化合物合成与结构-活性关系(SAR)研究
优化HSN748的化学结构,提高其对FLT3突变体的选择性和效力。
合成了一系列HSN748类似物,通过替换哌嗪环、修饰三氟甲基等基团,评估其对FLT3ITD及耐药突变细胞系的抑制活性。
Alkynyl nicotinamides show antileukemic activity in drug-resistant acute myeloid leukemia
包含体外细胞系(BaF3、MOLM14)、体内异种移植模型(NSG/NSGS小鼠)、遗传小鼠模型(Tet2–/–:Flt3ITD)以及患者来源异种移植(PDX)等多个独立证据层级,并进行了功能验证和机制验证。
BaF3细胞表达FLT3ITD及耐药突变 MOLM14和MV411细胞系 Tet2–/–:Flt3ITD/ITD遗传小鼠模型 AML患者来源异种移植(PDX)模型 NSG和NSGS小鼠移植模型
HSN748和HSN608对FLT3ITD的IC50值(HSN748为0.04 nM,HSN608为0.09 nM) HSN748对FLT3ITD–F691L和FLT3ITD–D835Y突变细胞的IC50值(分别为1.52 nM和6.62 nM) HSN748在BaF3细胞中的靶点停留时间(385分钟) 体内实验中HSN748的给药剂量(20 mg/kg,口服,每周5次) PDX实验中使用NSGS小鼠,移植后1周随机分组,治疗4周
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
优化HSN748的化学结构,提高其对FLT3突变体的选择性和效力。
合成了一系列HSN748类似物,通过替换哌嗪环、修饰三氟甲基等基团,评估其对FLT3ITD及耐药突变细胞系的抑制活性。
确定HSN748对FLT3及其突变体的结合亲和力,以及其对激酶组的选择性。
使用KINOMEScan平台对超过450种激酶进行结合分析,并计算HSN748对FLT3突变体的解离常数(Kd)。
预测HSN748与FLT3的结合模式,并评估其结合稳定性。
使用CANDOCK软件将HSN748与FLT3(PDB ID: 4XUF)进行对接,并进行100 ns的分子动力学模拟,分析配体与DFG基序的距离和RMSD。
评估HSN608和HSN748对FLT3突变细胞增殖的抑制作用,并验证其对FLT3信号通路的抑制。
用不同浓度的抑制剂处理表达FLT3ITD、FLT3ITD–F691L、FLT3ITD–D835Y的BaF3细胞以及MOLM14、MV411细胞,测定细胞活力,并通过Western blot检测FLT3、STAT5、ERK的磷酸化水平。
评估HSN748在异种移植模型中的抗白血病效果,并验证其体内靶点抑制。
将MOLM14或MOLM14-F691L细胞植入NSG小鼠,给予HSN748或Gilteritinib治疗,监测肿瘤生长和生存期。通过药代动力学和药效动力学分析评估药物暴露和FLT3信号抑制。
全局评估HSN748对MOLM14细胞蛋白质表达和磷酸化状态的影响。
用100 nM HSN748处理MOLM14细胞2小时和24小时,进行基于质谱的蛋白质组学和磷酸化蛋白质组学分析。
评估HSN748对MOLM14细胞基因表达的影响。
用2 nM HSN748处理MOLM14细胞24小时,提取RNA进行RNA-Seq分析,鉴定差异表达基因。
在携带Tet2–/–和Flt3ITD/ITD突变的小鼠模型中验证HSN748的抗白血病活性。
将Tet2–/–:Flt3ITD/ITD小鼠的骨髓单个核细胞与野生型细胞混合移植入致死辐照的F1受体小鼠,6周后开始口服HSN748治疗(20 mg/kg,每周5次,共6周),分析外周血、脾脏和骨髓的细胞变化。
在PDX模型中比较HSN748与Gilteritinib的抗白血病效果。
将多种突变组合的AML患者细胞移植入NSGS小鼠,1周后随机分组,给予HSN748或Gilteritinib治疗(20 mg/kg,口服,每周5天,共4周),监测外周血、脾脏和骨髓中人类CD45阳性细胞的比例,并评估生存期。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 细胞活力测定 | WST-1试剂 | Clontech / Roche Diagnostics | 11644807001 |
| Western blot | pFLT3抗体 | Cell Signaling Technology | 3461 |
| pSTAT5抗体 | Cell Signaling Technology | 9359 | |
| pERK抗体 | Cell Signaling Technology | 4370 | |
| ERK1/2抗体 | Santa Cruz | sc514302 | |
| FLT3抗体 | Cell Signaling Technology | 3462 | |
| GAPDH-HRP抗体 | Cell Signaling Technology | 884 | |
| 分子动力学模拟 | CANDOCK | -- | -- |
| 基因表达分析 | Trizol试剂 | -- | -- |
| 体内实验 | 甲基纤维素 | -- | -- |
| 柠檬酸盐缓冲液 | -- | -- | |
| NSG小鼠 | -- | -- | |
| NSGS小鼠 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞活力测定 | 细胞密度(5×10^3细胞/孔)、药物处理时长(72小时)、WST-1孵育时间(4小时) 阅读提示:Methods:Cell culture and in vitro drug studies |
| Western blot | 细胞处理时长(1小时)、抗体稀释比例未明确、蛋白上样量未明确 阅读提示:Methods:Western blotting |
| 体内药效实验 | 细胞接种数量(5×10^5)、动物品系(NRG)、给药剂量(未明确,参照图例)、给药途径(口服)、给药频率(每天1次,每周5天) 阅读提示:Methods:In vivo drug studies 和 Figure 3 图例 |
| 药代动力学 | 给药剂量(未明确)、给药途径(静脉和口服)、采血时间点、LC/MS分析方法 阅读提示:Methods:In vivo drug studies |
| 蛋白质组学实验 | 细胞处理浓度(100 nM)、处理时间(2小时和24小时)、生物学重复次数(3次) 阅读提示:Methods:Drug treatment for proteomics experiment |
| RNA-Seq实验 | 细胞处理浓度(2 nM)、处理时间(24小时)、生物学重复次数(3次) 阅读提示:Methods:RNA-Seq analysis |
| 遗传小鼠模型 | 细胞移植比例(1:1)、受体小鼠辐照剂量(致死剂量)、治疗剂量(20 mg/kg,口服,每周5次,共6周) 阅读提示:Results:Therapeutic efficacy of HSN748 in a genetic mouse model...;Figure 6 图例 |
| PDX模型 | 细胞移植数量(未明确)、辐照剂量(200 rads)、治疗剂量(20 mg/kg,口服,每周5天,共4周) 阅读提示:Results:HSN748 outperforms Gilteritinib...;Figure 7 图例 |