验证BCMA信号在MM中的必要性
确认BCMA信号是否对MM肿瘤的生长和存活至关重要。
在INA-6和MM1.R细胞中引入dox诱导的BCMA shRNA,在NSG小鼠中建立皮下移植瘤模型,通过肿瘤体积、Ki67和TUNEL染色评估增殖和凋亡。
Developing high-affinity decoy receptors to treat multiple myeloma and diffuse large B cell lymphoma
包含细胞系遗传敲低与药物处理、核糖体图谱与多聚体分析、MM与DLBCL异种移植模型、PDX模型以及非人灵长类毒性研究等多个独立证据层级,并进行了功能与机制验证。
多发性骨髓瘤细胞系(U266、MM1.R、INA-6) 弥漫大B细胞淋巴瘤细胞系(SU-DHL-6、Daudi) MM患者来源异种移植(PDX)模型 非人灵长类(食蟹猴)模型
BCMA敲低对MM肿瘤生长的影响(使用dox诱导shRNA,INA-6和MM1.R细胞,NSG小鼠) BCMA对ATMIN翻译效率的调控(siRNA敲低,核糖体分析、多聚体分析) sBCMA-Fc V3的体内抗肿瘤效果(MM1.R、SU-DHL-6、Daudi异种移植模型,剂量5或10 mg/kg,每48小时一次) 非人灵长类毒性研究(单次静脉注射0.1-100 mg/kg,观察42天)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确认BCMA信号是否对MM肿瘤的生长和存活至关重要。
在INA-6和MM1.R细胞中引入dox诱导的BCMA shRNA,在NSG小鼠中建立皮下移植瘤模型,通过肿瘤体积、Ki67和TUNEL染色评估增殖和凋亡。
探究BCMA敲低对MM细胞蛋白质翻译的影响。
对siBCMA处理的U266细胞进行核糖体图谱分析(Ribo-seq)和RNA-seq,计算翻译效率,并通过多聚体分级、Western blot和CRISPR敲除验证ATMIN的调控。
检验野生型sBCMA-Fc是否通过阻断APRIL/BCMA信号抑制MM,并评估其对DLBCL的效果。
在体外用sBCMA-Fc处理MM细胞(U266、MM1.R)和DLBCL细胞(SU-DHL-6、Daudi),进行细胞毒性实验;在体内用sBCMA-Fc处理MM1.R、INA-6异种移植模型及PDX模型,并评估DLBCL模型(SU-DHL-6)。
提高sBCMA对BAFF的结合亲和力,以增强对BAFF驱动的DLBCL的疗效。
通过易错PCR构建sBCMA突变体文库,酵母表面展示,FACS筛选对APRIL高亲和力克隆,进行测序和亲和力测定。
验证sBCMA-Fc V3的结构和生物学特性,并评估其抗肿瘤活性。
计算建模分析突变效应;在MM(MM1.R)和DLBCL(SU-DHL-6、Daudi)模型中测试sBCMA-Fc V3的体外和体内疗效,并与其他BAFF抑制剂比较。
评估sBCMA-Fc V3在非人灵长类中的急性毒性和靶向机制。
对食蟹猴进行单次静脉输注sBCMA-Fc V3(0.1、1、10、100 mg/kg),观察42天,评估体重、血液学、淋巴细胞、免疫球蛋白等。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素/链霉素 | -- | -- | |
| 人白细胞介素-6 | -- | -- | |
| 基质胶 | Corning | 356230 | |
| 细胞分离 | EasySep人B细胞分离试剂盒 | Stemcell Technologies | 17954 |
| 分子实验 | TurboDNase | Thermo Fisher Scientific | -- |
| RNasin | Promega | -- | |
| SMARTer smRNA-Seq试剂盒(Illumina) | Takara Bio | 635029 | |
| TRIzol试剂 | Invitrogen | -- | |
| iScript supermix | Bio-Rad | -- | |
| 流式细胞术 | 抗c-Myc FITC抗体 | Abcam | -- |
| 抗HA AF647 | Invitrogen | -- | |
| 抗人IgG-Alexa Fluor 488 | Thermo Fisher Scientific | A28175 | |
| 蛋白质印迹 | 抗BCMA抗体 | Proteintech | 27724-1-AP |
| 抗Pan-Akt抗体 | Cell Signaling Technology | 4691 | |
| 抗pAkt抗体 | Cell Signaling Technology | 4060 | |
| 抗磷酸化p38 MAPK抗体 | Cell Signaling Technology | 4511 | |
| 抗p38 MAPK抗体 | Cell Signaling Technology | 8690 | |
| 抗磷酸化mTOR ser2448抗体 | Cell Signaling Technology | 5536 | |
