原代细胞分离与培养
获得人原代绒毛细胞滋养层细胞,用于感染实验
从足月胎盘分离vCTBs,使用胰蛋白酶-DNase消化和Percoll梯度纯化,并通过阴性选择去除HLA阳性细胞。
SARS-CoV-2 infects human primary cytotrophoblasts mainly through a non-canonical entry route
实验包含多个独立证据层级:原代细胞、细胞系模型、药物处理、RT-qPCR、空斑实验、免疫荧光、RNA-seq,并有功能验证和机制验证。
人原代绒毛细胞滋养层细胞(vCTBs) JEG-3细胞系 BeWo细胞系 HIPEC-65细胞系
病毒株:PreVOC(B.1, D614G)、Alpha(B.1.1.7)、Beta(B.1.351)、Delta(B.1.617.2) 感染剂量:MOI=1,感染2-3小时 药物处理:20 μM甲磺酸卡莫司他或20 μM磷酸氯喹,感染前预处理1小时 检测时间点:24、48、72小时感染后 样本来源:足月胎盘、无并发症妊娠,产妇知情同意
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
获得人原代绒毛细胞滋养层细胞,用于感染实验
从足月胎盘分离vCTBs,使用胰蛋白酶-DNase消化和Percoll梯度纯化,并通过阴性选择去除HLA阳性细胞。
评估vCTBs对SARS-CoV-2的易感性
用SARS-CoV-2 PreVOC株以MOI=1感染vCTBs,在24、48、72小时收样,通过RT-qPCR、空斑实验和免疫荧光检测病毒复制。
评估不同滋养层细胞系对SARS-CoV-2的易感性,寻找合适的模型
将BeWo、JEG-3、HIPEC-65细胞感染PreVOC株,通过RT-qPCR和空斑实验检测病毒复制。
确定SARS-CoV-2进入滋养层细胞的途径
用Camostat mesylate(TMPRSS2抑制剂)或chloroquine phosphate(内体途径抑制剂)预处理细胞,然后感染病毒,通过空斑实验检测病毒产量。
评估不同SARS-CoV-2变异株对滋养层细胞的感染效率
用Alpha、Beta、Delta变异株感染JEG-3细胞和vCTBs,通过RT-qPCR和空斑实验检测病毒复制。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM高糖培养基 | Thermo Fisher Scientific | 10564011 |
| 胎牛血清 | Thermo Fisher Scientific | 12484-028 | |
| 青霉素-链霉素 | Thermo Fisher Scientific | 15140122 | |
| TrypLE Express消化液 | Thermo Fisher Scientific | 12604-021 | |
| EMEM培养基 | Wisent Inc. | 320-005-CL | |
| HEPES缓冲液 | Thermo Fisher Scientific | 15630-080 | |
| DMEM培养基 | Thermo Fisher Scientific | 11965-092 | |
| 非必需氨基酸 | Thermo Fisher Scientific | 11140-050 | |
| 胎牛血清 | Wisent Inc. | 098150 | |
| DMEM/Ham's F-12培养基 | Wisent Inc. | 319-085-CL | |
| RNA提取 | RNeasy Mini试剂盒 | QIAGEN | 74106 |
| QIAshredder试剂盒 | QIAGEN | 79656 | |
| RNAlater保存液 | Sigma-Aldrich | R0901 | |
| β-巯基乙醇 | -- | -- | |
| BeadBug组织研磨器 | Benchmark Scientific | D1030 | |
| 预装石榴石碎片和锆珠的研磨管 | Benchmark Scientific | D1033-30G | |
| RT-qPCR | iScript cDNA合成试剂盒 | Bio-Rad | 1708891 |
| SsoAdvanced通用SYBR Green Supermix | Bio-Rad | 1725274 | |
| TaqPath 1-Step多重预混液(无ROX) | Thermo Fisher Scientific | A28523 | |
| SYBR Safe核酸染料 | Thermo Fisher Scientific | S33102 | |
| qPCR仪器 | CFX96实时荧光定量PCR仪 | Bio-Rad | -- |
| RNA质量检测 | NanoDrop Lite分光光度计 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 空斑实验 | 羧甲基纤维素 | Sigma-Aldrich | 21902 |
| 甲醛 | Thermo Fisher Scientific | BP531500 | |
| 结晶紫 | -- | -- | |
| 免疫荧光 | 抗核衣壳蛋白抗体 | Sino Biologicals | 40143-MM05 |
| Alexa Fluor 488标记的山羊抗鼠IgG二抗 | Thermo Fisher Scientific | A21202 | |
| DAPI染色液 | Thermo Fisher Scientific | D1306 | |
| Fluoromount G封片剂 | SouthernBiotech | 0100-01 | |
| Triton X-100 | -- | -- | |
| 山羊血清 | -- | -- | |
| 牛血清白蛋白 | -- | -- | |
| 共聚焦显微镜 | LSM980共聚焦显微镜 | Zeiss | -- |
| 药物处理 | 甲磺酸卡莫司他 | Cayman Chemical | 16018 |
| 磷酸氯喹 | Cayman Chemical | 14194 | |
| 奈玛特韦 | MedChemExpress | HY-138687 | |
| 瑞德西韦 | Key Organics | DT-0049 | |
| 细胞活力检测 | CellTiter-Glo发光法细胞活力检测试剂盒 | Promega | G7571 |
| Spark多功能酶标仪 | Tecan | -- | |
| 原代细胞分离 | 抗HLA-ABC抗体 | Thermo Fisher Scientific | 14-9983-82 |
| 偶联二抗的微珠 | Miltenyi Biotec | 130-048-4 | |
| mRNA测序 | Illumina NovaSeq测序平台 | Illumina | -- |
| 病毒扩增 | VeroE6细胞 | ATCC | CRL-1586 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 原代vCTBs分离与培养 | 胎盘来源(无并发症足月妊娠)、分离方法(胰蛋白酶-DNase消化和Percoll梯度)、培养条件(DMEM高糖、10% FBS、5% CO2、37°C)、细胞接种密度 阅读提示:Materials and methods: Isolation of human primary vCTBs |
| 病毒感染 | 病毒株(PreVOC、Alpha、Beta、Delta)、MOI(1)、感染时间(2-3小时)、检测时间点(24、48、72 hpi) 阅读提示:Materials and methods: SARS-CoV-2 infection; Results: Primary villous trophoblasts are permissive to SARS-CoV-2 |
| 病毒进入途径分析 | 药物浓度(20 μM)、预处理时间(1小时)、对照处理(0.1% DMSO或PBS)、感染后药物维持时间 阅读提示:Materials and methods: Drug tests; Results: SARS-CoV-2 enters trophoblastic cells via multiple pathways |
| 细胞系感染 | 细胞系种类(BeWo、JEG-3、HIPEC-65)、接种密度、培养基、MOI 阅读提示:Materials and methods: Cell lines culture; Results: SARS-CoV-2 permissiveness diverges among trophoblastic cell lines |
| 基因表达分析 | RNA-seq分析的胎盘样本数量(26例)、RT-qPCR检测的基因(ACE2、TMPRSS2、NRP1、SCARB1、CTSL)、参考基因(YWHAZ、SDHA) 阅读提示:Materials and methods: RNA extraction, RT-qPCR, mRNA sequencing; Results: Viral entry factor expression differs among the trophoblastic cell lines |