构建 Ovch2 敲除和敲入小鼠模型
研究 Ovch2 缺失对精子蛋白质组的影响及鉴定 OVCH2 相互作用蛋白。
使用 Ovch2 KO 小鼠(n=5)和同窝对照(n=6)进行精子蛋白质组学;使用 FLAG 标签 Ovch2 KI 小鼠(n=4)进行附睾亲和纯化。
Ovochymase 2 is a key regulatory factor modulating proteolytic pathways and sperm maturation in the mammalian epididymis†
包含Ovch2敲除小鼠精子蛋白质组学、FLAG标记Ovch2敲入小鼠附睾亲和纯化质谱、PC1细胞共转染免疫共沉淀及Western blot验证,涵盖体内和体外多个证据层级,并具有功能验证和机制验证。
Ovch2基因敲除小鼠(附睾精子) FLAG标记的Ovch2基因敲入小鼠(附睾组织) 永生化小鼠近端附睾头上皮细胞系(PC1)
Ovch2 KO 小鼠与对照组(2 杂合 + 4 WT)附睾精子蛋白质组比较,KO n=5,Ctrl n=6 FLAG 亲和纯化使用抗 DYKDDDDK 磁珠,从 FLAG-Ovch2 KI 和 WT 附睾裂解液(每组 n=4)中富集 PC1 细胞共转染 OVCH2 与 ADAM3、PRSS55 或 DEFB42 表达质粒,进行 Co-IP 验证 鼠 OVCH2 全长与截短人 OVCH2(ΔCUB1/2)均与 DEFB42 相互作用,表明蛋白酶域而非 CUB 域介导该互作 统计显著性:蛋白质组学使用 limma 调节 t 检验,FDR<0.05,倍数变化≥1.25;Co-IP结果重复三次
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
研究 Ovch2 缺失对精子蛋白质组的影响及鉴定 OVCH2 相互作用蛋白。
使用 Ovch2 KO 小鼠(n=5)和同窝对照(n=6)进行精子蛋白质组学;使用 FLAG 标签 Ovch2 KI 小鼠(n=4)进行附睾亲和纯化。
鉴定 Ovch2 缺失导致的精子蛋白丰度变化。
对附睾精子进行 TMT 标记定量蛋白质组学,分析差异表达蛋白。
鉴定与 OVCH2 结合的候选蛋白复合物。
从 FLAG-Ovch2 KI 附睾裂解液中用抗 FLAG 磁珠进行亲和纯化,经质谱鉴定富集的蛋白质。
确认 PC1 细胞适合作为 OVCH2 相互作用研究的体外模型。
通过 RT-qPCR 检测附睾标志物表达,FISH 确认鼠源,用 GFP 转染评估效率。
验证 OVCH2 与 ADAM3、PRSS55、DEFB42 之间的物理相互作用。
在 PC1 细胞中共转染表达质粒,用抗 FLAG、抗 HA、抗 1D4 抗体进行免疫共沉淀,免疫印迹检测。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养与转染 | FuGENE HD 转染试剂 | Promega | E2312 |
| 细胞培养 | Opti-MEM 培养基 | Gibco | 31985-070 |
| 细胞共转染 | pEZT-BM 质粒 | -- | -- |
| pcDNA3.1Hygro+ 载体 | -- | -- | |
| 免疫共沉淀 | Pierce 抗 DYKDDDDK 磁珠 | Invitrogen | A367970 |
| 抗 HA 磁珠 | Thermo Fisher | 88836 | |
| 抗 1D4 琼脂糖珠 | GE | 17-0430-01 | |
| 蛋白质印迹 | 抗 FLAG 辣根过氧化物酶抗体 | Sigma | A8592-2MG |
| 抗 1D4 辣根过氧化物酶抗体 | Santa Cruz | sc-57432 | |
| 抗 HA 抗体 | Cell Signaling | 3724 | |
| 二抗(抗小鼠) | Jackson ImmunoResearch Laboratories | 711-035-152 | |
| SuperSignal West Femto 最大灵敏度底物 | Thermo Scientific | 34096 | |
| 质粒构建 | Direct-zol RNA 小量提取 Plus 试剂盒 | Zymo | R2070 |
| SuperScript IV 逆转录酶 | Thermo Fisher | 18090050 | |
