构建Lemd2 c.T38>G KI小鼠模型
创建携带人类致病突变的小鼠模型,以模拟人类疾病。
使用CRISPR-Cas9和ssODN供体模板,将Lemd2基因第38位胸腺嘧啶突变为鸟嘌呤,获得KI/KI小鼠,并通过Sanger测序确认。
Loss of function of the nuclear envelope protein LEMD2 causes DNA damage-dependent cardiomyopathy
包含两种独立小鼠模型(KI和cKO)、体外细胞实验、机械应力实验、转录组分析及基因治疗验证,功能与机制验证完整。
Lemd2 c.T38>G 敲入(KI/KI)小鼠 心肌细胞特异性Lemd2敲除(cKO)小鼠 C2C12 成肌细胞 分离的原代心肌细胞
Lemd2 c.T38>G突变纯合小鼠(KI/KI)的存活率及心脏表型 心肌细胞特异性Lemd2敲除(cKO)小鼠的围产期致死率及心脏功能 DNA损伤标志物γ-H2AX和凋亡(TUNEL)在心肌细胞中的检测 AAV9-Lemd2基因治疗的剂量和给药途径
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
创建携带人类致病突变的小鼠模型,以模拟人类疾病。
使用CRISPR-Cas9和ssODN供体模板,将Lemd2基因第38位胸腺嘧啶突变为鸟嘌呤,获得KI/KI小鼠,并通过Sanger测序确认。
研究LEMD2在心肌细胞中的特异性功能。
通过CRISPR-Cas9生成Lemd2fl/fl小鼠,与Myh6-Cre转基因小鼠杂交,获得心肌细胞特异性敲除小鼠。
确定LEMD2功能缺失对心脏结构和功能的影响。
通过生存分析、超声心动图、组织学染色(H&E、Masson三色)评估心脏形态和功能。
探究LEMD2突变对染色质结构和基因表达的影响。
使用电子显微镜观察核膜相关异染色质,通过RNA-Seq分析差异表达基因及通路富集。
验证心肌细胞是否发生肥大以及DNA损伤是否参与病理过程。
分离心肌细胞,测量细胞大小;通过γ-H2AX免疫荧光检测DNA双链断裂;RT-qPCR检测p53信号通路及DDR相关基因。
研究LEMD2缺失是否导致核膜不稳定及机械应力下的DNA损伤。
从P1 cKO小鼠分离心肌细胞,使用confiner设备施加20 μm压缩1小时,检测γ-H2AX和TUNEL阳性细胞,分析核面积和核固缩度。
测试过表达野生型LEMD2是否能挽救KI/KI小鼠的心脏功能。
构建AAV9-Lemd2载体,通过腹腔注射给予P4 KI/KI小鼠,2个月后通过超声心动图和组学分析评估治疗效果。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 基因编辑 | Cas9信使RNA | -- | -- |
| Lemd2 单向导RNA | -- | -- | |
| 单链寡核苷酸 | IDT Ultramer DNA oligos | -- | |
| 基因分型 | 定制TaqMan SNP基因分型检测 | Thermo Fisher | 4332077 |
| 动物实验 | Myh6-Cre转基因小鼠 | Jackson Laboratory | 011038 |
| 组织学 | 组织冷冻介质 | Thermo Fisher Scientific | 15-183-13 |
| 黄蓍胶 | MilliporeSigma | G1128 | |
| 基恩士BZ-X700系列显微镜 | KEYENCE | -- | |
| 免疫荧光 | γ-H2AX抗体 | CST | 9718S |
| cTnT抗体 | Proteintech | 15513-1-AP | |
| cTnT抗体 | Thermo Fisher Scientific | MA5-12960 | |
| Ki67抗体 | Thermo Fisher Scientific | PA5-19462 | |
| HCN4抗体 | Abcam | ab32675 | |
| 山羊抗大鼠Alexa Fluor 488 | Thermo Fisher Scientific | A-11006 | |
| 山羊抗兔Alexa Fluor 488 | Thermo Fisher Scientific | A-11008 | |
| DAPI | -- | -- | |
| Immu-Mount封片剂 | Fisher | 9990412 | |
| ProLong Gold抗淬灭封片剂(含DAPI) | Thermo Scientific | P36971 | |
| TUNEL检测 | Click-iT Plus TUNEL检测试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | C10619 |
| 电镜 | JEOL 1400 Plus透射电子显微镜 | JEOL | -- |
| 分子克隆 | pMXs-puro载体 | Cell Biolabs | RTV-012 |
| QuikChange II XL定点突变试剂盒 | Agilent Technologies | 200521 | |
| 细胞培养 | C2C12成肌细胞 | ATCC | CRL-1772 |
| Platinum-E细胞 | Cell Biolabs | RV-101 | |
| DMEM培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素/链霉素 | -- | -- | |
| 转染 | FuGENE6转染试剂 | Promega | E2692 |
| 病毒感染 | 聚凝胺 | MilliporeSigma | H9268 |
