体细胞结构变异驱动黑色素瘤中不同的致癌模式

Somatic structural variants drive distinct modes of oncogenesis in melanoma

作者信息Jake R Conway, Riaz Gillani, Jett Crowdis, Brendan Reardon, Jihye Park, Seunghun Han, Breanna Titchen, Mouadh Benamar, Rizwan Haq, Eliezer M Van Allen
PMID38758740
发布时间2024-05-14
DOI10.1172/JCI177270

摘要

黑色素瘤中结构变异(SVs)的多样性及其对肿瘤发生的影响尚未完全阐明。我们对不同组织学和基因组亚型的黑色素瘤进行了统一的SVs分析,发现各亚型间存在显著的整体特征差异。这些差异包括SVs及其类别的发生频率与规模、它们与染色体碎裂事件的关系,以及改变拓扑关联域(TAD)边界的SVs对癌症相关基因的影响。基于先前在三重野生型皮肤黑色素瘤亚群中发现的双链断裂修复缺陷,我们在具有该突变特征的黑色素瘤中识别出MRE11和NBN的功能缺失性SVs。通过实验性敲除MRE11和NBN基因,并在黑色素瘤细胞中进行奥拉帕尼细胞活力检测,结果表明这两个基因的失调可能导致皮肤黑色素瘤对PARP抑制剂敏感。总体而言,对黑色素瘤SVs的统一分析揭示了独特的整体基因组特征和分子驱动因素,这些发现可能具有生物学意义及治疗价值。

实验方法

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