建立LAB Jak2VF CH小鼠模型
评估低等位基因负荷Jak2VF突变对动脉粥样硬化的影响
将1.5% Jak2VF BM与98.5% WT BM混合移植到致死辐照Ldlr–/–小鼠,喂食Western diet 16周。
Inflammatory crosstalk impairs phagocytic receptors and aggravates atherosclerosis in clonal hematopoiesis in mice
包括体外细胞实验、体内小鼠模型(BMT)、人样本分析以及scRNA-seq等多层次验证。
Ldlr–/–小鼠LAB Jak2VF CH模型 BMDMs(骨髓来源巨噬细胞) 人颈动脉斑块样本
BM移植比例:1.5% Jak2VF BM与98.5% WT BM Western diet喂养16周 药物处理:4D9抗体10 mg/kg每周腹腔注射,持续14周 IL-1R1缺失在非Jak2VF细胞中的效应
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估低等位基因负荷Jak2VF突变对动脉粥样硬化的影响
将1.5% Jak2VF BM与98.5% WT BM混合移植到致死辐照Ldlr–/–小鼠,喂食Western diet 16周。
确定WT细胞中的IL-1R1信号是否介导炎症串扰
将Jak2VF BM与Il1r1–/– BM混合移植,比较病变、坏死核心、纤维帽、MERTK和TREM2水平。
测试抗切割MERTK是否能减轻斑块坏死
使用MertkCR BM与Jak2VF BM混合移植,分析坏死核心面积、纤维帽和NETs。
评估TREM2激活对斑块稳定性的影响
对LAB小鼠给予4D9或同型对照IgG,分析纤维帽、坏死核心、TREM2和PDGFB表达。
阐明IL-1β如何介导MERTK切割
用IL-1β处理BMDMs,检测MERTK表面表达和可溶性MERTK,并使用ADAM17抑制剂TAPI-0验证。
探索TREM2激活后PDGFB上调的信号通路
用4D9处理BMDMs,检测Syk/AKT/β-catenin磷酸化及PDGFB表达,并使用Syk抑制剂fostamatinib验证。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| BMT | 聚肌苷酸聚胞苷酸 | -- | -- |
| 动脉粥样硬化分析 | Masson三色染色试剂盒 | MilliporeSigma | HT15 |
| 血浆胆固醇检测 | 胆固醇检测试剂盒 | Wako Diagnostics | -- |
| 血液分析 | FORCYTE兽医血液分析仪 | Oxford Science | -- |
| 免疫荧光 | Trilogy抗原修复液 | Cell MARQUE | 920P-09 |
| 抗Mac-2抗体 | Cedarlane | CL8942AP | |
| GFP抗体 | Abcam | ab13970 | |
| MERTK抗体 | R&D Systems | BAF591 | |
| 抗IL-1β抗体 | Abcam | ab9722 | |
| 抗TREM2抗体 | Proteintech | 27599-1-AP | |
| 抗H3cit抗体 | Abcam | ab5103 | |
| 抗切割gasdermin D抗体 | Cell Signaling Technology | 10137S | |
| 抗GSDMD抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-393581AF647 | |
| 抗MPO抗体 | R&D Systems | BAF3667 | |
| 抗decorin抗体 | Abcam | ab277636 | |
| 抗α-SMA抗体 | MilliporeSigma | C6198 | |
| 抗PDGFB抗体 | Abcam | ab23914 | |
| 抗PDGFRα抗体 | R&D Systems | AF1062 | |
| 抗TGF-β1抗体 | Abcam | ab215715 | |
| TUNEL染色 | 原位细胞死亡检测试剂盒 | MilliporeSigma | -- |
| 图像分析 | ImageJ | NIH | -- |
| 流式细胞术 | 活/死染料 | Thermo Fisher Scientific | MP34955 |
| 抗CD45抗体 | BioLegend | 103128 | |
| 抗CD11b抗体 | BioLegend | 101216 | |
| 抗Gr-1抗体 | BioLegend | 108445 | |
| 抗CD115抗体 | BioLegend | 134410 | |
| 抗TREM2抗体 | R&D Systems | FAB17291A | |
| 抗MERTK抗体 | Thermo Fisher Scientific | 12-5751-82 | |
| LSRCanto或LSR II流式细胞仪 | BD | -- | |
| 免疫印迹 | RIPA裂解液 | -- | -- |
| 核蛋白提取试剂盒 | Abcam | ab113474 | |
| 抗p-Syk抗体 | Cell Signaling Technology | 2710s | |
| 抗Syk抗体 | Cell Signaling Technology | 13198 | |
| 抗p-AKT抗体 | Cell Signaling Technology | 4060s | |
| 抗AKT抗体 | Cell Signaling Technology | 4685 | |
| 抗p-β-catenin抗体 | Cell Signaling Technology | 5651 | |
| 抗β-catenin抗体 | Cell Signaling Technology | 8480S | |
| 抗组蛋白H3抗体 | Cell Signaling Technology | 4499 | |
| 抗MERTK抗体 | R&D Systems | AF591 | |
| β-actin抗体 | Cell Signaling Technology | 4970s | |
| 人样本分析 | TruSeq链式总RNA试剂盒 | Illumina | -- |
| TruSeq链式mRNA试剂盒 | Illumina | -- | |
| scRNA-Seq | 多组织解离试剂盒2 | Miltenyi Biotec | 130-110-203 |
| GentleMACS解离器 | Miltenyi Biotec | 130-093-235 | |
| GentleMACS C管 | Miltenyi Biotec | 130-096-334 | |
| 死细胞去除试剂盒 | Miltenyi Biotec | 130-090-101 | |
| MS柱 | Miltenyi Biotec | 130-042-201 | |
| Illumina NovaSeq 6000测序仪 | Illumina | -- | |
| RT-qPCR | RNeasy Mini试剂盒 | QIAGEN | 74106 |
| NanoDrop分光光度计 | Thermo Scientific | -- | |
| 实时PCR系统 | Applied Biosystem | -- | |
| SYBR Green预混液 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 小鼠模型 | Ldlr–/–小鼠性别(雌性)、年龄(8-12周)、辐照剂量(10.5 Gy)、BM细胞数(6百万)、Jak2VF BM比例(1.5%) 阅读提示:Methods - Mice, BMT |
| 饮食处理 | Western diet(TD88137)喂养时间(16周) 阅读提示:Methods - Mice |
| 药物处理 | 4D9或IgG剂量(10 mg/kg)、给药途径(腹腔注射)、频率(每周)、持续时间(14周) 阅读提示:Methods - BMT and antibody administration |
| 细胞处理 | BMDMs分化条件(L-929条件培养基20%,5天);IL-1β浓度(25 ng/mL)和处理时间(6小时);TAPI-0浓度(5 μM);fostamatinib浓度(文中未明确说明) 阅读提示:Methods - BMDMs, Figure 5 and Supplemental Figure 6 legends |
| 检测指标 | 病变面积、坏死核心、纤维帽、胶原含量、NETs(H3cit+MPO+)、MERTK和TREM2表达、PDGFB和PDGFRα表达 阅读提示:Results, Figure legends 1-7 |