通过高分辨率空间转录组学阐明克罗恩病相关纤维狭窄中以肌成纤维细胞为主的纤维化微环境

背景与目的：纤维狭窄是克罗恩病（CD）的主要并发症，其特征为肠道重塑和细胞外基质（ECM）过度沉积。一个显著特征是肠壁肌化，包括黏膜下肌样细胞扩张和固有肌层平滑肌细胞（SMC）增生。然而，黏膜下肌样细胞增生的细胞身份和分子机制仍知之甚少。方法：回顾性分析117例CD患者的术前肠道超声，并对25例正常、35例非狭窄性CD和44例狭窄性CD病例的回肠组织进行组织学分析。对1例非纤维化和1例伴有显著黏膜下肌样细胞扩张的纤维狭窄回肠标本应用高分辨率空间转录组学。利用公共单细胞RNA测序数据集（N = 158）、免疫荧光、原代周细胞培养和定量聚合酶链反应验证结果。结果：黏膜下肌样细胞主要被鉴定为高ECM产生的肌成纤维细胞，可能代表纤维化黏膜下扩张的主要基质细胞群。空间和伪时间分析表明它们起源于黏膜肌层和黏膜下血管SMC。此外，周细胞显著扩张并向肌成纤维细胞样表型转录重编程。成纤维细胞亚聚类显示空间异质性，FAP+成纤维细胞特异富集于纤维化区域。炎症单核细胞与基质细胞共定位，表现出强烈的预测配体-受体相互作用，提示免疫-基质串扰。结论：这项病例水平的高分辨率空间分析描绘了CD狭窄内空间组织的纤维化微环境，由不同的基质和免疫细胞群组成。我们定义了促纤维化肌成纤维细胞的身份和起源，并表征了周细胞向肌成纤维细胞的重编程，从而突出特定细胞亚型作为抗纤维化策略的主要治疗靶点。