检测MD患者和EH小鼠模型中的氧化应激和STING激活
验证MD患者和LPS诱导EH小鼠模型中是否存在氧化应激、胞质DNA泄漏和STING通路激活。
使用DHE染色检测VEOs和BM/ampullae中的ROS水平,TEM观察线粒体损伤,IF检测胞质dsDNA,WB检测cGAS-STING通路蛋白表达,qRT-PCR检测ISG表达。
STING signaling in vestibular macrophages underlies Ménière's disease pathogenesis
涵盖患者样本、LPS诱导小鼠模型、体外细胞共培养、分子机制及体内基因敲除验证等多个独立证据层级,进行功能与机制验证。
人前庭终器(壶腹嵴、椭圆囊斑) LPS诱导的内淋巴积水小鼠模型 HEI-OC1细胞系 前庭常驻巨噬细胞样(VRML)细胞
MD患者和VS对照组的样本量、年龄、性别匹配 LPS剂量(2 mg/kg)及给药方式(耳后注射,连续3天) StingcKO、Cul4bcKO及双敲除小鼠的构建及验证 H2O2处理浓度(500 µM)及时间(24小时) dsDNA转染浓度(2 µg/mL)及时间(24小时)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证MD患者和LPS诱导EH小鼠模型中是否存在氧化应激、胞质DNA泄漏和STING通路激活。
使用DHE染色检测VEOs和BM/ampullae中的ROS水平,TEM观察线粒体损伤,IF检测胞质dsDNA,WB检测cGAS-STING通路蛋白表达,qRT-PCR检测ISG表达。
确定氧化应激的毛细胞释放的dsDNA是否被巨噬细胞吞噬并激活其STING通路。
用H2O2处理HEI-OC1细胞,分离胞质dsDNA并转染VRML细胞,检测STING通路激活、ISG表达、细胞凋亡。通过transwell共培养观察VRML细胞对EdU标记的HEI-OC1细胞DNA的吞噬,并检测ISG表达。
验证巨噬细胞特异性Sting敲除是否能减轻LPS诱导的EH和听觉-前庭损伤。
使用StingcKO小鼠和对照小鼠,通过LPS诱导EH模型,评估EH程度(IR-L)、ABR阈值位移、DPOAE振幅、VOR增益、VEMP潜伏期、转棒和旷场实验,以及EP、SV厚度、毛细胞凋亡、立体纤毛形态、核糖突触数量和ISG表达。
确定STING与CRL4B复合物的相互作用,以及CRL4B是否通过泛素化调节STING的稳定性。
通过IP-MS鉴定STING相互作用蛋白,Co-IP验证STING与DDB1等蛋白的结合,GST pull-down确定结合结构域,IF检查共定位。在THP-1细胞中敲低CUL4B,检测STING通路激活和ISG表达。通过Co-IP和LC-MS/MS鉴定STING的泛素化位点,并验证K370点突变对泛素化的影响。
验证CUL4B缺陷是否通过STING加重LPS诱导的EH和听觉-前庭功能障碍,并确认其作用依赖于STING。
使用Cul4bcKO和StingcKOCul4bcKO双敲除小鼠,通过LPS诱导EH模型,评估EH程度、ABR阈值位移、VOR增益、VEMP潜伏期、转棒和旷场实验,以及ISG表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 黑色素细胞培养基 | Sciencell | 2201 |
| 青霉素/链霉素 | Gibco | 15140122 | |
| DMEM培养基 | Gibco | 12491015 | |
| 胎牛血清 | Gibco | A5669701 | |
| RPMI-1640培养基 | Gibco | 11875119 | |
| THP-1细胞 | Procell | CL-0233 | |
| 细胞转染 | Lipofectamine RNAiMAX试剂 | Invitrogen | 13778-150 |
| PEIpro转染试剂 | Polyplus | 115-0015 | |
| 药物处理 | 过氧化氢 | -- | mi88597 |
| EdU(5-乙炔基-2'-脱氧尿苷) | beyotime | C0071S | |
| cGAMP | Invitrogen | tlrl-nacga23 | |
| MG132 | MCE | HY-13259 | |
| 组织染色 | DHE(二氢乙锭)荧光探针 | Thermo Fisher Scientific | D1168 |
| 组织培养 | Cell-Tak粘附剂 | Corning | 354240 |
| 组织处理 | 三磷酸腺苷 | Gibco | 11320033 |
| 免疫荧光 | 抗dsDNA抗体 | Abcam | ab27156 |
| 抗TOMM20抗体 | Abcam | ab78547 | |
| 抗STING抗体 | Thermo Fisher Scientific | PA5-20782 | |
| 抗IBA1抗体 | Abcam | ab5076 | |
| 抗CD68抗体 | Proteintech | 28058-1-AP | |
| 抗MYO7A抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-74516 | |
| 抗CtBP2抗体 | BD | 612044 | |
| 抗CUL4B抗体 | Sigma-Aldrich | C9995 | |
| 抗DDB1抗体 | Proteintech | 11380-1-AP | |
| Prolong Gold抗淬灭封片剂(含DAPI) | Invitrogen | P36931 | |
| 凋亡检测 | TUNEL染色试剂盒 | Invitrogen | C10617 |
| qRT-PCR | Trizol试剂 | Invitrogen | -- |
| SYBR Premix Ex Taq | TaKaRa Bio | RR420A | |