| 免疫荧光 | LEMD2抗体 | MilliporeSigma | HPA017340 |
| 山羊抗兔Alexa Fluor 555 | Thermo Fisher Scientific | A-27039 | |
| 蛋白提取 | RIPA裂解缓冲液 | MilliporeSigma | R0278 |
| 蛋白酶抑制剂 | Roche | 04693159001 | |
| 磷酸酶抑制剂 | Roche | 04906837001 | |
| Bioruptor Pico超声破碎仪 | Diagenode | -- | |
| 蛋白定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher | 23225 |
| Western blot | PVDF膜 | Millipore | IPVH00010 |
| LEMD2抗体 | MilliporeSigma | HPA017340 | |
| GAPDH抗体 | MilliporeSigma | MAB374 | |
| 辣根过氧化物酶标记的二抗 | Bio-Rad | 1706515 and 1706516 | |
| Western blot发光液 | Santa Cruz Biotechnology Inc. | sc2048 | |
| ChemiDoc MP成像系统 | Bio-Rad | -- | |
| 心肌细胞分离 | II型胶原酶 | -- | -- |
| 小鼠/大鼠心肌细胞分离试剂盒 | Cellutron Life Technologies | NC-6031 | |
| 心肌细胞培养 | 胶原蛋白 | -- | -- |
| 层粘连蛋白 | -- | -- | |
| 免疫荧光 | ACTN2抗体 | Sigma-Aldrich | A7811 |
| 山羊抗小鼠Alexa Fluor 488 | Thermo Fisher Scientific | A-21121 | |
| 心肌肌钙蛋白I抗体 | Abcam | ab47003 | |
| Lamin B1抗体 | Santa Cruz Biotechnology Inc. | sc-374015 | |
| 山羊抗小鼠IgG1 Alexa Fluor 555 | Thermo Fisher Scientific | A-21127 | |
| 核染色 | Hoechst 33342 | Thermo Fisher Scientific | H3570 |
| 机械压缩 | 6孔静态细胞限位装置 | 4D cell | -- |
| 钙成像 | Fura-2 AM | Thermo Fisher Scientific | F1221 |
| 钙成像和收缩性测量 | IonOptix心肌细胞钙和收缩性测量系统 | IonOptix | -- |
| 转录组测序 | TRIzol试剂 | Thermo Fisher Scientific | 15596026 |
| RNeasy Micro试剂盒 | QIAGEN | 74004 | |
| KAPA mRNA HyperPrep试剂盒 | Kapa Biosystems | kk8580 | |
| NextSeq500测序仪 | Illumina | -- | |
| RT-qPCR | iScript逆转录预混液 | Bio-Rad | -- |
| KAPA SYBR Fast qPCR预混液 | KAPA | KK4605 | |
| QuantStudio 5实时荧光定量PCR仪 | Applied Biosystems | -- | |
| 超声心动图 | VisualSonics Vevo2100成像系统 | VisualSonics | -- |
| 心电图 | Power Lab/4SP数据采集系统 | ADInstruments | -- |
| 基因治疗 | 腺相关病毒9型-Lemd2 | -- | -- |
| 生理盐水 | -- | -- | |
| 统计和图像分析 | Prism软件 | GraphPad | -- |
| 图像分析 | ImageJ软件 | NIH | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| KI/KI小鼠模型建立 | sgRNA序列、ssODN模板序列、注射剂量、小鼠品系 阅读提示:Methods中的Mouse models部分 |
| cKO小鼠模型建立 | sgRNA序列、ssODN模板序列、Cre小鼠品系 阅读提示:Methods中的Mouse models部分 |
| 超声心动图测量 | 小鼠周龄、麻醉状态、测量参数和公式 阅读提示:Methods中的Transthoracic echocardiography部分及图例 |
| 心电图记录 | 麻醉条件、电极位置、记录时间、QTc计算公式 阅读提示:Methods中的Electrocardiography部分 |
| 心肌细胞分离 | 胶原酶浓度、灌注缓冲液成分、消化时间 阅读提示:Methods中的CM isolation部分 |
| 机械压缩实验 | confiner设备参数、压缩距离(20 μm)、压缩时间(1小时) 阅读提示:Methods中的CM confinement experiments部分 |
| RNA-Seq分析 | RNA提取方法、建库试剂盒、测序平台、分析参数 阅读提示:Methods中的Bulk RNA-Seq analysis和Bioinformatics部分 |
| 基因治疗实验 | AAV血清型、启动子、剂量(5×10^13 vg/kg)、给药途径(i.p.)、给药时间(P4) 阅读提示:Methods中的Lemd2 gene therapy部分 |