IL-19表达与受体分析
验证hdLECs中IL-19及其受体复合物的表达,并探索外源性刺激对表达的影响。
通过Western blot检测基础及rhIL-19或rhVEGFC刺激后IL-19、IL-20Rα、IL-20Rβ的表达,并检测STAT3磷酸化。
IL-19 Is a Novel Lymphangiocrine Factor Inducing Lymphangiogenesis and Lymphatic Junctional Regulation
包含体外hdLEC功能实验(增殖、迁移、网络形成)、RNAseq转录组分析、ECIS通透性检测、Western blot蛋白验证、体内dKO小鼠功能实验和免疫染色,涵盖多层级验证。
人真皮淋巴内皮细胞(hdLECs) Il19−/−Ldlr−/−双敲除(dKO)小鼠 Ldlr−/−小鼠(对照)
hdLEC细胞:来自Cell Biologics(批次030414F14)和PromoCell(批次467Z001.2, 481Z001.2, 483Z001.2),传代2-6代 rhIL-19处理浓度:100ng/mL或200ng/mL;VEGFC:100ng/mL;oxLDL:20μg/mL或100μg/mL 小鼠品系:Ldlr−/−和Il19−/−Ldlr−/−(dKO),8-12周龄,高脂饮食(AIN-76A Western Diet)或标准饮食,16周 Evans Blue清除实验:耳皮下注射3μL 1mg/mL染料,16小时后提取定量 每组小鼠数量:Ldlr−/− HFD n=12,dKO HFD n=12,Ldlr−/− Control n=12,dKO Control n=12
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证hdLECs中IL-19及其受体复合物的表达,并探索外源性刺激对表达的影响。
通过Western blot检测基础及rhIL-19或rhVEGFC刺激后IL-19、IL-20Rα、IL-20Rβ的表达,并检测STAT3磷酸化。
评估IL-19对hdLEC迁移、网络形成和增殖的促进作用。
通过transwell迁移、划痕实验、Matrigel网络形成实验、细胞计数和BrdU掺入实验评估IL-19的功能。
鉴定IL-19影响的基因表达谱并验证关键基因表达。
通过RNAseq分析IL-19处理后的差异表达基因,并用qRT-PCR和Western blot验证关键转录因子和连接相关基因。
阐明IL-19诱导Prox1和Angpt2表达的上游调控机制。
通过siRNA敲低STAT3、KLF4、FOXO1,并检测Prox1、cyclin D1、cyclin E1、Angpt2的表达变化,同时检测Prox1 mRNA稳定性。
评估IL-19对hdLEC屏障功能和VE-钙黏蛋白连接形态的影响。
通过ECIS测量跨内皮电阻,并用免疫细胞化学观察VE-钙黏蛋白的分布模式。
验证IL-19在体内对淋巴功能和形态的影响。
使用dKO和Ldlr−/−对照小鼠,在标准饮食或HFD下,通过Evans Blue清除实验、淋巴管分支计数和VE-钙黏蛋白连接形态分析评估淋巴功能。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 杜氏磷酸盐缓冲液 | Corning | 21-040-CV |
| 内皮细胞生长培养基 | Cell Biologics | H1168 | |
| 内皮细胞生长培养基 | PromoCell | C-22221 | |
| 内皮细胞补充因子 | PromoCell | C-39221 | |
| 胎牛血清 | HyClone | SH30396.03 | |
| 胰蛋白酶 | Corning | 25-052-CI | |
| 药物处理 | 重组人IL-19 | R&D Systems | 1035-IL |
| 重组人VEGFC | Peprotech | 100-20CD-20UG | |
| 人氧化低密度脂蛋白 | Kalen Biomedical | 770202-4 | |
| WP1066 | Santa Cruz | sc-203282 | |
| 二甲基亚砜 | Sigma | D2650 | |
| siRNA转染 | Amaxa HCAEC核转染试剂盒 | Lonza | -- |
| ON-TARGETplus siCONTROL非靶向siRNA | Dharmacon | -- | |
| 增殖实验 | BrdU细胞增殖检测试剂盒 | Cell Signaling Technology | 6813 |
| Nexcelom T4细胞计数仪 | Nexcelom | -- | |
| VersaMax酶标仪 | Molecular Devices | -- | |
| 迁移实验 | Millicell Transwell小室 | Millicell | PI8P01250 |
| EVOS M5000成像系统 | ThermoFisher Scientific | -- | |
| 网络形成实验 | 基质胶 | Corning | -- |
| Olympus CKX41倒置显微镜 | Olympus | -- | |
| RNA提取与分析 | Trizol试剂 | Invitrogen | 15596018 |
| NanoDrop分光光度计 | ThermoFisher Scientific | -- | |
| SuperScript IV逆转录酶 | Invitrogen | -- | |
| SYBR Green荧光染料 | Applied Biosystems | -- | |
| QuantStudio 3实时荧光定量PCR仪 | Applied Biosystems | -- | |
| Trimmomatic v.0.36 | -- | -- | |
| STAR比对器v.2.5.2b | -- | -- | |
| Subread包v.1.5.2 | -- | -- | |
| DESeq2 | -- | -- | |
| GeneSCF v.1.1-p2 | -- | -- | |
| Western blot | 牛血清白蛋白 | Sigma | A3803 |
| IL-20Rα抗体 | Abclonal | A10308 | |
| IL-20Rβ抗体 | Abclonal | A7980 | |
| IL-19抗体 | R&D Systems | AF1035 | |
| 磷酸化STAT3抗体 | Cell Signaling Technology | 9131S | |
| STAT3抗体 | Cell Signaling Technology | 9132 | |
| 磷酸化VEGFR3抗体 | Affinity Biosciences | AF3676 | |
