单细胞分析鉴定靶点
鉴定超嗜酸性粒细胞疾病中嗜酸性粒细胞及其前体的细胞组成和治疗靶点。
对健康供体和HES患者的PB和BM样本进行scRNA-seq分析,鉴定细胞亚群、比例变化和IL-5Rα表达。
IL-5 CAR-T cell therapy induces effective remission in hypereosinophilic disorders
包含单细胞测序、体外细胞毒性、患者样本共培养、安全性评估和两种小鼠模型疗效验证,涵盖功能与机制验证。
hIL-5Rα-Nalm6异种移植NCG小鼠模型 hIL-5Rα-K562异种移植NCG小鼠模型 IL-33诱导的嗜酸性粒细胞增多BALB/c小鼠模型 HES患者来源的外周血和骨髓样本
IL-5Rα在嗜酸性粒细胞及其前体上的表达水平 hIL-5 CAR-T细胞的体外细胞毒性和IFN-γ分泌 hIL-5 CAR-T细胞对患者来源PB/BM样本中嗜酸性粒细胞的消除效果 hIL-5 CAR-T细胞在异种移植模型中的肿瘤负荷减少和生存期延长 hIL-5 CAR-T细胞的体内安全性(包括CRS相关细胞因子水平)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
鉴定超嗜酸性粒细胞疾病中嗜酸性粒细胞及其前体的细胞组成和治疗靶点。
对健康供体和HES患者的PB和BM样本进行scRNA-seq分析,鉴定细胞亚群、比例变化和IL-5Rα表达。
生成靶向IL-5Rα的CAR-T细胞,并建立符合GMP的生产流程。
利用慢病毒载体转导T细胞,表达含hIL-5与CD8α铰链跨膜区、CD28和CD3ζ的CAR,并进行体外扩增和表征。
评估hIL-5 CAR-T细胞的特异性细胞毒性、激活和细胞因子分泌。
将CAR-T或MOCK-T细胞与IL-5Rα+或IL-5Rα-靶细胞共培养,检测细胞毒性、CD69表达和IFN-γ分泌。
评估hIL-5 CAR-T细胞对患者来源的嗜酸性粒细胞的消除效果。
将患者PB和BM细胞与CAR-T细胞共培养,检测CD125+嗜酸性粒细胞比例的变化。
评估hIL-5 CAR-T细胞的致瘤性和全身毒性。
通过软琼脂克隆形成、皮下注射裸鼠和NCG小鼠的致瘤性实验,以及静脉注射NCG小鼠的毒性研究,监测肿瘤形成、体重、组织病理和细胞因子水平。
评估hIL-5 CAR-T细胞在超嗜酸性粒细胞白血病小鼠模型中的抗肿瘤效果。
建立Nalm6或K562异种移植NCG小鼠模型,并给予CAR-T或MOCK-T细胞,监测肿瘤负荷(生物发光)、体重和生存期。
在IL-33诱导的嗜酸性粒细胞增多模型中评估疗效。
给BALB/c小鼠注射重组IL-33,并在模型建立前或当天给予CAR-T细胞,检测BM、PB和脾脏中的嗜酸性粒细胞比例和数量。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 单细胞RNA测序 | BD Rhapsody | BD Biosciences | 633773 |
| BD Rhapsody靶向mRNA和AbSeq扩增试剂盒 | BD Biosciences | 633801 | |
| 流式细胞术 | APC抗小鼠/人IL-5抗体 | BioLegend | -- |
| FITC抗人CD3抗体 | BioLegend | -- | |
| PE抗人CD125(IL-5Rα)抗体 | BioLegend | -- | |
| PE抗人CD69抗体 | BioLegend | -- | |
| PerCP/Cyanine5.5抗人CD45抗体 | BioLegend | -- | |
| APC抗人Siglec-8抗体 | BioLegend | -- | |
| PE/Dazzle 594抗人CD193(CCR3)抗体 | BioLegend | -- | |
| APC-A750抗人CD14抗体 | BioLegend | -- | |
| BV605抗人CD15抗体 | BioLegend | -- | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | BioChannel | -- |
| 胎牛血清 | Corning | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | -- | |
| RPMI-1640培养基 | BioChannel | -- | |