| Western blot | 抗TBK1抗体 | Abcam | ab40676 |
| 抗磷酸化TBK1抗体 | Cell Signaling Technology | 5483 | |
| 抗IRF3抗体 | Abcam | ab68481 | |
| 抗磷酸化IRF3抗体 | Cell Signaling Technology | 29047 | |
| 抗STING抗体 | Cell Signaling Technology | 13647 | |
| 抗磷酸化STING抗体 | Cell Signaling Technology | 50907 | |
| 抗ROC1抗体 | Proteintech | 14895-1-AP | |
| 抗泛素抗体 | Cell Signaling Technology | 3936 | |
| 抗K48链接泛素抗体 | Cell Signaling Technology | 12805 | |
| 抗K63链接泛素抗体 | Cell Signaling Technology | 5621 | |
| 抗肌动蛋白抗体 | Thermo Fisher Scientific | MA5-11869 | |
| SuperSignal West Pico PLUS化学发光底物 | Thermo Fisher Scientific | 34579 | |
| 流式细胞术 | Annexin V-FITC凋亡检测试剂盒 | BD Biosciences | 556547 |
| dsDNA提取 | 线粒体分离试剂盒 | Thermo Fisher | 89801 |
| dsDNA纯化 | Monarch PCR和DNA纯化试剂盒 | New England Biolabs | T1030S |
| dsDNA定量 | PicoGreen定量试剂盒 | Thermo Fisher | P7589 |
| 动物实验 | 脂多糖 | Sigma | -- |
| Nanoliter 2000微操纵器 | WPI | Micro2T | |
| 玻璃微电极 | WPI | 504949 | |
| 组织粘合剂 | 3M | 1469SB | |
| 行为学测试 | 电动转棒仪 | Huaibei Zhenghua Biological Instruments Co., Ltd. | ZH-600B |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 患者样本收集 | MD患者(n=15)和VS对照组(n=12)的年龄、性别、诊断标准 阅读提示:Materials and methods - Patients and tissue samples |
| EH小鼠模型构建 | LPS剂量(2 mg/kg)、给药途径(耳后注射)、给药频率(每日一次,连续3天)、小鼠品系(C57BL/6,雄性,6-8周龄)、评估时间点(第5天) 阅读提示:Materials and methods - Animal studies, Results - 1 |
| 细胞培养和处理 | H2O2浓度(500 µM)、处理时间(24小时)、EdU浓度(10 µM)、cGAMP浓度(2 µg/mL)、MG132浓度(25 µM) 阅读提示:Materials and methods - Cell culture and transfection |
| dsDNA转染实验 | dsDNA来源(H2O2处理HEI-OC1细胞)、转染浓度(2 µg/mL)、转染时间(24小时)、转染试剂(PEIpro) 阅读提示:Materials and methods - Cytosolic dsDNA isolation and transfection |
| 体外共培养实验 | transwell孔径(0.4 μm)、细胞比例、H2O2处理 阅读提示:Materials and methods - Detection of EdU phagocytosis by VRML cells in transwell co-culture system |
| 基因敲除小鼠模型 | StingcKO小鼠构建(Lyz2-Cre;Stingflox/flox)、Cul4bcKO小鼠构建(Lyz2-Cre;Cul4bflox/Y)、双敲除小鼠品系 阅读提示:Materials and methods - Animal studies, Results - 3, 6 |
| 内淋巴积水评估 | IR-L测量方法、耳蜗半圈划分(I-IV)、Reissner膜长度测量 阅读提示:Materials and methods - Quantitative assessment of changes in endolymphatic space in cochlea |
| 听力功能评估 | ABR刺激频率(点击声和4、8、12、16、24、32 kHz)、DPOAE频率(12 kHz和16 kHz)、EP测量方法 阅读提示:Materials and methods - Auditory brainstem evaluation, DPOAE, Endocochlear potential measurement |
| 前庭功能评估 | VOR测试频率(0.2-1.6 Hz)、VEMP刺激强度(100 dB nHL)、行为学测试参数 阅读提示:Materials and methods - Vestibular evoked myogenic potentials, VOR, Rotarod test, Open field test |
| 生化分析 | STING抗体克隆号、CUL4B抗体克隆号、cGAMP和MG132处理时间 阅读提示:Materials and methods - Western blot, Co-immunoprecipitation |