放射处理后肿瘤细胞表型及Piezo2表达变化检测
观察放射对肿瘤细胞形态和机械敏感离子通道表达的影响。
对MC38和B16F1细胞进行30 Gy照射后,通过扫描电镜、细胞骨架染色和流式细胞术检测细胞大小变化;通过RNA-seq、Q-PCR、Western blot和流式细胞术检测Piezo2表达。
Tumor cell-intrinsic Piezo2 drives radioresistance by impairing CD8+ T cell stemness maintenance
包含细胞系基因敲除、体外功能实验、皮下移植瘤模型、CD8+ T细胞耗竭/过继转移、临床样本IHC分析等多层级证据,且明确进行了机制验证。
MC38小鼠结肠腺癌细胞系 B16F1小鼠黑色素瘤细胞系 C57BL/6小鼠皮下移植瘤模型 临床直肠腺癌患者肿瘤样本
肿瘤细胞系:MC38、B16F1 基因敲除:CRISPR-Cas9敲除Piezo2、IL-15,shRNA敲低IRF-1 放射剂量:体外30 Gy,体内18 Gy CD8+ T细胞功能:IFN-γ、TNF-α、TCF-1、Ki-67等标志物
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
观察放射对肿瘤细胞形态和机械敏感离子通道表达的影响。
对MC38和B16F1细胞进行30 Gy照射后,通过扫描电镜、细胞骨架染色和流式细胞术检测细胞大小变化;通过RNA-seq、Q-PCR、Western blot和流式细胞术检测Piezo2表达。
验证Piezo2缺失是否增强放射对肿瘤生长的抑制。
使用CRISPR-Cas9生成Piezo2敲除的MC38和B16F1细胞系,皮下接种于C57BL/6小鼠,肿瘤局部照射18 Gy,监测肿瘤生长;还检测了远隔效应和CD8+ T细胞耗竭的影响。
探讨Piezo2缺失对肿瘤微环境中CD8+ T细胞数量和功能的影响。
通过流式细胞术分析肿瘤内CD8+ T细胞比例、IFN-γ+等细胞因子产生、TCF-1+等干性标志物和TOX+等耗竭标志物;进行OT-I T细胞过继转移实验。
确定Piezo2缺失是否增加肿瘤细胞IL-15产生,及其对CD8+ T细胞的作用。
通过RNA-seq、Q-PCR和流式细胞术检测IL-15表达;使用IL-15中和抗体和CRISPR-Cas9敲除IL-15验证其功能。
阐明Piezo2缺失导致IL-15上调的分子机制。
通过Western blot和流式细胞术检测核内IRF-1表达、JAK2/STAT1磷酸化水平;使用JAK2抑制剂和IRF-1敲低验证通路依赖性。
评估Piezo2表达与临床放疗敏感性和CD8+ T细胞浸润的关系。
对直肠腺癌患者放疗后肿瘤组织进行IHC染色,分析Piezo2和CD8表达;分析公共PDAC数据集(GSE225767)中Piezo2和IL-15表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 高糖DMEM培养基 | Corning | -- |
| 胎牛血清 | ExCell Bio. | -- | |
| 青霉素 | -- | -- | |
| 链霉素 | -- | -- | |
| HEPES | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 基因编辑 | lentiCRISPR-v2 | -- | -- |
| 聚凝胺 | Genomeditech | -- | |
| 嘌呤霉素 | Beyotime Biotechnology | -- | |
| Lipofectamine 3000试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Neofect DNA转染试剂 | MayinTech | -- | |
| 动物实验 | RS-2000生物辐照仪 | Rad Source Technologies | -- |
| 抗CD8抗体 | Selleck | A2102, | |
| 抗IL-15抗体 | Bio X Cell | BE0315, | |
| 抗IFN-γ抗体 | Bio X Cell | BE0055, | |
| 细胞刺激 | OVA多肽 | Sigma-Aldrich | S7951 |
| 细胞培养 | 小鼠IL-7 | Peprotech | 217-17 |
| 小鼠IL-15 | Peprotech | 210-15 | |
| 免疫荧光 | 鬼笔环肽 | Yeason | 40736ES75 |
| 抗泛细胞角蛋白抗体 | Abcam | ab7753 | |
| Hoechst染料 | Thermo Fisher Scientific | H1399 | |
| 抗IRF-1抗体 | Cell Signaling Technology | 8478 | |
| 显微镜 | FV3000共聚焦系统 | Olympus | -- |
| 蛋白质提取 | 膜和胞浆蛋白提取试剂盒 | Beyotime | P0033 |
| 核和胞浆蛋白提取试剂盒 | Beyotime | P0028 | |
| Western blot | PVDF膜 | -- | -- |
| 抗Piezo2抗体 | NOVUS | NBP1-78624 | |
| 抗IL-15抗体 | Abcam | ab273625 | |
| 抗Lamin B1抗体 | Proteintech | 12987-1-AP | |
| 抗GAPDH抗体 | Proteintech | 60004-1-lg | |
| 抗β-actin抗体 | Proteintech | 23660-1-AP | |
| 抗磷酸化JAK2抗体 | Cell Signaling Technology | 4406 | |