| VEGFR3抗体 | Invitrogen | PA5-32409 | |
| VEGFC抗体 | Proteintech | 22601-1-AP | |
| 细胞周期蛋白D1抗体 | Santa Cruz Biotechnology | SC-718 | |
| 细胞周期蛋白B1抗体 | NeoMarkers | MA-868-P0 | |
| 细胞周期蛋白E1抗体 | Santa Cruz Biotechnology | SC-481 | |
| Prox1抗体 | Invitrogen | PA5-85552 | |
| Prox1抗体 | R&D Systems | AF2727 | |
| Angpt2抗体 | Invitrogen | PA5-27297 | |
| C2CD4B抗体 | Invitrogen | PA5-70721 | |
| 磷酸化FOXO1抗体 | Cell Signaling Technology | 9461S | |
| FOXO1抗体 | Cell Signaling Technology | 2880S | |
| KLF4抗体 | Abclonal | A13673 | |
| 磷酸化VE-钙黏蛋白(Y685)抗体 | Invitrogen | 2460291 | |
| 磷酸化VE-钙黏蛋白(Y658)抗体 | Phosphosolutions | CP1981 | |
| VE-钙黏蛋白抗体 | R&D Systems | AF1002 | |
| GAPDH抗体 | Cell Signaling Technology | 2118L | |
| HSC70抗体 | Santa Cruz Biotechnology | Sc-7298 | |
| HRP标记二抗 | Cell Signaling Technology | 7074S | |
| HRP标记二抗 | Cell Signaling Technology | 7076S | |
| HRP标记二抗 | R&D Systems | HAF017 | |
| iBright成像系统 | ThermoFisher Scientific | -- | |
| ECIS | 8W10E+培养板 | Applied Biophysics | -- |
| Z Theta仪器 | Applied Biophysics | -- | |
| L-半胱氨酸 | ThermoFisher Scientific | A10435 | |
| 鼠尾胶原蛋白 | Advanced BIOMATRIX | 5153-100MG | |
| 氯化钠 | ThermoFisher Scientific | 7647-14-5 | |
| 免疫细胞化学 | 驴血清 | Jackson Labs | 017-000-121 |
| 抗山羊IgG AF568 | Invitrogen | A11057 | |
| DAPI | Invitrogen | D3571 | |
| Fluoro-Gel封片剂 | Electron Microscopy Sciences | 17985-10 | |
| Olympus BX53显微镜 | Olympus | -- | |
| 动物实验 | 异氟烷 | -- | -- |
| 伊文思蓝染料 | Fisher Chemical | E515-25 | |
| Hamilton注射器 | Hamilton Company | 87908 | |
| 甲酰胺 | EM Science | FX0420 | |
| Olympus SZ61体视显微镜 | Olympus | -- | |
| Triton X-100 | Sigma | T8787 | |
| VE-钙黏蛋白抗体(大鼠) | BD Biosciences | 550548 | |
| LYVE1抗体 | AngioBio | 11-034 | |
| 抗大鼠IgG AF647 | Jackson ImmunoResearch | 712-605-153 | |
| 抗兔IgG AF488 | Invitrogen | A21206 | |
| Fluoro-Gel封片剂 | Electron Microscopy Sciences | 17985-11 | |
| Leica DM4 B显微镜 | Leica | -- | |
| Zeiss LSM 900 Airyscan 2显微镜 | Zeiss | -- | |
| 数据分析 | ImageJ软件 | -- | -- |
| GraphPad Prism 10.1.2 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | hdLEC来源(Cell Biologics Lot 030414F14;PromoCell Lots 467Z001.2, 481Z001.2, 483Z001.2),培养基(Cell Biologics Cat. H1168;PromoCell Cat. C-22221和C-39221),传代次数(2-6代) 阅读提示:Materials and Methods: Cells and Culture |
| 细胞处理 | rhIL-19浓度(100或200 ng/mL)、rhVEGFC浓度(100 ng/mL)、oxLDL浓度(20或100 μg/mL)、刺激时间(如24小时、6天等) 阅读提示:Materials and Methods: Cells and Culture; Results及图例 |
| siRNA敲低 | siRNA类型(Prox1, STAT3, KLF4, IL-19, FOXO1, Scram)、转染浓度(1.25μM)、转染试剂(Amaxa HCAEC Nucleofector Kit) 阅读提示:Materials and Methods: Cells and Culture; Results部分 |
| 体内实验 | 小鼠品系(Ldlr−/−, dKO)、年龄(8-12周)、饮食类型(标准饮食5053 IRR或高脂饮食AIN-76A Western Diet IRR)、饮食持续时间(16周)、各组样本量(Evans Blue实验每组n=12,其他实验每组n=6) 阅读提示:Materials and Methods: Mice and Study Design; Figure 7 legend |
| Evans Blue清除实验 | Evans Blue浓度(1 mg/mL)、注射体积(3μL)、注射部位(耳皮下)、清除时间(16小时)、提取方法(甲酰胺提取,55℃过夜)、检测波长(620nm) 阅读提示:Materials and Methods: Lymphatic Function with Evans Blue dye |