构建饮食诱导的肥胖、体重减轻和体重循环模型
在C57BL/6J小鼠中建立稳定肥胖、体重循环和体重减轻模型,以研究体重史对脂肪组织T细胞记忆和代谢的影响。
将8-9周龄雄性WT和CD70−/−小鼠分为四组:瘦素、肥胖、体重循环(体重循环)和体重减轻组,采用27周周期的高脂/低脂饮食方案。
Interrupting T-Cell Memory Ameliorates Exaggerated Metabolic Response to Weight Cycling
多组学(scRNA-seq、CITE-seq、V(D)J测序)、流式细胞术、组织学、代谢表型(GTT、体成分)和基因敲除动物体内功能验证相结合,证据层级独立。
C57BL/6J小鼠饮食诱导肥胖、体重循环、体重减轻模型 CD70基因敲除小鼠(CD70−/−) 小鼠附睾脂肪组织基质血管组分
饮食方案:27周周期,9周高脂或低脂饮食交替 基因型:CD70−/−与野生型同窝对照 口服葡萄糖耐量测试:葡萄糖剂量3.5 g/kg去脂体重,禁食5小时 单细胞测序:CD45+细胞分选,目标每饮食组20,000个细胞 数据分析:MiloR差异丰度,edgeR差异表达,调整P<0.05且|log2FC|>1
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
在C57BL/6J小鼠中建立稳定肥胖、体重循环和体重减轻模型,以研究体重史对脂肪组织T细胞记忆和代谢的影响。
将8-9周龄雄性WT和CD70−/−小鼠分为四组:瘦素、肥胖、体重循环(体重循环)和体重减轻组,采用27周周期的高脂/低脂饮食方案。
比较不同饮食和基因型条件下脂肪组织T细胞亚群组成、克隆性和记忆标志物表达。
从附睾脂肪组织中分离CD45+细胞,进行scRNA-seq、CITE-seq以及V(D)J测序,鉴定T细胞亚群、克隆扩增和记忆基因特征。
确定CD70缺失对体重循环和稳定肥胖条件下体成分和葡萄糖耐量的影响。
使用核磁共振分析仪测量体成分,并在饮食阶段结束时通过口服葡萄糖耐量测试评估葡萄糖耐量。
评估CD70缺失对肥胖和体重循环条件下脂肪组织免疫细胞组成和细胞间通讯的影响,寻找代谢改善的免疫基础。
对WT和CD70−/−不同饮食组小鼠的附睾脂肪组织CD45+细胞进行scRNA-seq,分析免疫细胞比例,并使用CellChat推断细胞间相互作用。
进一步验证CD70缺失对体重减轻过程中T细胞亚群和克隆扩增的影响,探究免疫记忆形成是否受损。
从体重减轻组小鼠附睾脂肪组织中分选CD4+和CD8+ T细胞,进行scRNA-seq和V(D)J测序,分析T细胞组成和克隆性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 脂肪组织消化 | II型胶原酶 | Sigma-Aldrich | C6885 |
| 单细胞测序 | IV型胶原酶 | Worthington Biochemical | LS004189 |
| 抗小鼠Fc阻断剂 | BD Biosciences | -- | |
| TotalSeq-C hashtag抗体 | BioLegend | -- | |
| 抗CD45磁珠 | Miltenyi Biotec | 130-110-608 | |
| OctoMACS分离器 | Miltenyi Biotec | -- | |
| 10X Chromium平台 | 10X Genomics | -- | |
| Illumina NovaSeq6000测序仪 | Illumina | -- | |
| 流式细胞术 | FACSAria III流式细胞分选仪(带BioProtect IV安全罩) | Baker | -- |
| MACSQuant10流式细胞仪 | Miltenyi Biotec | -- | |
| 抗小鼠CD45抗体(克隆30-F11) | BioLegend | 103137 | |
| 抗小鼠CD4抗体(克隆RM4-4) | BioLegend | 116022 | |
| 抗小鼠CD8抗体(克隆53-6.7) | BioLegend | 100707 | |
| 单细胞测序 | Chromium Next GEM单细胞5' HTv2试剂盒 | 10X Genomics | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型与饮食方案 | 小鼠品系:C57BL/6J;基因型:WT和CD70−/−;饮食方案:27周周期,9周高脂或低脂饮食交替;开始周龄:8-9周;分组:lean, obese, WC, WL 阅读提示:Methods: Animals and Experimental Design; Figure 3A |
| 葡萄糖耐量测试 | 禁食时间:5小时;葡萄糖剂量:3.5 g/kg去脂体重;给药方式:口服灌胃;检测时间点:第8、17、26周;样本量:每组26-30只 阅读提示:Methods: Glucose Tolerance Testing; Figure 4A |
| 单细胞测序 | 组织:附睾脂肪;细胞分选:CD45+;目标细胞数:每饮食组20,000个细胞;测序平台:10X Chromium,NovaSeq6000;测序深度:50,000 reads/细胞,PE-150;批次控制:所有肥胖和体重循环样本同一天处理;分析软件版本:CellRanger 7.0.1, Seurat 5.1, Harmony 阅读提示:Methods: Single-Cell Sequencing, Single-Cell RNA-Seq Data Processing, Dimensional Reduction and Data Integration |
| T细胞受体测序 | 方法:V(D)J测序;数据处理:CellRanger 7.0.1,过滤productive TCR,保留最多reads的TCR;分析:克隆分组(单克隆、低克隆【2个细胞】、中克隆【3-6个细胞】、高克隆【>6个细胞】) 阅读提示:Methods: Immune Receptor Data Processing; Results; Figure 2 legend |
| 流式细胞术 | 抗体:CD45 (clone 30-F11), CD4 (clone RM4-4), CD8 (clone 53-6.7);数据收集:MACSQuant10;分析软件:FlowJo;门控策略:Supplementary Fig. 3 阅读提示:Methods: Flow Cytometry; Supplementary Fig. 3 |