检测EHD1在斑块中的表达
确定EHD1表达是否与动脉粥样硬化进展相关
对小鼠主动脉根部切片和人冠状动脉切片进行免疫荧光染色,检测EHD1与巨噬细胞标志物共定位;利用公开scRNA-seq数据分析EHD1在巨噬细胞亚群中的表达。
Macrophage EHD1 Promotes Inflammation and Stabilizes Sortilin to Accelerate Atherosclerosis
研究包含骨髓移植动物模型、scRNA-seq、体外细胞机制实验、免疫荧光和生化实验等多个独立证据层级,并包含功能验证与机制验证。
骨髓来源巨噬细胞(BMDM) Ldlr−/−小鼠骨髓移植动脉粥样硬化模型 人冠状动脉粥样硬化组织样本 小鼠主动脉CD45+细胞
骨髓移植:WT或Ehd1−/−骨髓细胞移植到辐照Ldlr−/−小鼠,恢复6周后Western diet喂养12周 细胞处理:BMDMs用LPS(100 ng/mL)或oxLDL(50 μg/mL)处理 NF-kB抑制:Bay 11-7082(2 μM)预处理1小时 TNFR2回收实验:抗体触发的内吞测定,酸洗除未内化受体,追踪3h和6h CHX追踪:10 μg/mL CHX处理,存在或不存在100 nM Baf
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定EHD1表达是否与动脉粥样硬化进展相关
对小鼠主动脉根部切片和人冠状动脉切片进行免疫荧光染色,检测EHD1与巨噬细胞标志物共定位;利用公开scRNA-seq数据分析EHD1在巨噬细胞亚群中的表达。
确定促炎刺激对EHD1表达的调节作用
用siRNA敲低EHD1或对照,然后用LPS或oxLDL处理BMDMs,检测EHD1蛋白和mRNA水平。
确定造血细胞EHD1缺失对动脉粥样硬化进展的影响
将WT或Ehd1−/−骨髓细胞移植到辐照Ldlr−/−小鼠,Western diet喂养12周后分析主动脉根部病变大小、巨噬细胞浸润、坏死核心和纤维帽厚度。
揭示EHD1缺失对主动脉免疫细胞转录组和细胞间相互作用的影响
对移植WT或Ehd1−/−骨髓的Ldlr−/−小鼠主动脉CD45+细胞进行scRNA-seq,分析细胞簇组成、差异表达基因和细胞间相互作用。
确定EHD1是否直接调节巨噬细胞炎症反应
siRNA敲低或敲除EHD1,LPS处理,检测NF-kB活性(p-P65)、炎症因子表达;使用NF-kB抑制剂Bay 11-7082验证EHD1的作用是否依赖NF-kB。
确定EHD1是否通过调节TNFR2回收影响NF-kB信号
流式细胞术检测TNFR2、CD36、TLR4表面水平;进行TNFR2脉冲-追踪实验评估回收率;免疫荧光检测主动脉巨噬细胞TNFR2水平。
确定EHD1是否通过retromer稳定sortilin
免疫共沉淀检测EHD1、sortilin、VPS26α的相互作用;检测EHD1缺陷对sortilin蛋白和mRNA水平的影响;CHX追踪实验评估sortilin降解速率。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 免疫荧光染色 | ProLong™ Gold抗淬灭封片剂 | -- | -- |
| DAPI | -- | -- | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| L-929成纤维细胞条件培养基 | -- | -- | |
| siRNA转染 | RNAiMAX转染试剂 | -- | -- |
| 药物处理 | 脂多糖 | -- | -- |
| 氧化低密度脂蛋白 | -- | -- | |
| Bay 11–7082 | -- | -- | |
| 免疫印迹 | 2x Laemmli样品缓冲液 | -- | -- |
| 4–20% Tris凝胶 | -- | -- | |
| 0.45 μm硝酸纤维素膜 | -- | -- | |
| 流式细胞术 | CellStripper缓冲液 | -- | -- |
| Fc受体阻断剂 | -- | -- | |
| FACS缓冲液 | -- | -- | |
| Canto II流式细胞仪 | -- | -- | |
| RT-qPCR | RNeasy试剂盒 | -- | -- |
| High-Capacity cDNA逆转录试剂盒 | -- | -- | |
| SYBR Green预混液 | -- | -- | |
| LightCycler 480 II实时荧光定量PCR系统 | Roche | -- | |
| TNFR2脉冲追踪实验 | 抗TNFR2抗体 | -- | -- |
| Alexa Fluor 568标记的山羊抗兔抗体 | -- | -- | |
| RNA-seq | RNeasy Mini试剂盒 | Qiagen | -- |
| DNBSEQ G400测序仪 | -- | -- | |
| scRNA-seq | 10X Genomics Chromium平台 | -- | -- |
| 动物实验 | 异氟烷 | -- | -- |
| 脂质分析 | 商业检测试剂盒 | -- | -- |
| 免疫荧光染色 | 蔡司荧光显微镜 | Zeiss | -- |
| ImageJ软件 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型 | 骨髓移植:WT或Ehd1−/−骨髓细胞移植到辐照Ldlr−/−小鼠,恢复6周,WD喂养12周 阅读提示:Methods: Animal atherosclerotic studies; Figure 2 legend |
| 细胞培养与处理 | BMDMs分化条件(DMEM, 10% FBS, 1% P/S, 20% L-929条件培养基,5-7天);LPS处理浓度和时间;oxLDL处理浓度和时间;Bay 11-7082预处理浓度和时间 阅读提示:Methods: BMDM culture and treatment; Results: Figures 1E-1H, 3 |
| TNFR2回收实验 | 抗体触发的内吞测定:抗TNFR2抗体孵育,37°C内化,酸洗,追踪时间(3h和6h) 阅读提示:Methods: TNFR2 pulse-chase assay; Figure 4E legend |
| sortilin稳定性实验 | CHX处理浓度(10 μg/mL)和时间;Baf浓度(100 nM);是否用oxLDL处理 阅读提示:Methods: 描述于Supplemental Material; Figure 5D-5E legend |
| NF-kB活性检测 | LPS处理时间(18h或24h,根据实验);p-P65检测;Bay 11-7082预处理浓度(2 μM)和时间(1h) 阅读提示:Methods: 描述于Supplemental Material; Figures 3B-3F |
| 流式细胞术 | 细胞表面TNFR2检测;Fc block孵育条件;抗体孵育条件(4°C, 30分钟);FACS buffer组成(2% FBS, 2 mM EDTA in PBS) 阅读提示:Methods: Flow cytometry analysis; Figure 4A-4B legend |