急性艰难梭菌感染中中性粒细胞表型分析鉴定出与上皮损伤相关的TNF诱导的活化特征

Phenotypic profiling of neutrophils in acute Clostridioides difficile infection identifies a TNF-induced activation signature associated with epithelial damage

作者信息Alexander Huber, Ann Mathew, Faiza Khondokar, Divya Sharma, Anindita Mukherjee, Dolly K Khona, Jucy Gabriel, Shinsmon Jose, Rajat Madan
PMID42023517
发布时间2026-12-31
DOI10.1080/19490976.2026.2659430

实验完整度

包含体内小鼠CDI模型、体外IEC-中性粒细胞共培养、scRNAseq转录组图谱、流式细胞术验证和机制抑制实验,涵盖从表型到机制的多个独立验证层级。

主要模型

小鼠CDI模型(C57BL/6 WT、iDTR+/+Cre+及对照) 小鼠CMT-93肠上皮细胞系 人Caco-2肠上皮细胞系 人外周血中性粒细胞(健康供者)

重点核对

CDI小鼠模型中抗生素预处理方案(头孢哌酮或抗生素混合物)和艰难梭菌孢子攻毒剂量 中性粒细胞耗竭使用DT注射的剂量和时间 共培养实验中C. difficile毒素A/B、LPS、TNF和Nexinhib20的浓度 流式细胞术鉴定cNeu3样中性粒细胞的标记物(CD11b、CD63、IL-1β、MIP-1α、MALT1)

摘要

中性粒细胞是宿主对艰难梭菌感染(CDI)反应中的关键第一响应者。尽管在CDI患者中,组织和血液中大量的中性粒细胞与不良预后明确相关,但其功能作用仍知之甚少。利用小鼠(CMT-93)和人(Caco-2)肠上皮细胞(IEC)系与中性粒细胞共培养以及CDI临床前小鼠模型,我们表明活化的中性粒细胞加剧了艰难梭菌诱导的IEC损伤。为了鉴定促进CDI相关IEC损伤的中性粒细胞亚型和生物学通路,我们利用单细胞RNA测序(scRNAseq)生成了急性CDI中小鼠骨髓、血液和结肠中性粒细胞的第一个转录组图谱。我们的分析在结肠固有层中鉴定出一个新的中性粒细胞群体“cNeu3”,其表现出与中性粒细胞活化和脱颗粒相关基因的高表达。根据scRNAseq数据集的cNeu3特征基因,我们通过流式细胞术(CD11bhiCD63hiIL-1βhiMIP-1αhiMALT1hi细胞)验证了这些中性粒细胞在小鼠结肠中的存在。我们发现它们的丰度与上皮损伤增加相关。肿瘤坏死因子(TNF)足以在体外将小鼠骨髓中性粒细胞极化为cNeu3表型。最后,TNF引发的人中性粒细胞加重了艰难梭菌毒素诱导的IEC损伤,而当中性粒细胞脱颗粒被阻断时,这种损伤得到改善。总的来说,我们的数据为CDI期间中性粒细胞介导的病理机制提供了新的见解。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
中性粒细胞在急性艰难梭菌感染中是否以及如何促进肠上皮损伤?
核心机制
TNF通过NF-κB信号通路诱导中性粒细胞向高活化cNeu3表型极化,增强脱颗粒作用,释放嗜天青颗粒蛋白,加剧肠上皮屏障损伤。
主要证据
小鼠CDI模型中中性粒细胞耗竭减轻上皮损伤;scRNAseq鉴定出cNeu3簇并验证其高表达活化/脱颗粒基因;流式细胞术证实cNeu3样细胞丰度与上皮损伤相关;TNF处理体外诱导cNeu3表型;TNF引发的人中性粒细胞加重毒素诱导的TEER下降,而脱颗粒抑制剂Nexinhib20可改善。
研究意义
揭示了TNF驱动的中性粒细胞高活化状态在CDI病理中的关键作用,为通过靶向中性粒细胞极化或脱颗粒治疗严重CDI提供潜在策略。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

体内CDI模型建立与中性粒细胞作用评估

评估中性粒细胞在急性CDI中对肠上皮损伤的影响

使用抗生素预处理小鼠,灌胃艰难梭菌孢子建立CDI模型;通过MRP8-Cre/ROSA26-iDTR系统耗竭中性粒细胞,比较野生型与耗竭组在感染后的结肠病理、肠屏障功能(FD4渗透性)、细菌载量和毒素滴度等指标。

2

体外共培养模型验证中性粒细胞对上皮屏障的直接损伤

直接检测活化的中性粒细胞是否加剧艰难梭菌毒素诱导的肠上皮屏障损伤

将小鼠骨髓中性粒细胞与人中性粒细胞分别与CMT-93和Caco-2肠上皮细胞共培养,加入C. difficile毒素A/B、LPS、TNF等刺激,实时监测TEER变化。

