细胞水平验证联用协同效果
验证SIK2抑制剂能否增强卵巢癌和TNBC细胞对PARP抑制剂的敏感性。
在多种卵巢癌和TNBC细胞系及正常细胞中,用SIK2抑制剂(ARN3236、ARN3261)和PARP抑制剂(olaparib、rucaparib等)单独或联合处理,检测细胞活力并计算联合指数。
SIK2 inhibition enhances PARP inhibitor activity synergistically in ovarian and triple-negative breast cancers
包含体外细胞实验、体内异种移植瘤模型、转录组学及表观遗传学机制验证,且体外与体内结果一致。
卵巢癌细胞系(SKOv3、OVCAR8、OC316等) 三阴性乳腺癌细胞系(MDA-MB-231、HCC1937等) 卵巢癌异种移植瘤模型(皮下、腹腔) 三阴性乳腺癌异种移植瘤模型(乳腺脂肪垫)
SIK2抑制剂与PARP抑制剂联用对癌细胞生长的协同抑制作用(组合指数<1) SIK2抑制剂对PARP酶活性和DNA双链断裂修复功能的影响 SIK2抑制剂对MEF2D转录活性及其下游靶基因FANCD2、EXO1、XRCC4表达的调控 异种移植瘤模型中联合用药对肿瘤生长和生存期的影响
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证SIK2抑制剂能否增强卵巢癌和TNBC细胞对PARP抑制剂的敏感性。
在多种卵巢癌和TNBC细胞系及正常细胞中,用SIK2抑制剂(ARN3236、ARN3261)和PARP抑制剂(olaparib、rucaparib等)单独或联合处理,检测细胞活力并计算联合指数。
验证SIK2是介导PARP抑制剂敏感性的关键分子。
利用CRISPR/Cas9敲除SKOv3和OVCAR8细胞中的SIK2,或稳定过表达SIK2,检测对olaparib的敏感性变化。
揭示SIK2抑制剂增强PARP抑制剂效果的分子机制。
通过RNA-Seq、RT-qPCR、Western blot、ChIP-Seq/qPCR等检测DNA修复基因表达、PARP酶活性、HDAC4/5/7磷酸化及MEF2D结合活性。
在动物模型中验证SIK2抑制剂与PARP抑制剂联合的抗肿瘤效果。
建立卵巢癌(SKOv3、OVCAR8、OC316)和TNBC(MDA-MB-231、HCC1937)异种移植瘤模型,给予单药或联合治疗,监测肿瘤生长和生存期。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞活力检测 | CellTiter-Glo发光细胞活力检测试剂盒 | Promega | G9241 |
| PARP酶活性检测 | PARP通用比色分析试剂盒 | R&D Systems | 4677-096-K |
| 染色质免疫沉淀 | Magna ChIP A试剂盒 | MilliporeSigma | 17-610 |
| RT-qPCR | iTaq Universal SYBR Green预混液 | Bio-Rad | 172-5124 |
| 蛋白质印迹 | 亚细胞蛋白分级提取试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 78835 |
| BCA蛋白定量检测 | Thermo Fisher Scientific | 23228 | |
| 细胞凋亡检测 | FITC Annexin V/死细胞凋亡检测试剂盒I | Thermo Fisher Scientific | V13242 |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Thermo Fisher Scientific | 15596026 |
| RNeasy试剂盒 | Qiagen | 217004 | |
| RT-qPCR | SsoAdvanced通用PCR预混液 | Bio-Rad | -- |
| 免疫荧光 | 含TES缓冲液的Fluoro-Gel封片剂 | Electron Microscopy Sciences | 50-246-96 |
| Western blot抗体 | SIK2抗体 | Cell Signaling Technology | 6919 |
| p-HDAC4/5/7抗体 | Cell Signaling Technology | 3443 | |
| HDAC5抗体 | Cell Signaling Technology | 20458 | |
| HDAC4抗体 | Cell Signaling Technology | 5392 | |
| γ-H2AX抗体 | Cell Signaling Technology | 2577 | |
| PARP抗体 | BD Biosciences | 551025 | |
| MEF2D抗体 | BD Pharmingen | 610775 | |
| Lamin A/C抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-6215 | |
| α-tubulin抗体 | MilliporeSigma | T9026 | |
| siRNA转染 | DharmaFECT 4转染试剂 | GE Dharmacon | T-2004-03 |
| 病毒包装 | pLV(Exp)-Neo-CMV>tTS/rtTA_M2慢病毒 | VectorBuilder | VB160419-1020mes |
| pLV(Tet)-EGFP:T2A:Puro-TRE-hMEF2D慢病毒 | VectorBuilder | VB180504-1036gtn | |
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | Corning | 15-040-CV |
| 荧光素酶报告基因 | MEF2报告基因检测试剂盒 | QIAGEN | 336841 |
| 免疫组织化学 | Rodent Decloaker抗原修复液 | BioCare Medical | RD913M |
| PeroxAbolish封闭液 | BioCare Medical | PXA969M | |
| Rodent Block M封闭液 | BioCare Medical | RBM961L | |
| VisUCyte HRP聚合物IgG | R&D Systems | VC001-025/VC003-025 | |
| DAB显色试剂 | BioCare Medical | BDB2004L | |
| CAT苏木素 | Thermo Fisher Scientific | HE-M | |
| 细胞培养 | G418抗生素 | Corning | 61-8833-100 |
| 嘌呤霉素 | MilliporeSigma | D-9897-1G | |
| 多西环素 | MilliporeSigma | D-9897-1G | |
| 细胞培养污染检测 | 通用支原体检测试剂盒 | ATCC | 30-1010K |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 药物处理 | SIK2抑制剂(ARN3236、ARN3261)和PARP抑制剂(olaparib等)的浓度及处理时间。 阅读提示:请参见Methods中的Viability assays、Clonogenic assays及相关图注(Figure 1-5)。 |
| 细胞培养 | 细胞系来源、培养基、培养条件(如CO2浓度、温度)、细胞代数。 阅读提示:请参见Methods中的Cell lines部分及Supplemental Table 1。 |
| 动物模型 | 小鼠品系、周龄、性别、细胞接种数量、给药剂量、频率、途径、治疗周期及终点指标。 阅读提示:请参见Methods中的Growth of human ovarian and breast cancer xenografts in mice部分。 |
| 分子检测 | 抗体信息(catalog号)、ChIP-qPCR引物序列、RT-qPCR条件、基因表达分析方法。 阅读提示:请参见Methods中的ChIP and RT-qPCR analysis、RNA extraction and RT-qPCR analysis及Supplemental Methods。 |
| 数据分析与统计 | 统计方法(如ANOVA、log-rank test)、软件版本(GraphPad Prism)、组合指数计算模型(CalcuSyn)、显著性水平。 阅读提示:请参见Methods中的Statistics部分。 |