真菌刺激诱导脂滴积累的表征
验证真菌刺激是否导致巨噬细胞中甘油三酯和脂滴的积累。
使用D-zymosan、HKCA、curdlan等刺激BMDMs和THP-1细胞,通过代谢组学、TLC、BODIPY染色和电子显微镜检测脂滴形成。
Lipid droplets restrict phagosome formation in antifungal immunity
研究包含体外细胞实验(BMDMs、THP-1、RAW264.7)、体内小鼠模型(系统性念珠菌感染)以及分子机制验证(RAC1活性、ER竞争),并进行了功能验证(LD调控吞噬体形成)和机制验证。
骨髓来源巨噬细胞(BMDMs) THP-1细胞 RAW264.7细胞 系统性白色念珠菌感染小鼠模型
LD积累水平(通过OA或atglistatin处理)对吞噬体数量的影响 DGAT1或HILPDA基因敲除对LD形成及吞噬体形成的效应 RAC1活性及膜转位在LD介导的吞噬体形成限制中的作用 Hilpdafl/fl Lyz2-Cre小鼠对白色念珠菌感染的易感性 ATGL抑制剂atglistatin对系统性念珠菌感染的治疗效果
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证真菌刺激是否导致巨噬细胞中甘油三酯和脂滴的积累。
使用D-zymosan、HKCA、curdlan等刺激BMDMs和THP-1细胞,通过代谢组学、TLC、BODIPY染色和电子显微镜检测脂滴形成。
确定真菌刺激通过何种机制导致脂滴积累。
通过RNA-seq和RT-qPCR检测脂质合成和分解基因的表达,并使用DGAT1抑制剂、CRISPR-Cas9敲除DGAT1或HILPDA,以及ATGL抑制剂atglistatin处理,验证脂质合成与分解对脂滴形成的影响。
确定脂滴积累是否影响吞噬体形成,并验证其对吞噬效率与吞噬指数的作用。
通过操纵脂滴水平(OA、atglistatin增加;DGAT1-KO、A922500/T863减少),检测吞噬体数量(GFP-CA内化、双荧光标记HKCA),并分析细胞亚群吞噬体数量。
验证脂滴形成是否通过竞争性消耗内质网膜来限制吞噬体形成。
通过共聚焦显微镜观察脂滴与内质网膜(calnexin)的共定位,并分析不同脂滴水平下吞噬体数量与ER膜的关系;使用PI3K抑制剂抑制吞噬体形成,观察LD水平变化。
验证脂滴是否通过改变RAC1膜转位和GTPase活性来调节吞噬体形成。
通过RAC1活性测定、亚细胞分级、免疫共沉淀及共定位实验,分析脂滴积累对RAC1活化和膜转位的影响;使用RAC1敲除或抑制剂验证其必要性。
确定脂滴积累是否通过限制吞噬体形成来保护巨噬细胞免于死亡。
通过感染活白色念珠菌或菌丝缺陷株,检测LDH释放、PI染色和活细胞计数,评估不同脂滴水平下细胞死亡情况;并分析Rab7和Lamp1阳性吞噬体的比例。
验证脂滴积累在系统性真菌感染中的保护作用及ATGL抑制剂治疗效果。
使用Hilpdafl/fl Lyz2-Cre小鼠和atglistatin治疗的小鼠,进行系统性白色念珠菌感染,监测存活率、体重、肾脏真菌负荷、组织病理、炎症因子和肾功能指标。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| RPMI-1640培养基 | -- | -- | |
| IMDM培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | Invitrogen | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Invitrogen | -- | |
| 重组小鼠M-CSF | Peprotech | 315-02 | |
| 脂质检测 | BODIPY染料 | -- | -- |
| 尼罗红 | -- | -- | |
| 薄层色谱法 | -- | -- | |
| 甘油三酯检测试剂盒 | -- | -- | |
| 代谢组学 | 液相色谱-质谱联用 | -- | -- |
| RNA-seq | RNA测序 | -- | -- |
| RT-qPCR | SuperScript® II逆转录酶 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| SYBR Green实时PCR预混液 | -- | -- | |
| 免疫荧光 | DAPI | -- | -- |
| 钙荧光白 | -- | -- | |
| 共聚焦显微镜 (Andor Dragonfly 200) | Andor | -- | |
| Western blot | 抗ATGL抗体 | Cell Signaling Technology | 2439 |
| 抗p-Akt (Ser473)抗体 | Cell Signaling Technology | 4060 | |
| 抗p-Akt (Thr308)抗体 | Cell Signaling Technology | 13038 | |
| 抗Rab7抗体 | Cell Signaling Technology | 9367 | |
| 抗HA抗体 | Origene | TA100012 | |
| 抗Flag抗体 | Sigma-Aldrich | F1804 | |
| 抗PLIN2抗体 | SANTA CRUZ BIOTECHNOLOGY | sc-390169 | |
| 抗PLIN3抗体 | SANTA CRUZ BIOTECHNOLOGY | sc-390981 | |
| 抗HILPDA抗体 | SANTA CRUZ BIOTECHNOLOGY | sc-376704 | |
| 抗GAPDH抗体 | SANTA CRUZ BIOTECHNOLOGY | sc-293335 | |
| 抗Tom20抗体 | SANTA CRUZ BIOTECHNOLOGY | sc-17764 | |
