验证eCIRP诱导DLL4+中性粒细胞
确定eCIRP能否诱导中性粒细胞表达DLL4,以及是否依赖TLR4。
小鼠骨髓来源中性粒细胞(BMDNs)和人类外周血中性粒细胞经eCIRP处理,通过流式细胞术检测DLL4+中性粒细胞比例。使用TLR4敲除小鼠验证受体依赖性。
DLL4+ neutrophils promote Notch1-mediated endothelial PANoptosis to exacerbate acute lung injury in sepsis
包含体外细胞共培养、体内CLP模型、过继转移、基因敲低、肽抑制剂干预及生存分析的多层级功能与机制验证。
小鼠骨髓来源中性粒细胞 小鼠肺微血管内皮细胞(PVECs) 小鼠CLP脓毒症模型 人外周血中性粒细胞
eCIRP浓度(0.2-1 μg/mL)和时间(2-12小时)对DLL4+中性粒细胞频率的影响 DLL4+中性粒细胞过继转移剂量(1×10^6 cells/只)和注射途径(眶后注射) NDI处理浓度(体外10 μM,体内10 mg/kg)和时间(16小时或20小时) Notch1敲低效率(约75%) CLP模型中的穿刺次数和针头规格(20小时实验用22号针头穿刺2次,生存实验穿刺1次)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定eCIRP能否诱导中性粒细胞表达DLL4,以及是否依赖TLR4。
小鼠骨髓来源中性粒细胞(BMDNs)和人类外周血中性粒细胞经eCIRP处理,通过流式细胞术检测DLL4+中性粒细胞比例。使用TLR4敲除小鼠验证受体依赖性。
评估脓毒症状态下血液和肺中DLL4+中性粒细胞是否增加。
通过CLP诱导小鼠脓毒症,20小时后收集血液和肺组织,流式细胞术检测DLL4+中性粒细胞(Ly6G+DLL4+)的比例和数量。
检验DLL4+中性粒细胞是否诱导肺内皮细胞发生PANoptosis。
过继转移DLL4+或DLL4-中性粒细胞至CLP小鼠,检测肺组织中ZBP1及PANoptosis标志物水平。
确认DLL4+中性粒细胞是否通过Notch1-DLL4信号诱导内皮细胞PANoptosis。
将FACS分选的DLL4+或DLL4-中性粒细胞与PVECs共培养,使用DAPT(γ-分泌酶抑制剂)或NDI处理,或敲低PVECs中Notch1,检测细胞死亡和PANoptosis标志物。
评估NDI在体内是否减轻DLL4+中性粒细胞诱导的内皮细胞PANoptosis、ALI及改善生存。
在CLP小鼠中给予NDI或PBS,检测肺组织PANoptosis标志物、肺损伤评分、肺水含量、血管渗漏及生存率。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 重组蛋白 | 重组小鼠DLL4 | R&D Systems | 1389-D4-050/CF |
| 重组小鼠Notch1 | R&D Systems | 5267-TK | |
| 细胞处理 | eCIRP | 实验室自制 | -- |
| 细胞培养 | PriGrow VI培养基 | Applied Biological Materials Inc. | -- |
| PriGrow IV培养基 | Applied Biological Materials Inc. | -- | |
| 转染 | UltraCruz转染试剂 | Santa Cruz Biotechnology | -- |
| 中性粒细胞分离 | EasySep Direct人中性粒细胞分离试剂盒 | Stem Cell Technologies | 19666 |
| EasySep小鼠中性粒细胞富集试剂盒 | STEMCELL Technologies | 19762 | |
| 流式细胞术 | APC-Ly6G抗体 | BioLegend | 127614 |
| PE-DLL4抗体 | BioLegend | 130807 | |
| 抗CD66b抗体 | BioLegend | 984102 | |
| 抗DLL4抗体 | BioLegend | 346506 | |
| PE-抗CD31抗体 | BioLegend | 160203 | |
| CFSE | Thermo Fisher Scientific | C34570 | |
| 活/死细胞染色 | Thermo Fisher Scientific | C34557 | |
| 细胞凋亡检测 | FITC Annexin V凋亡检测试剂盒I | BD Pharmingen | 556547 |
| 细胞培养 | DAPT | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 药物处理 | NDI(Notch1-DLL4抑制剂) | GenScript | -- |
| NDI乱序肽 | GenScript | -- | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Invitrogen, Thermo Fisher Scientific | -- |
| RT-qPCR | SYBR Green PCR预混液 | Applied Biosystems, Thermo Fisher Scientific | -- |
| Applied Biosystems 7300实时PCR仪 | Applied Biosystems | -- | |
| ELISA | ELISA试剂盒 | BD Biosciences | 558534 |
| 组织学检测 | ZBP1抗体 | Thermo Fisher Scientific | PA5-20455 |
| CD31抗体 | Cell Signaling Technology | 3528S | |
| Vector TrueVIEW自发荧光淬灭试剂盒 | Vector Laboratories | SP-8400-15 | |
| ProLong Gold抗淬灭剂 | Thermo Fisher Scientific | P36934 | |
| ZEISS LSM 900共聚焦显微镜 | ZEISS | -- | |
| Western blot | ABC蛋白检测试剂盒 | Bio-Rad | 5000002 |
| NuPAGE 4%-12% Bis-Tris凝胶 | Invitrogen | -- | |
| ZBP1抗体 | Thermo Fisher Scientific | PA5-20455 | |
| c-GSDMD抗体 | Cell Signaling Technology | 10137S | |
| GSDMD抗体 | Cell Signaling Technology | 39754S | |
| c-caspase-3抗体 | Cell Signaling Technology | 9661L | |
| caspase-3抗体 | Cell Signaling Technology | 9662S | |
| p-MLKL抗体 | Cell Signaling Technology | 37333S | |
| MLKL抗体 | Cell Signaling Technology | 37705S | |
| N1ICD(c-Notch1)抗体 | Cell Signaling Technology | 4147S | |
| Notch1抗体 | Cell Signaling Technology | 3608S | |
| GAPDH抗体 | ProteinTech | 60004-1-Ig | |
| β-actin抗体 | Sigma-Aldrich | A5441 | |
| Odyssey FC双模式成像系统2800 | LI-COR | -- | |
| 动物实验 | 亚胺培南 | WG Critical Care LLC | lot |
| 伊文思蓝染料 | Sigma-Aldrich | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 体外DLL4诱导和表型检测 | eCIRP浓度、处理时间、细胞密度、TLR4依赖性 阅读提示:参照Figure 1及对应Methods部分:eCIRP浓度(0.2-1 μg/mL),时间(2-12小时),BMDNs(1×10^6/mL) |
| DLL4+中性粒细胞功能检测 | 共培养比例、处理时间、DAPT或NDI浓度、Notch1敲低条件 阅读提示:参照Figure 3和Figure 4及对应Methods部分:共培养比例1:1,16小时,DAPT和NDI浓度10 μM,Notch1敲低24小时 |
| CLP脓毒症模型和过继转移 | CLP具体操作(穿刺次数、针头规格)、中性粒细胞转移数量和途径、NDI剂量和给药途径、样本采集时间 阅读提示:参照Methods中的'Animal model of polymicrobial sepsis'和Figure 2、5、6图注:22号针头,20小时实验穿刺2次,生存实验1次;1×10^6 cells/只眶后注射;NDI 10 mg/kg |
| 体内PANoptosis检测 | 肺组织处理、抗体稀释度、检测指标 阅读提示:参照Methods中的'Western blot assays'和'Immunofluorescence assay'及Figure 2、5图注:ZBP1抗体1:1000,CD31抗体1:250 |