| KOD Xtreme 热启动 DNA 聚合酶 | Sigma-Aldrich | 71975 | |
| QIAgen 质粒小提试剂盒 | QIAGEN | 27104 | |
| PureLink 快速凝胶回收试剂盒 | Invitrogen | K210012 | |
| 高效连接酶 Ver.2 | TOYOBO USA INC | NC0758985 | |
| RT-qPCR | TaqMan 基因表达 Cells-to-CT 试剂盒 | Life Technologies | 4399002 |
| TaqMan 基因表达预混液 | 作者未提供 | -- | |
| 蛋白质组学 | TMT11-131C 标记试剂 | Thermo Fisher Scientific | A37725 |
| 质谱分析 | Orbitrap Fusion 质谱仪 | -- | -- |
| 蛋白质组学 | Pierce IP 裂解液 | Thermo Scientific | 87787 |
| 细胞验证 | Kreatech 荧光原位杂交探针 | Leica Biosystems | -- |
| 质粒构建 | pUC 载体 | (GeneWiz?) | -- |
| DH5α 感受态细菌 | -- | -- | |
| 质谱数据分析 | Mascot 搜索引擎 | Matrix Science | v2.5 |
| Proteome Discoverer 软件 | Thermo Fisher Scientific | v2.0 | |
| 数据分析 | gpGrouper 软件 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 精子蛋白质组学 | 小鼠基因型(Ovch2 KO, n=5;对照 n=6: 2杂合+4WT),年龄4个月,精子采集部位(附睾尾),孵育条件(37°C, 5% CO2, 15分钟),TYH培养基,TMT标记,质谱平台,差异蛋白筛选阈值(FDR<0.05,倍数变化≥1.25) 阅读提示:查阅 Materials and Methods 中的“Sperm proteome profiling”和“Statistical analysis”,以及 Results 中“Sperm proteome profiling in Ovch2 KO mice”部分。 |
| 亲和纯化质谱 | 基因型(FLAG-Ovch2 KI 和 WT,n=4/组),组织(附睾),裂解缓冲液(NETN),蛋白酶抑制剂,IP 抗体(抗 DYKDDDDK 磁珠),质谱平台(Orbitrap Fusion),数据处理(Mascot, Proteome Discoverer, gpGrouper) 阅读提示:查阅 Materials and Methods 中的“Affinity purification tandem mass spectrometry analysis”和“Statistical analysis”部分。 |
| PC1 细胞系验证 | 细胞系来源(永生化小鼠近端附睾头上皮细胞),培养条件,RT-qPCR 检测基因(Lcn5, Ovch2, Aqp9, Cftr),FISH 探针(鼠/人着丝粒),转染效率评估(GFP) 阅读提示:查阅 Materials and Methods 中的“PC1 cell line validation and characterization”和“Plasmid expression and PC1 transfection”部分。 |
| 共转染和 Co-IP | 质粒构建(OVCH2, ADAM3, PRSS55, DEFB42 的标签和载体),转染试剂(FuGENE HD, 比例3:1),质粒DNA量(2 μg),转染时间(24-48小时),裂解缓冲液(Pierce IP Lysis Buffer),Co-IP 抗体(抗 FLAG, 抗 HA, 抗 1D4),洗脱方法(低pH甘氨酸/1D4肽),检测(Western blot) 阅读提示:查阅 Materials and Methods 中的“Generation of mammalian expression constructs...”、“Plasmid expression and PC1 transfection”和“Co-immunoprecipitation and Western blot analysis”部分。 |