| 抗HSP90抗体 | SANTA CRUZ BIOTECHNOLOGY | sc-13119 | |
| 抗calnexin抗体 | Proteintech | 10427-2-AP | |
| 抗GM130抗体 | Proteintech | 11308-1-AP | |
| 抗RAC1抗体 | Proteintech | 66122-1-Ig | |
| 免疫荧光 | 抗Syk抗体 | Enzo Life Sciences | ALX-804-480-C100 |
| Western blot | 抗FcεRI抗体 | Millipore | 06-727 |
| 流式细胞术 | 抗CD45抗体 | Biolegend | 103108 |
| 抗Ly6G抗体 | Biolegend | 127608 | |
| 抗F4/80抗体 | Biolegend | 123115 | |
| 抗CD4抗体 | Biolegend | 100406 | |
| 抗IL-17A抗体 | Biolegend | 506908 | |
| 抗CD11b抗体 | Biolegend | 101212 | |
| 抗IFN-γ抗体 | eBioscience | 11-7311-82 | |
| Zombie Violet可固定活性检测试剂盒 | Biolegend | 423114 | |
| 真菌刺激 | Zymosan A-Alexa Fluor™ 594 | InvivoGen | Z23374 |
| D-zymosan | InvivoGen | tlrl-zyd | |
| 可得然胶 | InvivoGen | tlrl-cud | |
| 药物处理 | A922500 | MCE | HY-10038 |
| T863 | MCE | HY-32219 | |
| Atglistatin | MCE | HY-15859 | |
| 脂质过载 | 油酸 | -- | -- |
| 吞噬实验 | 台盼蓝 | -- | -- |
| 流式细胞术 | Percoll | Amersham Bioscience | -- |
| LDH测定 | Pierce™ LDH细胞毒性检测试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 脂滴提取 | 脂滴提取试剂盒 | Abcam | ab242290 |
| RAC1活性检测 | Rac1/Cdc42激活检测试剂盒 | Upstate | -- |
| 免疫沉淀 | A-Sepharose微珠 | -- | -- |
| G-Sepharose微珠 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与巨噬细胞分化 | BMDMs分化条件:IMDM培养基,20 ng/mL M-CSF,10%热灭活FBS,培养5-7天;细胞系维持条件:THP-1和RAW264.7用RPMI-1640+10%FBS+1%青霉素-链霉素+1%丙酮酸钠,293T和HeLa用DMEM+10%FBS。 阅读提示:Materials and methods: Cells, Mouse BMDM preparation |
| 真菌刺激 | HKCA或D-zymosan/curdlan浓度(例如100 μg/mL)、MOI(例如3、10)及刺激时间(例如4h)。 阅读提示:Materials and methods: Reagents; Figure legends 1,2等 |
| 脂滴检测 | BODIPY或Nile Red染色浓度、孵育时间、流式细胞术设置。 阅读提示:Materials and methods: Immunofluorescence, Flow cytometry; Figure legends 1,2等 |
| 脂滴操纵 | OA浓度(4.5μg/mL)及处理时间(24h);DGAT1抑制剂A922500或T863浓度(10μM)及处理时间(24h);ATGL抑制剂atglistatin浓度(10μM)及处理时间;CRISPR-Cas9敲除效率验证。 阅读提示:Materials and methods: Reagents, Lentivirus-mediated gene knockout; Figure legends 2-4等 |
| 吞噬体形成检测 | GFP-CA或FITC/Fluor-647标记HKCA的制备与MOI(例如10);吞噬时间(例如2h、4h);吞噬体计数方法(荧光显微镜或流式细胞术)。 阅读提示:Materials and methods: BMDM phagocytosis assay, Phagocytosis of a cell subpopulation; Figure legends 3等 |
| RAC1活性测定 | RAC1活性测定方法(GST-PBD pull-down);OA或抑制剂预处理条件;HKCA刺激时间(0,30,60min)。 阅读提示:Materials and methods: RAC1 activity assay; Figure legends 5等 |
| 细胞死亡检测 | 活菌感染MOI(例如10)及时间;LDH释放测定;PI染色或活细胞染料使用。 阅读提示:Materials and methods: Lactate dehydrogenase (LDH) cytotoxicity assay; Figure legends 6等 |
| 体内模型 | 小鼠品系(Hilpdafl/fl、Lyz2-Cre)、感染剂量(C. albicans 4×10^5 CFU/只)、观察时间(5天);atglistatin剂量(10μg/50μL)及给药方式(腹腔注射)和时间(感染后12h)。 阅读提示:Materials and methods: Mice, Systemic C. albicans infection model; Figure legends 7-8等 |