ClinGen重症联合免疫缺陷病变异解读专家小组规范：ADA、DCLRE1C、IL2RG、IL7R、JAK3、RAG1和RAG2基因变异分类标准

目的：本研究由临床基因组资源重症联合免疫缺陷病变异解读专家组（ClinGen SCID-VCEP）牵头，旨在实施并调整美国医学遗传学与基因组学学院/分子病理学协会（ACMG/AMP）指南，用于解读与SCID明确相关基因的生殖系变异。研究重点关注北美SCID新生儿筛查中识别出的7个最常见SCID相关基因：ADA、DCLRE1C、IL2RG、IL7R、JAK3、RAG1和RAG2。方法：SCID-VCEP对变异进行了严格审查，包括数据库分析、文献综述和专家反馈，以制定针对特定基因的ACMG/AMP指南调整方案。这些调整方案通过包含90个变异的试点集进行了验证。结果：在这90个变异中，25个被归类为致病性，21个为可能致病性，14个为意义不明确变异（VUS），18个为可能良性，12个为良性。成功解决了ClinVar中17个分类存在冲突的变异。调整内容涉及28项原始ACMG/AMP标准中的20项，专门针对SCID相关基因进行了修改。结论：SCID-VCEP制定的SCID特异性变异解读指南将提高SCID基因诊断的准确性，并为解读SCID相关基因变异提供可靠框架，有助于SCID的适宜治疗。