LepR表达谱鉴定
确定瘦素受体在心脏中的细胞类型特异性表达。
通过RNA-seq数据分析、流式细胞术和免疫组化,验证LepR在心脏成纤维细胞中的表达。
Leptin Receptor Fibroblasts Are Preferential Contributors to Cardiac Fibrosis
研究包含谱系追踪、细胞消融、RNA-seq、ATAC-seq、体外刺激、人类样本验证等多层级证据,并进行了功能验证和机制验证。
小鼠心肌梗死模型 小鼠横向主动脉缩窄模型 小鼠原代心脏成纤维细胞 人类心脏组织样本
LepR-Cre小鼠品系 LepR-CreERT2小鼠品系 Rosa-tdTomato报告小鼠 Col1a1-GFP报告小鼠 MIRI手术及 sham 对照
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定瘦素受体在心脏中的细胞类型特异性表达。
通过RNA-seq数据分析、流式细胞术和免疫组化,验证LepR在心脏成纤维细胞中的表达。
研究LepR+成纤维细胞的出现和扩增时间。
通过免疫荧光和RNAscope分析不同发育阶段心脏中LepR+细胞的出现和分布。
揭示LepR+成纤维细胞与间质成纤维细胞的分子差异。
通过RNA-seq和ATAC-seq比较LepR-Cre+与LepR-Cre-成纤维细胞的转录和表观遗传特征。
验证LepR+成纤维细胞对瘦素的反应性。
体外刺激分选的成纤维细胞,检测STAT3磷酸化;分析瘦素敲除小鼠中LepR+成纤维细胞的转录变化。
研究LepR+成纤维细胞在心肌梗死后的扩增和贡献。
对LepR-Cre谱系小鼠进行心肌梗死手术,分析瘢痕中LepR-Cre+细胞的比例和增殖。
评估LepR+成纤维细胞消融对心功能和纤维化的影响。
通过LepR-Cre; Rosa-iDTR小鼠注射白喉毒素消融LepR+细胞,然后进行心肌梗死,评估心功能和瘢痕大小。
验证LepR+成纤维细胞在人类心脏中的存在和定位。
分析人类冠状动脉单细胞RNA-seq数据,并进行RNAscope和免疫荧光验证。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| RNA-seq | Qiazol裂解液 | Qiagen | 79306 |
| miRNeasy微型试剂盒 | Qiagen | 217084 | |
| TapeStation系统 | Agilent | -- | |
| TruSeq链式mRNA文库制备试剂盒 | Illumina | 20020594 | |
| HiSeq 4000系统 | Illumina | -- | |
| ATAC-seq | ActiveMotif ATAC-seq试剂盒 | ActiveMotif | 53150 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| LepR表达鉴定 | LepR-Cre、Rosa-tdTomato、Col1a1-GFP等鼠系的遗传背景和组合 阅读提示:详见Methods:Animal Models |
| 细胞培养和刺激 | 成纤维细胞分离步骤、培养条件、瘦素刺激浓度和时间 阅读提示:详见Methods:Isolation of Murine CFs及补充材料 |
| 心肌梗死模型 | 手术方式、梗死面积评估、时间点 阅读提示:详见Results及Figure 5 legend |
| 细胞消融实验 | DT给药剂量、时间、途径 阅读提示:详见Methods及Figure 6 legend |
| 测序分析 | 分选策略、测序平台、差异表达分析参数 阅读提示:详见Methods:RNA-Seq及ATAC-seq |