NAC保护效应验证
验证NAC对mdx EDL肌肉ECC力量丧失的保护作用。
将mdx EDL肌肉在含有或不含NAC(20 mM)的Krebs缓冲液中孵育,进行10次ECC,记录力变化。
Impaired hydrogen sulfide biosynthesis underlies eccentric contraction-induced force loss in dystrophin-deficient skeletal muscle
包含体外肌肉生理实验、蛋白质印迹、化学生物学(H2S供体/清除剂)、化学蛋白质组学(iodo TMT)及体内转基因小鼠模型等,涉及多层级验证。
mdx小鼠(C57BL/10ScSn-Dmdmdx/J) WT小鼠(C57BL/10SnJ) DysΔMTB-mdx转基因小鼠 mdx/p47–/–小鼠
H2S补充(NaHS)的剂量和时间(250 μM重复给药或1,000 μM单次给药) ECC力损失的测量条件(10%或2.5%长度变化) NAC和l-半胱氨酸的浓度(20 mM NAC, 40 mM l-半胱氨酸) 蛋白质巯基氧化检测方法(maleimide标记和Dyn-2探针) 化学蛋白质组学分析(iodoTMT标记和LC-MS/MS)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证NAC对mdx EDL肌肉ECC力量丧失的保护作用。
将mdx EDL肌肉在含有或不含NAC(20 mM)的Krebs缓冲液中孵育,进行10次ECC,记录力变化。
评估mdx肌肉中TSP相关酶表达和代谢产物水平。
通过Western blot检测TSP酶(CBS、CSE、GOT1、MPST、TRX)的表达,并测量H2S水平。
验证H2S补充是否能保护mdx EDL肌肉免受ECC力量丧失。
使用H2S供体NaHS(快速释放)和GYY4137(缓慢释放)处理mdx EDL肌肉,进行ECC。
评估mdx肌肉中蛋白质氧化损伤及其对ECC的敏感性。
使用maleimide标记和Dyn-2探针检测蛋白质氧化,并在H2O2存在下进行ISO或ECC。
分析ECC和NaHS处理对蛋白质半胱氨酸氧化状态的影响。
使用iodoTMT标记和LC-MS/MS分析WT和mdx EDL肌肉中的可逆半胱氨酸氧化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | mdx小鼠(C57BL/10ScSn-Dmdmdx/J) | The Jackson Laboratory | -- |
| DysΔMTB-mdx小鼠 | -- | -- | |
| p47–/–小鼠 | -- | -- | |
| 体外肌肉生理 | Krebs-Ringer碳酸氢盐缓冲液 | -- | -- |
| GYY4137 | Sigma-Aldrich | SML0100 | |
| N-乙酰半胱氨酸 | Sigma-Aldrich | A7250 | |
| L-半胱氨酸 | Sigma-Aldrich | C7352 | |
| 过氧化氢 | Sigma-Aldrich | H1009 | |
| gp91ds-TAT | Anaspec | AS-63818 | |
| GSK2795039 | GLPBIO | GC32681 | |
| 7-叠氮-4-甲基香豆素 | Sigma-Aldrich | 802409 | |
| 免疫印迹 | 抗AE1抗体 | Proteintech | 28131-1-AP |
| 抗ASCT1抗体 | Sigma-Aldrich | AV43827 | |
| 抗ACY1抗体 | Abcam | ab189399 | |
| 抗GCL抗体 | Thermo Fisher Scientific | MA5-26346 | |
| 抗GR抗体 | Thermo Fisher Scientific | PA570004 | |
| 抗GPX抗体 | Thermo Fisher Scientific | PA5-26323 | |
| 抗GRX抗体 | Abcam | ab45953 | |
| 抗GSTm1抗体 | Sigma-Aldrich | AV41769 | |
| 抗GSTm2抗体 | Thermo Fisher Scientific | PA5-89264 | |
| 抗CBS抗体 | Proteintech | 14787-1-AP | |
| 抗CSE抗体 | Abcam | ab151769 | |
| 抗GOT1抗体 | Abcam | ab239487 | |
| 抗MPST抗体 | Novus Biologicals | NBP1-54734 | |
| 抗TRX抗体 | Abcam | ab273877 | |
| 抗GAPDH抗体 | Sigma-Aldrich | G8795 | |
| 抗GAPDH抗体(兔) | Sigma-Aldrich | G9545 | |
| DyLight 680山羊抗小鼠IgG | Cell Signaling Technology | 5470S | |
| DyLight 680山羊抗兔IgG | Cell Signaling Technology | 5366S | |
| DyLight 800山羊抗小鼠IgG | Cell Signaling Technology | 5257S | |
| DyLight 800山羊抗兔IgG | Cell Signaling Technology | 5151S | |
