临床队列分析
评估未结合胆红素与恶性疟原虫感染症状严重程度的关系
对42名恶性疟原虫感染个体(无症状或症状性)进行回顾性分析,测量血浆总胆红素、结合及未结合胆红素(用UnaG检测)和寄生虫负荷。
A metabolite-based resistance mechanism against malaria
包含人类患者样本、小鼠体内模型、体外恶性疟原虫培养及单细胞测序等多个独立证据层级,并进行功能验证和机制验证。
C57BL/6J小鼠感染伯氏疟原虫夏氏亚种(Pcc) DBA/2小鼠感染Pcc 恶性疟原虫3D7、Dd2、IPC 5202体外培养 P. falciparum感染患者队列
BVRA基因敲除(Blvra−/−)和野生型(Blvra+/+)小鼠 未结合胆红素给药剂量(30 mg/kg或3 mg/kg,每日腹腔注射) UGT1A1敲低效率(AAV8-gRNA-Ugt1a1) 体外未结合胆红素浓度(15-41 μM) 体内感染模型中寄生虫株(Pcc AS或GFP标记Pcc)及感染剂量(2×10^5或2×10^6个感染红细胞)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估未结合胆红素与恶性疟原虫感染症状严重程度的关系
对42名恶性疟原虫感染个体(无症状或症状性)进行回顾性分析,测量血浆总胆红素、结合及未结合胆红素(用UnaG检测)和寄生虫负荷。
验证BVRA产生的胆红素对疟疾的保护作用
使用C57BL/6J Blvra−/−和Blvra+/+小鼠感染Pcc,观察存活率和寄生虫血症,并检测血浆未结合胆红素水平。
验证外源性未结合胆红素是否可逆转Blvra−/−小鼠的致死表型
对Pcc感染的Blvra−/−小鼠每日腹腔注射未结合胆红素(30或3 mg/kg)或溶剂对照,监测存活率。
验证抑制胆红素结合是否增强对疟疾的保护作用
通过AAV8递送CRISPR-Cas9及靶向Ugt1a1的gRNA(AAV8-gRNA-Ugt1a1)在新生DBA/2小鼠肝脏特异敲低Ugt1a1,成年后感染Pcc,评估存活率和寄生虫血症。
检测未结合胆红素对恶性疟原虫增殖的影响
将不同浓度的未结合胆红素或对照加到同步化的恶性疟原虫(3D7、Dd2、IPC 5202)培养中,在不同时间点测定寄生虫血症。
探究未结合胆红素对寄生虫线粒体功能和代谢的影响
用MitoTracker探针检测寄生虫线粒体体积和膜电位;通过质谱检测代谢物(如糖酵解中间体、嘧啶合成中间体)。
验证未结合胆红素对疟原虫色素结晶和食物泡的影响
通过共聚焦显微镜观察疟原虫色素分布,通过透射电镜观察食物泡结构,用β-羟高铁血红素抑制试验测定抑制活性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 未结合胆红素检测 | UnaG蛋白 | -- | -- |
| 胆绿素检测 | iRFP蛋白 | -- | -- |
| 小鼠实验 | 胆红素 | Frontier Scientific | -- |
| 细胞培养 | AlbuMAXII | Invitrogen, Thermo Fisher Scientific | -- |
| D-山梨醇 | Sigma-Aldrich | -- | |
| Percoll | Sigma-Aldrich | -- | |
| 药物处理 | 阿托伐醌 | Sigma-Aldrich | -- |
| 流式分析 | MitoTracker绿色荧光染料 | Invitrogen, Thermo Fisher Scientific | -- |
| MitoTracker深红色荧光染料 | Invitrogen, Thermo Fisher Scientific | -- | |
| MitoSOX红色线粒体超氧化物指示剂 | Invitrogen, Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Hoechst 33342 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| SYBR Green I | Invitrogen, Thermo Fisher Scientific | -- | |
| SYTO深红色核酸染料 | Invitrogen, Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 蛋白质印迹 | 抗BVRA抗体 | Invitrogen | PA5-92059 |
| 抗HO-1抗体 | Enzo Life Sciences | ADI-SPA-896F | |
| 抗GAPDH抗体 | Cell Signaling Technology | 2118 | |
| 抗β-actin抗体 | Cell Signaling Technology | 4967 | |