| 抗总mTOR抗体 | Cell Signaling Technology | 2983 | |
| 抗Raptor抗体 | Cell Signaling Technology | 2280 | |
| 抗磷酸化Raptor Ser792抗体 | Cell Signaling Technology | 89146 | |
| 抗磷酸化p70 S6K抗体 | Cell Signaling Technology | 9204 | |
| 抗磷酸化S6抗体 | Cell Signaling Technology | 9204 | |
| 抗ATMIN/ASCIZ抗体 | Millipore Sigma | AB3271-I | |
| 抗β-actin抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-47778 | |
| HRP标记的抗山羊抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-2020 | |
| HRP标记的抗兔抗体 | Thermo Fisher Scientific | A16110 | |
| Bio-Rad Western C显影试剂 | Bio-Rad | 170-5060 | |
| Chemidoc数字成像仪 | Bio-Rad | 1708280 | |
| ELISA | 人APRIL ELISA试剂盒 | R&D Systems | DY884B |
| 人BAFF ELISA试剂盒 | R&D Systems | DBLYS0B | |
| 小鼠APRIL ELISA试剂盒 | My BioSource | MBS738004 | |
| 小鼠BAFF ELISA试剂盒 | R&D Systems | MBLYS0 | |
| 人总IgG蛋白ELISA试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | BMS2091 | |
| 小鼠总IgG蛋白ELISA试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 88-50400-88 | |
| 小鼠IgM ELISA试剂盒 | My BioSource | MBS564075 | |
| 小鼠IgA ELISA试剂盒 | My BioSource | MBS564073 | |
| 免疫组织化学 | 抗人Ki67抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-23900 |
| 生物素化的抗小鼠二抗 | Vector Laboratories | BA92001 | |
| DAB底物试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 34002 | |
| ApopTag过氧化物酶原位凋亡检测试剂盒 | Millipore Sigma | S7100 | |
| 动物实验 | 抗CD38抗体 | SelleckChem | A2027 |
| 可溶性TACI-Fc | BioLegend | 577708 | |
| 抗BAFF抗体 | Invitrogen | MA1-822774 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| BCMA敲低实验 | BCMA敲低效率(shRNA序列和转染/转导方法),dox浓度和时间,细胞系(INA-6、MM1.R),小鼠品系(NSG),肿瘤接种细胞数,检测终点(肿瘤体积、Ki67、TUNEL) 阅读提示:Materials and methods: In vitro genetic knockdown studies, In vivo studies; Figure 1 legend |
| 核糖体分析 | siRNA敲低效率,细胞系(U266),裂解缓冲液成分(CHX浓度),测序平台,数据分析方法(RiboFlow),差异翻译效率阈值 阅读提示:Materials and methods: Ribo-seq RNA library preparation, Ribo-seq analysis; Figure 2 legend |
| sBCMA-Fc V3体内实验 | 给药剂量(5或10 mg/kg),给药频率(每48小时),细胞系(MM1.R、SU-DHL-6、Daudi),小鼠品系(NSG或NOD-scid),肿瘤接种细胞数(1×10^7或5×10^6),Matrigel浓度 阅读提示:Materials and methods: In vivo studies; Figure 5 legend and Figure S5 legend |
| 非人灵长类毒性研究 | 给药剂量(0.1、1、10、100 mg/kg),给药途径(静脉输注),观察周期(42天),血液学参数,免疫球蛋白水平,淋巴细胞亚群分析 阅读提示:Materials and methods: Primate toxicology studies; Figure 6 legend |