体内CDI模型建立与中性粒细胞作用评估
评估中性粒细胞在急性CDI中对肠上皮损伤的影响
使用抗生素预处理小鼠,灌胃艰难梭菌孢子建立CDI模型;通过MRP8-Cre/ROSA26-iDTR系统耗竭中性粒细胞,比较野生型与耗竭组在感染后的结肠病理、肠屏障功能(FD4渗透性)、细菌载量和毒素滴度等指标。
Phenotypic profiling of neutrophils in acute Clostridioides difficile infection identifies a TNF-induced activation signature associated with epithelial damage
包含体内小鼠CDI模型、体外IEC-中性粒细胞共培养、scRNAseq转录组图谱、流式细胞术验证和机制抑制实验,涵盖从表型到机制的多个独立验证层级。
小鼠CDI模型(C57BL/6 WT、iDTR+/+Cre+及对照) 小鼠CMT-93肠上皮细胞系 人Caco-2肠上皮细胞系 人外周血中性粒细胞(健康供者)
CDI小鼠模型中抗生素预处理方案(头孢哌酮或抗生素混合物)和艰难梭菌孢子攻毒剂量 中性粒细胞耗竭使用DT注射的剂量和时间 共培养实验中C. difficile毒素A/B、LPS、TNF和Nexinhib20的浓度 流式细胞术鉴定cNeu3样中性粒细胞的标记物(CD11b、CD63、IL-1β、MIP-1α、MALT1)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估中性粒细胞在急性CDI中对肠上皮损伤的影响
使用抗生素预处理小鼠,灌胃艰难梭菌孢子建立CDI模型;通过MRP8-Cre/ROSA26-iDTR系统耗竭中性粒细胞,比较野生型与耗竭组在感染后的结肠病理、肠屏障功能(FD4渗透性)、细菌载量和毒素滴度等指标。
直接检测活化的中性粒细胞是否加剧艰难梭菌毒素诱导的肠上皮屏障损伤
将小鼠骨髓中性粒细胞与人中性粒细胞分别与CMT-93和Caco-2肠上皮细胞共培养,加入C. difficile毒素A/B、LPS、TNF等刺激,实时监测TEER变化。
鉴定CDI期间骨髓、血液和结肠中性粒细胞的异质性,并发现与组织损伤相关的活化亚群
利用scRNAseq对感染小鼠和未感染小鼠的骨髓、血液和结肠中性粒细胞进行转录组分析,通过聚类、差异表达和通路富集鉴定出cNeu3簇,并比较各簇的基因模块评分(活化、脱颗粒、ROS等)。
在蛋白水平验证cNeu3转录特征,并评估cNeu3样细胞丰度与上皮损伤的相关性
使用多色流式细胞术检测结肠固有层中性粒细胞中CD11b、CD63、IL-1β、MIP-1α和MALT1的表达,通过FlowSOM聚类和常规圈门定义cNeu3样细胞,并统计其数量与组织学上皮损伤评分的相关性。
测试TNF是否足以在体外诱导中性粒细胞向cNeu3样表型极化
从小鼠骨髓分离中性粒细胞,用重组TNF刺激2小时,随后通过流式细胞术检测CD11b、IL-1β、MALT1、MIP-1α和CD63的表达变化。
验证TNF活化的中性粒细胞是否通过脱颗粒(特别是嗜天青颗粒释放)加剧肠上皮损伤
在Caco-2单层与TNF引发的人中性粒细胞共培养体系中加入脱颗粒抑制剂Nexinhib20,检测TEER变化,评估对屏障损伤的改善作用。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 中性粒细胞耗竭 | 白喉毒素 | Sigma-Aldrich | -- |
| 共培养实验 | 艰难梭菌毒素A和B | List Biologicals | 152C and 155L |
| 脂多糖 | InvivoGen | tlrl-eblps | |
| 重组肿瘤坏死因子 | R&D | 210-TA-020 | |
| Nexinhib20 | Tocris | 6089 | |
| TNF极化实验 | 重组小鼠肿瘤坏死因子 | R&D | 410-MT-010 |
| ELISA | 小鼠TNF ELISA试剂盒 | BioLegend | 430901 |
| BCA蛋白测定试剂盒 | Thermo Fisher | 23225 | |
| 孢子制备 | 环丝氨酸头孢西丁果糖琼脂(含马血和牛磺胆酸盐) | Anaerobe Systems | AS-2136 |
| 毒素检测 | 艰难梭菌毒素A/B ELISA试剂盒 | TechLab | 30397 |
| 中性粒细胞分离 | MACS MS分选柱 | Miltenyi | 130-097-658 |
| 人中性粒细胞直接分离试剂盒 | StemCell Technologies | 19666 | |
| CD326微珠 | Miltenyi | 130-105-958 | |
| 单细胞RNA测序 | Chromium NextGEM单细胞3' v3.1试剂盒 | 10x Genomics | -- |
| 流式细胞术 | LIVE/DEAD可固定蓝色死细胞染色试剂盒 | Thermo Fisher/Invitrogen | L23105 |
| 中性粒细胞分离 | ACK裂解缓冲液 | Lonza | 10-548E |
| 流式细胞术 | 抗CD16/32抗体 | BD | -- |
| Ly6G抗体 | BioLegend | 563978 | |
| CD11b抗体 | BioLegend | 101259 | |
| CD63抗体 | Miltenyi | 130-133-972 | |
| MALT1抗体 | Proteintech | 11660-1-AP | |
| MIP-1α抗体 | Thermo Fisher | 46-7532-82 | |
| IL-1β抗体 | Thermo Fisher | 25-7114-82 | |
| 二抗(抗兔) | BioLegend | 406421 | |
| TEER实验 | 96孔E-板 | Agilent | 300601010 |
| xCELLigence系统 | Agilent | -- | |
| FD4渗透性实验 | FITC-葡聚糖 | Sigma | -- |
| BioTek Synergy H1酶标仪 | BioTek | -- | |
| 组织学 | Bouin固定液 | Sigma-Aldrich | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 体内CDI模型 | 小鼠品系、年龄、性别、抗生素预处理方案(头孢哌酮或抗生素混合物)、艰难梭菌孢子菌株和剂量、攻毒途径、DT耗竭剂量和时间 阅读提示:Materials and methods 中 Mouse model of CDI 和 Spore preparation |
| 体外共培养 | 细胞系(CMT-93/Caco-2)、中性粒细胞来源和数量、刺激物浓度(毒素A/B、LPS、TNF、Nexinhib20)、TEER监测时长 阅读提示:Materials and methods 中 Transepithelial electrical resistance |
| 流式细胞术 | 抗体克隆号和荧光标记、死活染料、细胞内染色固定/透化方案、FlowSOM聚类参数、cNeu3样细胞定义标准(CD11b、CD63、IL-1β、MIP-1α、MALT1) 阅读提示:Materials and methods 中 Murine blood and lamina propria leukocyte isolation and flow cytometry |
| TNF极化实验 | 骨髓中性粒细胞分离方法、TNF浓度和处理时间、培养液组成 阅读提示:Materials and methods 中 In vitro TNF polarization of murine neutrophils |
| 单细胞RNA测序 | 小鼠数目、性别、感染后取样时间、中性粒细胞富集和上皮去除方法、建库试剂盒和测序平台、生物信息学分析参数(聚类、注释) 阅读提示:Materials and methods 中 Single-cell RNAseq |