源自干细胞和祖细胞的基因表达特征对骨髓纤维化患者生存具有预后价值

在本研究中，我们假设疾病驱动的造血干细胞和祖细胞（HSPC）的转录组学特征能够改进当前骨髓纤维化（MF）风险分层的范式。为此，我们对358例MF患者的血液进行了批量RNA测序（RNA-seq），并将其分为训练队列和测试队列。利用来自Lin-CD34+ MF HSPC的单细胞RNA-seq数据指导基于批量RNA-seq数据训练预后模型的开发。我们使用NanoString检测法在两个独立的MF患者队列中验证了最终模型。我们确定了一个24基因加权总和的表达评分（MPN24），该评分对总生存期（OS）具有预后价值。在两个独立队列（分别为170例和100例MF患者）中，MPN24高分患者相较于MPN24低分患者的5年OS更差（分别为25.5% vs 86.9%，风险比[HR] = 9.81，P = 4.0e-11；以及23.5% vs 75.9%，HR = 6.40，P = 1.8e-7）。MPN24高分还与已知在MF中预示不良风险的临床特征、突变及核型特征相关。在多变量分析中，MPN24评分在纳入这些协变量及现有风险分层模型（包括动态国际预后评分系统[DIPSS]、DIPSS plus、突变增强国际预后评分系统[MIPSS70]和MIPSS70 plus version 2.0）后，仍保持独立的预后意义，并为这些风险分层模型增加了显著的预后价值（P值分别为1.6e-5、4.0e-6、1.5e-6和5.4e-4）。MPN24评分在改善DIPSS中危、MIPSS70中危及高危患者的风险分层方面尤为有效。MPN24是一种源自HSPC的基因表达评分，其与OS的关联独立于临床和基因组预后变量，并能改进MF的风险分层。