模型鉴定与表型分析
确认rd1和rd10模型中的变性时间进程和炎症状态。
对rd1和rd10视网膜进行bulk RNA-seq和scRNA-seq,结合GSEA和免疫组化分析Esr1、炎症标志物表达。
Estrogen receptor 1 activation suppresses microglia-derived Tnf-α signaling as a photoreceptor self-protection mechanism
包含体外视网膜外植体、体内rd1/rd10及zaprinast模型,结合转录组、单细胞测序、免疫组化及功能学ERG验证,并有多药物干预和机制验证。
rd1小鼠视网膜外植体及动物模型 rd10小鼠视网膜外植体及动物模型 zaprinast诱导的C57小鼠视网膜变性模型
rd1和rd10基因型差异及变性时间点 体外培养处理药物浓度:E2 (10 μM), PPT (15 nM), AZD9496 (10 nM), ETN (0.63 nM), IFX (6.7 μM), R7050 (65 μM), AZD8797 (4 μM) 体内玻璃体注射剂量及DMSO浓度匹配
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确认rd1和rd10模型中的变性时间进程和炎症状态。
对rd1和rd10视网膜进行bulk RNA-seq和scRNA-seq,结合GSEA和免疫组化分析Esr1、炎症标志物表达。
验证Esr1激活对光感受器变性的保护作用。
在rd1和rd10视网膜外植体培养中,给予E2、E2+AZD9496、PPT,通过TUNEL检测细胞死亡。
验证PPT在体内对rd10及zaprinast诱导模型的保护作用。
在rd10和C57小鼠中行玻璃体腔注射PPT,通过TUNEL和ERG评估结构及功能。
验证Tnf-α/Tnfr1信号在光感受器死亡中的作用。
在rd1外植体及rd10、zaprinast模型中给予ETN、IFX、R7050,检测TUNEL和ERG。
验证Cx3cl1-Cx3cr1信号在微胶质细胞活化和光感受器变性中的作用。
在rd1外植体、rd10和zaprinast模型中给予Cx3cr1拮抗剂AZD8797,检测TUNEL和ERG。
评估炎症标志物与光感受器变性的相关性。
对rd1、rd10和zaprinast模型中的TUNEL阳性细胞及Iba1、Cd68、Cx3cl1、Cx3cr1、Tnf-α表达进行Spearman相关分析。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | 17β-雌二醇 | MedChemExpress | HY-B0141 |
| AZD9496 | MedChemExpress | HY-12870 | |
| 丙基吡唑三醇 | MedChemExpress | HY-100689 | |
| 依那西普 | MedChemExpress | HY-108847 | |
| 英夫利昔单抗 | MedChemExpress | HY-P9970 | |
| R7050 | MedChemExpress | HY-110203 | |
| AZD8797 | MedChemExpress | HY-13848 | |
| 扎普利斯特 | MedChemExpress | HY-B1816 | |
| 组织包埋 | Tissue-Tek | Sakura Finetek | -- |
| 切片 | CryoStar NX50 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 麻醉 | 三溴乙醇 | -- | -- |
| 手术显微镜 | ZEISS Stemi 305体视显微镜 | ZEISS | -- |
| 注射 | 33号针头 | Hamilton Bonaduz AG | -- |
| 微量注射器 | Hamilton Bonaduz AG | -- | |
| ERG记录 | Celeris系统 | Diagnosys LLC | -- |
| RNA-seq文库构建 | NEBNext Ultra RNA文库制备试剂盒 | NEB | -- |
| RNA-seq测序 | Illumina NovaSeq平台 | Illumina | -- |
| RNA质量检测 | RNA Nano 6000检测试剂盒 | Agilent Technologies | -- |
| NanoPhotometer分光光度计 | IMPLEN | -- | |
| TUNEL染色 | TUNEL试剂盒 | Beyotime | -- |
| 核染色 | DAPI | Servicebio | G1407 |
| 免疫组化 | 抗Esr1抗体 | Immunoway | YT1634 |
| 抗Cd68抗体 | BOSTER | BA3638 | |
| 抗Iba1抗体 | Immunoway | ym8165 | |
| 抗Iba1抗体 | Abcam | ab283319 | |
| 抗Cx3cl1抗体 | Immunoway | YT5354 | |
| 抗Cx3cr1抗体 | Immunoway | YT5112 | |
| 抗Tnf-α抗体 | Immunoway | YM8306 | |
| 抗Tnfr1抗体 | Immunoway | YT4687 | |
| 抗谷氨酰胺合成酶抗体 | Abcam | MAB302 | |
| 免疫组化二抗 | 山羊抗兔Alexa Fluor 488 | Molecular Probes | A11034 |
| 山羊抗小鼠Alexa Fluor 647 | Molecular Probes | A32728 | |
| 封片 | 含DAPI封片剂 | Servicebio | -- |
| 显微镜成像 | Zeiss LSM 900共聚焦显微镜 | Carl Zeiss | -- |
| 图像分析软件 | ZEN (Blue edition)软件 | Zeiss | -- |
| 统计分析 | GraphPad Prism 8 | GraphPad Software | -- |
| SPSS Statistics 26 | IBM | -- | |
| 数据分析 | R | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型 | 小鼠品系、基因型、年龄及背景;rd1为C3H背景,rd10为C57BL/6J背景;rd1在P5取材外植体,rd10在P12取材;体内注射rd10在P16。 阅读提示:Materials and methods, Animals; Ex vivo retinal explant culture; In vivo intravitreal injections |
| 体外药物处理 | 药物浓度:E2 10 μM, AZD9496 10 nM, PPT 15 nM, ETN 0.63 nM, IFX 6.7 μM, R7050 65 μM, AZD8797 4 μM;培养时间:外植体培养48小时后处理。 阅读提示:Materials and methods, Ex vivo retinal explant culture |
| 体内药物注射 | 注射体积0.1 μL;最终眼内浓度:PPT 15 nM, ETN 0.63 nM, IFX 6.7 μM, R7050 65 μM, AZD8797 4 μM;DMSO浓度匹配;对照组为含相同DMSO的PBS。 阅读提示:Materials and methods, In vivo intravitreal injections |
| ZAP诱导模型 | C57小鼠玻璃体注射ZAP,最终眼内浓度400 μM;与药物共注射;对照组含0.4% DMSO。 阅读提示:Materials and methods, In vivo intravitreal injections; Results, Figure S2 |
| ERG记录 | 暗适应至少12小时;麻醉剂三溴乙醇83.3 mg/kg;刺激强度3 cd·s/m2;记录窗口300 ms。 阅读提示:Materials and methods, Dark-adapted electroretinography (ERG) |
| 组织处理 | 固定使用4%多聚甲醛;切片厚度12 μm;封闭条件:10%正常山羊血清、1% BSA、0.3% Tween-20。 阅读提示:Materials and methods, Immunohistochemistry |