| LI-COR Odyssey成像系统 | LI-COR Biotechnology | -- | |
| 谷胱甘肽检测 | MES缓冲液 | Cayman Chemical | 703010 |
| 偏磷酸 | Sigma-Aldrich | 239275 | |
| 谷胱甘肽还原酶 | Sigma-Aldrich | G3664 | |
| β-烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸 | Sigma-Aldrich | N1630 | |
| Spectra Max Plus分光光度计 | Molecular Devices | -- | |
| 蛋白质氧化检测 | 5,5-二甲基-1,3-环己二酮 | Sigma-Aldrich | D153303 |
| N-乙基马来酰亚胺 | Sigma-Aldrich | E3876 | |
| 二硫苏糖醇 | MilliporeSigma | DTT-RO | |
| DyLight 800马来酰亚胺 | Thermo Fisher Scientific | 46621 | |
| Dyn-2探针 | Kerafast | EST018 | |
| IRDye 800CW叠氮红外染料 | LI-COR Biotechnology | 929-60000 | |
| 三(2-羧乙基)膦 | Sigma-Aldrich | 646547 | |
| 三[(1-苄基-1H-1,2,3-三唑-4-基)甲基]胺 | Sigma-Aldrich | 678937 | |
| 硫酸铜 | MilliporeSigma | PHR1477 | |
| H2S含量检测 | Pierce BCA蛋白质测定试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 23225 |
| 7-叠氮-4-甲基香豆素 | Sigma-Aldrich | 802409 | |
| 蛋白质组学样品制备 | 珠磨机 | Next Advance | 4116-BBY24M |
| 三(2-羧乙基)膦 | Thermo Fisher Scientific | 77720 | |
| Zeba脱盐柱 | Thermo Fisher Scientific | 89890 | |
| iodoTMT六重同量异位标签试剂 | Thermo Fisher Scientific | 90101 | |
| 抗TMT抗体树脂 | Thermo Fisher Scientific | 90076 | |
| 质谱分析 | Orbitrap Eclipse质谱仪 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| Dionex Ultimate 3000 RSLCnano液相色谱泵 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| C18-AQ ReproSil-Pur色谱柱 | Maisch GmbH Ammerbuch | -- | |
| 生理成像 | MyoCam相机 | Photometrics | -- |
| MetaFluor软件 | Molecular Devices | -- | |
| 数据处理 | Proteome Discoverer 2.5.0.400 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| R项目(版本2023.06.0+421) | -- | -- | |
| 统计分析 | GraphPad Prism软件(版本9或10) | GraphPad Software | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型 | 小鼠品系(WT: C57BL/10SnJ, mdx: C57BL/10ScSn-Dmdmdx/J)、年龄(90-115天)、性别(雄性) 阅读提示:Methods: Animals |
| 体外肌肉生理实验 | Krebs缓冲液组成(具体浓度)、温度(25°C)、刺激参数(200 ms, 175 Hz, 150 V)、ECC参数(缩短至95% LO,然后伸长至105% LO,速度0.5 LO/s),药物浓度(NAC 20 mM, l-cysteine 40 mM, NaHS 250 μM或1000 μM, GYY4137 100 μM等) 阅读提示:Methods: In vitro EDL physiological experiments |
| 蛋白质印迹 | 抗体稀释比例、孵育条件、内参选择 阅读提示:Methods: Western blotting |
| 蛋白质氧化检测 | 试剂浓度(如Dimedone 5 mM, NEM 50 mM, DTT 5 mM),处理时间,检测方法 阅读提示:Methods: Quantification of protein thiol oxidation using maleimide |
| 化学蛋白质组学 | ECC次数(4次)、NaHS浓度(750 μM)、样品制备细节(如TCEP浓度、iodoTMT标记条件)、LC-MS/MS参数 阅读提示:Methods: Muscle preparation for proteomics experiments, Cysteine oxidation chemo-proteomics experiments |