| 慢病毒包装 | 聚乙烯亚胺 | Yeasen | -- |
| 0.45微米滤器 | Millipore | -- | |
| CAR-T细胞制造 | X-VIVO 15无血清培养基 | -- | -- |
| 免疫细胞血清替代物 | -- | -- | |
| 重组人IL-2 | -- | -- | |
| CliniMACS CD3试剂 | Miltenyi | -- | |
| TransAct CD3/CD28试剂 | -- | -- | |
| CryoStor CS10 | -- | -- | |
| 体外人源样本共培养 | 重组人IL-5 | -- | -- |
| 重组人G-CSF | -- | -- | |
| 细胞毒性试验 | D-荧光素 | GoldBio | -- |
| IFN-γ ELISA试剂盒 | R&D Systems | -- | |
| IL-33诱导模型 | 重组小鼠IL-33 | Novoprotein | CG73 |
| 毒性评估 | RayPlex人炎症因子阵列试剂盒 | RayBiotech | FAH-INF-1 |
| 免疫组化 | 抗人CD3抗体 | ZSGB-Bio | ZA-0503 |
| 抗人IL-5抗体 | ArigoBio | ARG66000 | |
| 山羊抗兔二抗 | Abcam | -- | |
| CyTOF | 顺铂 | Fluidigm | -- |
| Maxpar固定和透化缓冲液 | Fluidigm | -- | |
| EQ校准微球 | Fluidigm | -- | |
| Helios质谱流式细胞仪 | Fluidigm | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 单细胞RNA测序 | 人PB和BM样本的收集和处理方式;测序平台和文库构建试剂盒;细胞过滤标准(基因数、UMI数等) 阅读提示:Methods 中 “Single cell transcriptome capturation, library construction and sequencing” 和 “scRNA-seq data pre-processing and quality control” |
| CAR-T细胞制造 | T细胞来源(PBMCs)、激活试剂(TransAct CD3/CD28)、转导MOI=2、培养基成分(X-VIVO 15, IL-2浓度)、培养时间和密度调整 阅读提示:Methods 中 “Methods for the preparation of hIL-5 CAR-T cells at GMP levels” |
| 体外细胞毒性试验 | 靶细胞系(Nalm6, K562, U-2 OS)及其IL-5Rα表达情况;效应细胞与靶细胞比例;共培养时间;D-荧光素浓度 阅读提示:Methods 中 “Cytotoxic activity assay” 和 Figure 3 图注 |
| 患者样本共培养 | 患者PB和BM样本收集方式;粒细胞分离方法(Percoll密度梯度);共培养条件(IL-5, G-CSF浓度);效应细胞比例和共培养时间 阅读提示:Methods 中 “Cytotoxic activity assay for CAR-T cells with patient-derived peripheral blood and bone marrow” |
| 体内疗效模型 | 小鼠品系(NCG)和年龄;肿瘤细胞系(Nalm6, K562)及注射剂量;CAR-T细胞剂量;治疗时间;生物发光成像时间点 阅读提示:Methods 中 “Mouse xenograft tumor model” 和 Figure 6 图注 |
| IL-33诱导模型 | 小鼠品系(BALB/c)和年龄;IL-33剂量和给药持续时间;CAR-T给药时间(Day -5或Day 0);样本采集时间(Day 12) 阅读提示:Methods 中 “IL-33 alarmin-induced eosinophilia model” 和 Figure S20 图注 |
| 安全性评估 | 小鼠品系(裸鼠、NCG)和年龄;细胞剂量(1x10^6, 1x10^7);观察时间(16周致瘤性,29天毒性);主要器官和组织病理检查 阅读提示:Methods 中 “Tumorigenicity assay” 和 “In vivo biosafety assay” |