评估EGFR和HER3的表达模式
通过多组学数据分析和IHC,确定EGFR和HER3在前列腺癌不同亚型中的表达水平,以评估其作为治疗靶点的可行性。
分析了TCGA、CPGEA、SU2C、FHCRC等公共数据集中的基因组和转录组数据,以及70例CRPC患者肿瘤组织的IHC染色,比较了CRPC腺癌与神经内分泌亚型中的表达差异。
EGFR- and HER3-targeted bispecific antibody-drug conjugate demonstrates anti-tumor activity in metastatic castration-resistant prostate cancer
包含多组学分析、细胞系实验、异种移植瘤模型、患者来源类器官(PDOs)和临床病例,并进行了功能验证和耐药机制研究。
前列腺癌细胞系C4-2、LNCaP、22Rv1、DU145、PC-3 C4-2和LNCaP异种移植瘤模型 患者来源类器官(PDOs) mCRPC患者(代表病例)
EGFR和HER3在CRPC亚型中的表达(通过IHC和RNA分析) BL-B01D1在细胞系和PDO中的靶点依赖性细胞毒性 BL-B01D1在异种移植瘤中的抗肿瘤效果 ABCG2在获得性耐药中的功能验证(CRISPR敲除和过表达)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
通过多组学数据分析和IHC,确定EGFR和HER3在前列腺癌不同亚型中的表达水平,以评估其作为治疗靶点的可行性。
分析了TCGA、CPGEA、SU2C、FHCRC等公共数据集中的基因组和转录组数据,以及70例CRPC患者肿瘤组织的IHC染色,比较了CRPC腺癌与神经内分泌亚型中的表达差异。
评估BL-B01D1在体外对前列腺癌细胞系的细胞毒性,并确定其是否靶点依赖。
在多种前列腺癌细胞系(C4-2、LNCaP、22Rv1、DU145、PC-3)中,用BL-B01D1处理,检测细胞活力;通过过表达或敲低EGFR/HER3,验证靶点依赖性。
在异种移植瘤模型中评估BL-B01D1的体内抗肿瘤效果。
将前列腺癌细胞接种到裸鼠皮下,待肿瘤生长至约150 mm³后,随机分组给予BL-B01D1或同型IgG ADC(10 mg/kg,每周一次,静脉注射),监测肿瘤体积和体重变化。
在PDO模型中评估BL-B01D1的抗肿瘤活性,并验证其预测临床反应的能力。
从两位患者的肿瘤组织建立PDO,并用BL-B01D1处理,评估细胞活力、类器官大小和细胞死亡。
探索BL-B01D1获得性耐药的机制,并验证ABCG2的作用。
通过逐渐增加BL-B01D1浓度建立22Rv1耐药亚系,进行RNA-seq分析鉴定差异表达基因,并通过CRISPR敲除、过表达和ABCG2抑制剂(Ko143)验证ABCG2的功能。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI1640培养基 | Gibco | -- |
| DMEM培养基 | Gibco | -- | |
| 胎牛血清 | Gibco | A5256701 | |
| 青霉素-链霉素 | Meilunbio | MA0110 | |
| 支原体检测试剂盒 | Yeasen | 40612ES60 | |
| 免疫组织化学 | EDTA抗原修复液 | Beyotime | P0084 |
| HRP标记二抗 | Abclonal | RK50015 | |
| DAB显色试剂 | Servicebio | G1212-200T | |
| IXplore SpinSR显微镜 | Olympus | -- | |
| DMi8显微镜 | Leica | -- | |
| 质粒和慢病毒转染 | 聚凝胺 | Sigma | TR-1003-G |
| 嘌呤霉素 | Meilunbio | MA0318 | |
| 潮霉素 | Meilunbio | MA0210 | |
| RT-qPCR | RNA小提试剂盒 | Sangon Biotech | B618133 |
| PrimeScript RT预混液 | Takara | RR036B | |
| SYBR qPCR预混液 | Vazyme | Q711-02 | |
| LightCycler 480 II实时荧光定量PCR仪 | Roche | -- | |
| 类器官培养 | 胶原酶II | Solarbio | C8150 |
| TrypLE消化液 | Gibco | 12605-010 | |
| Epcam抗体(369813) | Biolegend | 369813 | |
| 基质胶 | D1Med | D23016-0010 | |
| Y-27632(ROCK抑制剂) | GLPBIO | GC10512 | |
| 细胞冻存液 | -- | -- | |
| 类器官复苏液 | D1Med | D23040-0100 | |
| 类器官功能检测 | CellTiter-Glo 3D细胞活力检测试剂盒 | Promega | G9683 |
| 钙黄绿素-AM | Yeasen | 40719ES50 | |
| 碘化丙啶 | Thermo | P3566 | |
| 动物实验 | BL-B01D1 | -- | -- |
| 同型IgG ADC | -- | -- | |
| RNA-seq | TRIzol试剂 | Invitrogen | 15596026 |
| Bioanalyzer 2100生物分析仪 | Agilent | -- | |
| NovaSeq 6000测序仪 | Illumina | -- | |
| 细胞培养 | BL-B01D1 | -- | -- |
| SI-B001 | -- | -- | |
| 同型IgG ADC | -- | -- | |
| Ed-04 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞系模型 | 细胞系来源、培养条件、EGFR/HER3表达水平、BL-B01D1处理浓度和时间 阅读提示:Methods: Cell lines; Results: Antitumor activity of BL-B01D1 in in vitro... |
| 异种移植模型 | 小鼠品系、细胞接种数量、肿瘤体积阈值、给药剂量(10 mg/kg)和频率(每周一次)、给药方式(静脉注射) 阅读提示:Results: Antitumor activity of BL-B01D1 in in vivo...; Methods: Animal experiments |
| 患者来源类器官(PDO) | PDO建立方法、培养条件、BL-B01D1处理浓度(100 nM)和处理时间(6天)、检测方法(Calcein-AM/PI染色、CellTiter-Glo) 阅读提示:Methods: Prostate cancer organoid culture and functional assays; Results: Antitumor activity of BL-B01D1 in PDO models |
| 耐药机制 | 耐药细胞系建立方法、ABCG2敲除和过表达方法、Ko143浓度、IC50计算 阅读提示:Results: ABCG2 as a potential target to overcome BL-B01D1 resistance; Methods |