| 抗UGT1A1抗体 | Boster Biological Technology | A01865-1 | |
| HRP标记的山羊抗兔IgG | Invitrogen | 31460 | |
| SuperSignal West Pico PLUS化学发光底物 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| cOmplete、Mini、无EDTA蛋白酶抑制剂混合物 | Roche | -- | |
| 动物实验 | AAV8-gRNA-Ugt1a1 | -- | -- |
| AAV8-Cas9 | -- | -- | |
| 代谢组学 | Orbitrap Exploris 240质谱仪 | Thermo Scientific | -- |
| Vanquish Horizon超高效液相色谱系统 | Thermo Scientific | -- | |
| Atlantis Premier BEH Z-HILIC色谱柱 | Waters | -- | |
| 扫描电子显微镜 | Quanta 650 FEG扫描电子显微镜 | FEI | -- |
| 透射电子显微镜 | Tecnai G2 Spirit BioTWIN透射电子显微镜 | FEI | -- |
| 单细胞测序 | Chromium Next GEM单细胞3'文库制备方案 | 10x Genomics | -- |
| NextSeq 2000测序仪 | Illumina | -- | |
| 实时定量PCR | QuantStudio 7 Flex实时荧光定量PCR系统 | Applied Biosystems | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床队列分析 | 患者纳入标准:年龄≥18岁,显微镜确认恶性疟原虫感染,治疗前采血;分组:无症状(WHO)和症状性;样本量:42例 阅读提示:Methods: 人类数据(Human data) |
| 小鼠感染模型 | 小鼠品系:C57BL/6J(野生型或Blvra−/−)、DBA/2;虫株:Pcc AS或GFP标记;感染途径:腹腔注射;感染剂量:2×10^6或2×10^5 iRBC;小鼠周龄:8-14周;性别:雌雄兼用 阅读提示:Methods: 小鼠、疟原虫感染和疾病评估(Mice, Plasmodium chabaudi chabaudi AS infection and disease assessment) |
| 未结合胆红素补充实验 | 给药剂量:30或3 mg/kg,每日腹腔注射;给药时间:感染后第4天至第15天;溶剂:0.2N NaOH和0.2N HCl缓冲至pH 7.4;储存:-80°C 阅读提示:Methods: 疟疾感染期间胆红素补充(Bilirubin supplementation during Plasmodium infection) |
| UGT1A1敲低实验 | 小鼠:新生DBA/2(2-4天);病毒载体:AAV8-gRNA-Ugt1a1或AAV8-Cas9;注射途径:静脉(眼眶后);病毒剂量:3×10^14病毒颗粒/kg体重;感染:约10周龄后腹腔注射Pcc(2×10^6 iRBC) 阅读提示:Methods: 体内抑制肝脏Ugt1a1(Repression of hepatic Ugt1a1 in vivo) |
| 体外恶性疟原虫培养与处理 | 寄生虫株:Pf3D7、Dd2、IPC 5202、PfD10、PfD10TgDHODH;培养条件:37°C、5% CO2、95%湿度,人红细胞(5%红细胞压积),0.5% AlbuMAXII;同步化:5% D-山梨醇;处理浓度:未结合胆红素15-41 μM;溶剂:DMSO(最终≤0.5%);检测时间点:24、48、72小时 阅读提示:Methods: 恶性疟原虫体外培养(P. falciparum in vitro culture) |
| 线粒体功能检测 | 探针浓度:MitoTracker Green FM 200 nM,MitoTracker Deep Red FM 200 nM,MitoSOX Red 5 μM;染色时间:20分钟;流式细胞仪:FACSAria Ilu;分析软件:FlowJo 阅读提示:Methods: 流式细胞术(恶性疟原虫)(Flow cytometry (P. falciparum)) |
| 疟原虫色素和β-羟高铁血红素抑制实验 | β-羟高铁血红素抑制试验:Nonidet P-40 (NP-40)介质,检测波长405 nm;血红蛋白结晶抑制的IC50测定;疟原虫色素定量:光谱法405 nm 阅读提示:Methods: 疟原虫色素定量(Hz quantification)和β-羟高铁血红素抑制试验(β-Hematin inhibition assay) |