析细胞连接通路变化,免疫荧光检测白蛋白、IgG渗漏,TEM观察超微结构,Western blot检测紧密连接蛋白表达。
Targeting microglial C1q alleviates blood-brain barrier disruption in the thalamus after cortical infarction
包含多组学分析、scRNA-seq、细胞系实验、动物模型(dMCAO)及行为学等多层次验证,且进行了功能缺失和药物干预实验。
成年雄性SD大鼠dMCAO模型 BV2小胶质细胞系 大鼠原代丘脑微血管内皮细胞 C1q敲低或VCAM-1敲低大鼠模型
AAV-shC1qa注射时间:dMCAO前28天 AAV-shC1qa注射剂量:2 μL (0.4 μL病毒稀释于1.6 μL PBS) AAV-shC1qa注射坐标:VPN (3.6 mm posterior, 3.0 mm lateral to bregma, 6.0 mm depth) C1q中和抗体注射浓度:100 μg/mL,体积4 μL 米诺环素剂量:40 mg/kg/d,腹腔注射,术后30分钟内开始
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
明确dMCAO后同侧丘脑VPN是否出现BBB破坏及其与微胶质活化的关系。
通过scRNA-seq分析细胞连接通路变化,免疫荧光检测白蛋白、IgG渗漏,TEM观察超微结构,Western blot检测紧密连接蛋白表达。
确定C1q在丘脑VPN中的细胞来源及其表达变化。
利用bulk RNA-seq和蛋白质组学筛选通路,qRT-PCR和Western blot验证C1qa/b/c表达,scRNA-seq和免疫荧光共定位确定C1q主要来自M6微胶质亚型。
阐明M6微胶质亚型的分化轨迹及其特异性基因表达特征。
利用Monocle 2对scRNA-seq数据进行假时序分析,揭示M6亚型的分化轨迹和补体基因表达模式。
验证敲低小胶质细胞C1q是否能减轻BBB破坏和继发性丘脑损伤。
通过AAV-shC1qa在VPN敲低C1q,检测BBB通透性、紧密连接蛋白、神经元死亡、胶质活化及神经行为学。
验证C1q是否通过CD93激活内皮细胞并上调VCAM-1。
CellChat分析预测相互作用,免疫共沉淀验证C1q-CD93结合,检测CD93和VCAM-1表达,体外共培养实验验证C1q上调VCAM-1。
确认CD93和VCAM-1在BBB破坏中的必要性。
使用CD93抑制剂DCBY02或AAV-shVCAM-1敲低VCAM-1,观察BBB相关蛋白和渗漏的变化。
检验米诺环素能否通过抑制C1q和VCAM-1改善BBB完整性和神经功能。
分子对接预测米诺环素-C1q结合,体内给予米诺环素检测C1q、VCAM-1、紧密连接蛋白表达,BBB渗漏,神经元存活和行为学。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物模型 | 异氟烷 | -- | -- |
| BBB通透性检测 | 伊文思蓝 | Sigma-Aldrich | -- |
| 免疫荧光 | 抗白蛋白抗体 | -- | -- |
| 抗IgG抗体 | Merck | AP124C | |
| 抗纤维蛋白原抗体 | Proteintech | 15841-1-AP | |
| 抗CD8a抗体 | Abcam | ab33786 | |
| 抗Iba-1抗体 | Wako | 019-19741 | |
| 抗NeuN抗体 | Millipore | MAB377 | |
| 抗GFAP抗体 | Millipore | MAB360 | |
| 抗C1q抗体 | Abcam | ab182451 | |
| 抗VCAM-1抗体 | Abcam | ab134047 | |
| 抗CD93抗体 | Santz crus | sc-365172 | |
| 抗RECA-1抗体 | Abcam | ab9774 | |
| DAPI | Solarbio | S2110 | |
| Western blot | 抗ZO-1抗体 | Proteintech | 21773-1-AP |
| 抗occludin抗体 | Proteintech | 27260-1-AP | |
| 抗VE-cadherin抗体 | Immunoway | YT4869 | |
| 抗C1qa抗体 | Santz crus | sc-58920 | |
| 抗C1qb抗体 | Signalway Antibody | 40660 | |
| 抗C1qc抗体 | Signalway Antibody | 34608 | |
| 抗CD93抗体 | Santz crus | sc-365172 | |
| 抗VCAM-1抗体 | Abcam | ab134047 | |
| 抗ICAM-1抗体 | Immunoway | YT2269 | |
| 抗GAPDH抗体 | Proteintech | 60004-I-Ig | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | C11995500BT |
| 胎牛血清 | Gibco | 10270-106 | |
| 青霉素/链霉素 | Gibco | 15070063 | |
| 脂多糖 | MedchemExpress | HY-D1056 | |
| 重组C1q蛋白 | Medchemexpress | HY-NP0194C | |
| C1q中和抗体 | GeneTex | GTX54404 | |
| 内皮细胞生长补充剂 | Sciencell | 1052 | |
| 药物处理 | DCBY02 | Medchemexpress | HY-P990572 |
| 米诺环素 | Medchemexpress | HY-17412 | |
| qRT-PCR | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| SYBR Green预混液 | Roche | -- | |
| Western blot | BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | -- |
| 免疫沉淀 | 蛋白G琼脂糖珠 | Millipore | IP05 |
| 动物实验 | AAV-shC1qa | GeneChem | -- |
| AAV-shVCAM-1 | GeneChem | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| dMCAO模型 | 大鼠品系(SD)、性别(雄性)、体重(280-320g)、电凝方法、麻醉维持(异氟烷1.5-2.5%) 阅读提示:Materials and methods: Animals, Distal middle cerebral artery occlusion model |
| BBB检测 | 检测时间点(1-4周)、白蛋白和IgG渗漏面积、紧密连接蛋白表达量 阅读提示:Results: BBB disruption and microglial activation; Figure 1; Materials and methods: Evaluation of BBB disruption |
| scRNA-seq | 样本数(n=4/组)、细胞活力>90%、质控标准(基因数>200, UMI>1000, 线粒体<15%) 阅读提示:Materials and methods: Single cell RNA sequencing |
| AAV-shC1qa注射 | 病毒滴度(9.9×10^12 vg/mL)、注射体积(2 μL)、坐标(VPN)、术前28天 阅读提示:Materials and methods: Adeno-associated virus construction and administration; Figure 5A |
| AAV-shVCAM-1注射 | 病毒滴度(5.58×10^13 vg/mL)、注射体积(150 μL)、尾静脉注射、术前28天 阅读提示:Materials and methods: Adeno-associated virus construction and administration; Figure 8A |
| C1q中和抗体注射 | 抗体浓度(100 μg/mL)、体积(4 μL)、注射部位(VPN) 阅读提示:Materials and methods: C1q neutralization in vivo |
| DCBY02处理 | 给药方式(脑室内)、剂量(未明确)、时间(术前3天开始,每日一次,持续14天)、溶剂(5% DMSO) 阅读提示:Materials and methods: Pharmacologic interventions; Figure 7G |
| 米诺环素处理 | 给药剂量(40 mg/kg/d,腹腔注射)、时间(术后30分钟内开始,每日一次,持续14天) 阅读提示:Materials and methods: Pharmacologic interventions; Figure 9C |
| 行为学评估 | 测试时间点(术后1、7、14天)、MWM训练时间(术后第9天开始,连续5天)、平台位置(Q4) 阅读提示:Materials and methods: Neurobehavioral assessments |