| 抗JAK2抗体 | Cell Signaling Technology | 3230 | |
| 抗磷酸化STAT1抗体 | Cell Signaling Technology | 9167 | |
| 抗STAT1抗体 | Cell Signaling Technology | 9172 | |
| HRP标记的山羊抗兔二抗 | Beyotime | A0208 | |
| 成像 | ImageQuant LAS4000 mini成像系统 | GE Healthcare | -- |
| 电镜 | 超薄切片机 | LEICA | EM |
| 扫描电子显微镜 | FEI | QUANTA | |
| Q-PCR | TRIzol试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| ReverTra Ace qPCR RT Master Mix(含gDNA去除剂) | Toyobo | FSQ-301 | |
| SYBR Green实时PCR预混液 | Toyobo | QPK-201 | |
| ViiA 7实时PCR系统 | Applied Biosystems | -- | |
| 流式细胞术 | I型胶原酶 | Worthington Biochemical | LS004186 |
| 脱氧核糖核酸酶I | Sigma-Aldrich | DN25 | |
| 抗Fc受体抗体 | Bio X Cell | BE0307, | |
| 抗CD45.2抗体 | Biolegend | 109839 | |
| 抗CD8抗体 | Biolegend | 100742 | |
| 抗PD-1抗体 | Biolegend | 135224 | |
| 抗CD44抗体 | Biolegend | 103044 | |
| 抗TIM3抗体 | Biolegend | 119716 | |
| 抗CD62L抗体 | Biolegend | 104432 | |
| 抗IL-15Rα抗体 | Biolegend | 153505 | |
| 抗Ki-67抗体 | Biolegend | 652413 | |
| 抗IFN-γ抗体 | Biolegend | 505836 | |
| 抗TNF-α抗体 | Biolegend | 506304 | |
| 抗Slamf6抗体 | BD | 740823 | |
| 抗TOX抗体 | eBioscience | 50-6502-82 | |
| 抗TCF-1抗体 | BD | 566692 | |
| 活/死细胞染料(可固定活力染色700) | BD Bioscience | 564997 | |
| Foxp3/转录因子染色缓冲液套装 | eBioscience | -- | |
| 细胞刺激鸡尾酒(含蛋白运输抑制剂) | -- | -- | |
| Phosflow固定缓冲液I | BD | -- | |
| 兔抗小鼠磷酸化STAT5抗体 | Cell Signaling Technology | 4322 | |
| 兔抗小鼠磷酸化STAT1抗体 | Cell Signaling Technology | 9167 | |
| 驴抗兔IgG Alexa Fluor 488 | Biolegend | Poly4064 | |
| 抗IL-15抗体 | Abcam | ab273625 | |
| 大鼠抗tdTomato抗体 | Chromo Tek | 5f8 | |
| 山羊抗大鼠IgG Alexa Fluor 594 | Biolegend | 405422 | |
| 蛋白运输抑制剂 | BD | 555029 | |
| LSRII流式细胞仪 | BD Biosciences | -- | |
| FlowJo软件 | Tree Star | -- | |
| Ca2+测量 | Fluo-4钙离子指示剂 | Yeasen Biotech Co. | 40704ES50 |
| 免疫组织化学 | 抗人Piezo2抗体 | Novus | NBP1-78624 |
| 抗人CD8抗体 | Abcam | ab237709 | |
| 奥林巴斯Slide View VS200 | Olympus | -- | |
| HALO病理定量图像分析软件 | Indica Labs | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | MC38、B16F1细胞系来源,培养基(DMEM高糖+10%FBS+青霉素/链霉素+HEPES),培养条件(37°C,5% CO2) 阅读提示:Methods:Cell lines and culture conditions |
| 基因敲除 | CRISPR-Cas9靶向Piezo2、IL-15的gRNA序列,shRNA靶向IRF-1的序列,转染试剂和筛选药物浓度(嘌呤霉素2 µg/ml) 阅读提示:Methods:Cell lines and culture conditions,Table S1 |
| 放射处理 | 体外照射剂量(30 Gy)、体内照射剂量(18 Gy)、照射时间点(肿瘤大小80–150 mm3) 阅读提示:Methods:In vivo tumor models and treatments |
| 动物模型 | 小鼠品系(C57BL/6,6-8周龄雌性),细胞接种量(2×10^6),分组和随机化方法 阅读提示:Methods:Mice,In vivo tumor models and treatments |
| CD8+ T细胞分析 | 流式抗体克隆号和稀释比例,细胞刺激条件(Cell Stimulation Cocktail 4小时),固定和透化缓冲液 阅读提示:Methods:Flow cytometry |