3

单细胞转录组图谱构建与cNeu3簇鉴定

鉴定CDI期间骨髓、血液和结肠中性粒细胞的异质性,并发现与组织损伤相关的活化亚群

利用scRNAseq对感染小鼠和未感染小鼠的骨髓、血液和结肠中性粒细胞进行转录组分析,通过聚类、差异表达和通路富集鉴定出cNeu3簇,并比较各簇的基因模块评分(活化、脱颗粒、ROS等)。

4

流式细胞术验证cNeu3样细胞并关联上皮损伤

在蛋白水平验证cNeu3转录特征,并评估cNeu3样细胞丰度与上皮损伤的相关性

使用多色流式细胞术检测结肠固有层中性粒细胞中CD11b、CD63、IL-1β、MIP-1α和MALT1的表达,通过FlowSOM聚类和常规圈门定义cNeu3样细胞,并统计其数量与组织学上皮损伤评分的相关性。

5

TNF极化实验验证cNeu3表型的诱导

测试TNF是否足以在体外诱导中性粒细胞向cNeu3样表型极化

从小鼠骨髓分离中性粒细胞,用重组TNF刺激2小时,随后通过流式细胞术检测CD11b、IL-1β、MALT1、MIP-1α和CD63的表达变化。

6

脱颗粒抑制实验验证机制

验证TNF活化的中性粒细胞是否通过脱颗粒(特别是嗜天青颗粒释放)加剧肠上皮损伤

在Caco-2单层与TNF引发的人中性粒细胞共培养体系中加入脱颗粒抑制剂Nexinhib20,检测TEER变化,评估对屏障损伤的改善作用。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
白喉毒素Sigma-Aldrich--
艰难梭菌毒素A和BList Biologicals152C and 155L
脂多糖InvivoGentlrl-eblps
重组肿瘤坏死因子R&D210-TA-020
Nexinhib20Tocris6089
重组小鼠肿瘤坏死因子R&D410-MT-010
小鼠TNF ELISA试剂盒BioLegend430901
BCA蛋白测定试剂盒Thermo Fisher23225
环丝氨酸头孢西丁果糖琼脂(含马血和牛磺胆酸盐)Anaerobe SystemsAS-2136
艰难梭菌毒素A/B ELISA试剂盒TechLab30397
MACS MS分选柱Miltenyi130-097-658
人中性粒细胞直接分离试剂盒StemCell Technologies19666
CD326微珠Miltenyi130-105-958
Chromium NextGEM单细胞3' v3.1试剂盒10x Genomics--
LIVE/DEAD可固定蓝色死细胞染色试剂盒Thermo Fisher/InvitrogenL23105
ACK裂解缓冲液Lonza10-548E
抗CD16/32抗体BD--
Ly6G抗体BioLegend563978
CD11b抗体BioLegend101259
CD63抗体Miltenyi130-133-972
MALT1抗体Proteintech11660-1-AP
MIP-1α抗体Thermo Fisher46-7532-82
IL-1β抗体Thermo Fisher25-7114-82
二抗(抗兔)BioLegend406421
96孔E-板Agilent300601010
xCELLigence系统Agilent--
FITC-葡聚糖Sigma--
BioTek Synergy H1酶标仪BioTek--
Bouin固定液Sigma-Aldrich--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
体内CDI模型
小鼠品系、年龄、性别、抗生素预处理方案(头孢哌酮或抗生素混合物)、艰难梭菌孢子菌株和剂量、攻毒途径、DT耗竭剂量和时间
阅读提示:Materials and methods 中 Mouse model of CDI 和 Spore preparation
体外共培养
细胞系(CMT-93/Caco-2)、中性粒细胞来源和数量、刺激物浓度(毒素A/B、LPS、TNF、Nexinhib20)、TEER监测时长
阅读提示:Materials and methods 中 Transepithelial electrical resistance
流式细胞术
抗体克隆号和荧光标记、死活染料、细胞内染色固定/透化方案、FlowSOM聚类参数、cNeu3样细胞定义标准(CD11b、CD63、IL-1β、MIP-1α、MALT1)
阅读提示:Materials and methods 中 Murine blood and lamina propria leukocyte isolation and flow cytometry
TNF极化实验
骨髓中性粒细胞分离方法、TNF浓度和处理时间、培养液组成
阅读提示:Materials and methods 中 In vitro TNF polarization of murine neutrophils
单细胞RNA测序
小鼠数目、性别、感染后取样时间、中性粒细胞富集和上皮去除方法、建库试剂盒和测序平台、生物信息学分析参数(聚类、注释)
阅读提示:Materials and methods 中 Single-cell RNAseq