检测CG1在CKD中的表达
明确CG1在慢性肾损伤中的表达水平和细胞定位。
人肾组织样本和多种小鼠CKD模型(AA、顺铂、UUO)中进行免疫荧光、RNAScope和实时PCR检测CG1表达。
Cyclin G1 induces maladaptive proximal tubule cell dedifferentiation and renal fibrosis through CDK5 activation
研究包含多种体内模型(AA、顺铂、UUO)、体外原代细胞和细胞系实验,并进行了功能验证(基因敲除、药物抑制)和机制验证(免疫共沉淀、Western blot)。
小鼠AA肾病模型 小鼠重复低剂量顺铂模型 小鼠单侧输尿管梗阻(UUO)模型 原代近端小管细胞(PTC)和LLC-PK1、HEK293T细胞系
CG1-KO小鼠和CDK5条件敲除(CDK5ΔTub)小鼠的构建与验证 CKD模型中AA(5 mg/kg)、顺铂(5 mg/kg,每周一次,共4周)或UUO手术诱导方案 AA处理原代PTC浓度5-10 μg/mL及处理时间 CDK5抑制剂roscovitine(8 μM)和GLX(50 μM)的浓度 G2/M停滞诱导剂paclitaxel的剂量(20 mg/kg体内,1 μM体外)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
明确CG1在慢性肾损伤中的表达水平和细胞定位。
人肾组织样本和多种小鼠CKD模型(AA、顺铂、UUO)中进行免疫荧光、RNAScope和实时PCR检测CG1表达。
探索CG1缺失是否影响肾功能和纤维化进程。
对比野生型和CG1-KO小鼠在三种CKD模型中的肾功能(BUN)、肾重/体重、胶原沉积和α-SMA表达。
确定CG1促纤维化作用是否依赖于G2/M停滞。
在AA模型中给予紫杉醇诱导G2/M停滞,检测纤维化指标;体外用PAC处理原代PTCs检测促纤维化和去分化标志物。
区分CG1在AKI适应性和CKD适应不良性去分化中的不同作用。
在不同时间点检测WT和CG1-KO肾脏中SOX9、Ki-67、LTL、YAP、Na+/K+-ATPase和VIM等标志物的表达。
验证CG1是否通过CDK5促进去分化。
检测p-CDK5水平、免疫共沉淀验证CG1与CDK5结合;过表达或抑制CDK5观察对细胞形态、标志物和纤维化指标的影响。
评估CDK5抑制剂的治疗潜力。
在UUO模型中从第3天起给予GLX,评估肾重/体重、胶原沉积、去分化标志物(SOX9、VIM)和纤维化标志物(COL4a1)。
验证CDK5在肾小管上皮细胞中的必要性。
将CDK5fl/fl小鼠与Six2-Cre小鼠杂交获得CDK5ΔTub小鼠,进行UUO模型,评估G2/M停滞、去分化和纤维化指标。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | 马兜铃酸 | Sigma-Aldrich | A5512 |
| 顺铂 | KD Medical | RGC-3290 | |
| 紫杉醇 | Sigma-Aldrich | T7402 | |
| 药物处理 | Roscovitine | -- | -- |
| RO5454291 | Glixx labs | -- | |
| 细胞培养 | 最低必需培养基 | ATCC | -- |
| DMEM/F-12培养基 | -- | -- | |
| 原代PTC分离 | 胶原酶 | Worthington Biochemical Corporation | -- |
| 胰蛋白酶抑制剂 | Worthington Biochemical Corporation | -- | |
| 细胞培养 | Percoll分离液 | -- | -- |
| 胰岛素 | -- | -- | |
| 转铁蛋白 | -- | -- | |
| 硒 | -- | -- | |
| 氢化可的松 | -- | -- | |
| 维生素C | -- | -- | |
| 转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | 11668019 |
| Lipofectamine Stem转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | STEM00003 | |
| 蛋白质提取 | M-PER哺乳动物蛋白质提取试剂 | Thermo Fisher Scientific | 78501 |
| T-PER组织蛋白质提取试剂 | Thermo Fisher Scientific | 78510 | |
| Western blot | ChemiDoc MP成像系统 | Bio-Rad | -- |
| Image Lab软件 | Bio-Rad | -- | |
| 免疫沉淀 | Fugene-6转染试剂 | Promega | -- |
| 抗Myc (9E10)抗体 | VAPR9E10, Vanderbilt University Core | -- | |
| 蛋白A/G琼脂糖珠 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| RT-PCR | RNeasy Mini试剂盒 | QIAGEN | 74106 |
| iScript cDNA合成试剂盒 | Bio-Rad | 1708891 | |
| iTaq Universal SYBR Green | Bio-Rad | 1725121 | |
| 肾功能检测 | QuantiChrom尿素检测试剂盒 | BioAssay Systems | -- |
| 组织学 | 天狼星红 | Electron Microscopy Sciences | 26357 |
| Weigert铁苏木素 | Electron Microscopy Sciences | 26044-05 | |
| 抗体 | KIM-1抗体 | R&D Systems | AF1817 |
| Na+/K+-ATPase抗体 | DSHB | a5 | |
| SOX9抗体 | Cell Signaling Technology | 82630 | |
| 波形蛋白抗体 | GeneTex | GTX100619 | |
| α-SMA抗体 | Cell Signaling Technology | 19245 | |
| E-钙黏蛋白抗体 | Thermo Fisher Scientific | 13-1900 | |
| 裂解的caspase-3抗体 | Cell Signaling Technology | 9664 | |
| p-CDK5 (Tyr15)抗体 | Sigma-Aldrich | SAB4504276 | |
| 总CDK5抗体 | Thermo Fisher Scientific | AHZ0492 | |
| ZO-1抗体 | Sigma-Aldrich | AB2272 | |
| IV型胶原抗体 | Millipore | CP56-500UL | |
| 抗GFP抗体 | Abcam | ab101863 | |
| 仪器 | Zeiss LSM 710共聚焦显微镜 | Zeiss | -- |
| 成像 | Nikon Tie2 eclipse显微镜 | Nikon | -- |
| Nikon A1R扫描激光共聚焦显微镜 | Nikon | -- | |
| 图像分析 | ImageJ | NIH | -- |
| NIS Elements软件 | Nikon | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| CKD小鼠模型 | 模型类型(AA、顺铂、UUO)及诱导方案(剂量、次数、时间点) 阅读提示:Methods - Animals 部分 |
| 细胞实验 | 细胞系(LLC-PK1、HEK293T、原代PTC)的来源、培养条件、处理药物浓度和时间(AA、PAC、roscovitine、GLX) 阅读提示:Methods - Cell culture 部分 |
| 基因敲除小鼠 | 基因型(CG1-KO、CDK5ΔTub)的构建和鉴定 阅读提示:Methods - Animals 部分及结果部分图7 |
| 药物处理 | 体内给药剂量和途径(AA 5 mg/kg, PAC 20 mg/kg, GLX剂量) 阅读提示:Results 及 Figure 2 和 Figure 6 legends |
| 检测指标 | 纤维化定量(天狼星红染色、α-SMA)、去分化标志物(SOX9、VIM)、G2/M停滞(p-H3/Ki-67) 阅读提示:Results 部分及各图图注 |