鉴定ITA的GPCR受体
筛选能够被ITA激活的GPCR受体
在HEK293细胞中共转染GPCR、Gα16和水母发光蛋白质粒,通过水母发光蛋白实验检测ITA诱导的钙动员,筛选了301个人GPCR。
The immunometabolite itaconate stimulates OXGR1 to promote mucociliary clearance during the pulmonary innate immune response
实验包含GPCR筛选、体外细胞信号通路验证、突变体功能实验、动物感染模型及原代细胞和人体细胞实验,多层次证据支持结论。
HEK293细胞(过表达OXGR1) 骨髓来源巨噬细胞(BMDMs) 小鼠原代气管上皮细胞 小鼠肺部感染模型(铜绿假单胞菌PAO1)
ITA浓度:0.3 mM(EC50) GPCR筛选:301个人GPCR 小鼠感染模型:PAO1菌株,1×10^7 CFU ITA补充剂量:1 mM 检测时间:感染后12小时
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
筛选能够被ITA激活的GPCR受体
在HEK293细胞中共转染GPCR、Gα16和水母发光蛋白质粒,通过水母发光蛋白实验检测ITA诱导的钙动员,筛选了301个人GPCR。
探究ITA/OXGR1激活后的下游信号通路
在过表达OXGR1的HEK293细胞中,检测ITA刺激后的钙动员、ERK磷酸化、β-arrestin依赖的受体内吞,并通过siRNA敲低Gq/11和β-arrestin验证信号依赖。
验证ITA通过正构位点激活OXGR1
基于AlphaFold结构预测OXGR1正构位点残基,构建多个点突变体,通过钙动员和受体内吞实验检测突变对ITA响应的影响,并用细胞热位移实验验证结合。
确定感染条件下气道中ITA和α-KG的浓度是否足以激活OXGR1
构建铜绿假单胞菌PAO1感染的小鼠模型,收集支气管肺泡灌洗液(BAL),用LC-MS检测ITA浓度,用GC-MS检测α-KG浓度,并利用尿素浓度计算上皮衬液中的浓度。
验证ITA/OXGR1信号对呼吸道黏液分泌和运输的影响
使用原代小鼠和人气道上皮细胞,检测ITA刺激后的钙动员;用离体小鼠气管培养和ALI培养系统,测量荧光珠运动评估黏液运输;小鼠鼻内给予ITA后,用阿尔辛蓝/PAS染色检测黏液分泌。
明确ITA/OXGR1在气道病原体清除中的功能
对WT、Oxgr1 KO和Irg1 KO小鼠进行PAO1感染,检测BAL和肺组织的菌落形成单位(CFU);部分实验在感染同时补充ITA,观察对细菌清除的影响。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| GPCR筛选 | PRESTO-Tango文库 | Addgene | kit no. 1000000068 |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | EXCELL | -- | |
| PneumaCult-Ex Plus培养基 | STEMCELL Technologies | -- | |
| PneumaCult-ALI培养基 | STEMCELL Technologies | -- | |
| Transwell插入式培养皿 | Corning | 0.4 μm pore size | |
| 巨噬细胞集落刺激因子 | -- | -- | |
| 细胞转染 | PolyJet转染试剂 | SinaGen | -- |
| Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | -- | |
| 钙信号检测 | 腔肠素 | -- | -- |
| Fluo-4AM钙离子荧光探针 | -- | -- | |
| cAMP检测 | GloSensor cAMP检测试剂 | Promega | -- |
| 信号通路抑制 | IBMX(3-异丁基-1-甲基黄嘌呤) | -- | -- |
| Western blot | 抗磷酸化ERK抗体 | Cell Signaling Technology | 4370 |
| 抗FLAG抗体 | Cell Signaling Technology | 14793 | |
| 抗IRG1/ACOD1抗体 | Cell Signaling Technology | 19857 | |
| 抗Myc抗体 | Cell Signaling Technology | 2278 | |
| 抗ERK抗体 | Proteintech | 67170-1-Ig | |
| 抗肌动蛋白抗体 | GenScript | A00702 | |
| 免疫荧光 | FITC标记的驴抗兔抗体 | Invitrogen | -- |
| DAPI核酸染料 | MilliporeSigma | -- | |
| FITC标记的鬼笔环肽 | Invitrogen | -- | |
| 显微镜 | Leica SP8激光共聚焦显微镜 | Leica | -- |
| 细胞成像 | BioTek Cytation 5细胞成像系统 | BioTek | -- |
| 代谢物检测 | Acquity UPLC I-Class超高效液相色谱 | Waters | -- |
| Xevo TQ-XS三重四极杆质谱仪 | Waters | -- | |
| Agilent 7890A-5975C气相色谱-质谱联用仪 | Agilent | -- | |
| 动物实验 | Oxgr1敲除小鼠 | -- | -- |
| Irg1敲除小鼠 | The Jackson Laboratory | stock no. 029340 | |
| 统计 | GraphPad Prism 8.0 | GraphPad Software | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| GPCR筛选 | 使用301个GPCR质粒,共表达Gα16和aequorin,ITA刺激浓度 阅读提示:参见方法部分“Aequorin assay”和结果部分“A screen of GPCR receptors discovers OXGR1 as an ITA receptor” |
| 细胞信号检测 | ITA浓度(0.5 mM),细胞类型(HEK293或原代上皮细胞),孵育时间 阅读提示:参见方法部分“Aequorin assay, Fluo-4AM assay, and GloSensor assay” |
| 动物感染模型 | 小鼠基因型(WT、Oxgr1 KO、Irg1 KO),PAO1菌株剂量(1×10^7 CFU),感染时间(12小时),ITA补充剂量(1 mM) 阅读提示:参见方法部分“Mouse intranasal infection” |
| 黏液纤毛评估 | 离体气管培养或ALI培养,ITA浓度(500 μM),检测方法(荧光珠运动) 阅读提示:参见方法部分“Measurement of particle transport” |
| 黏液分泌检测 | 小鼠鼻内给药剂量(500 μM ITA),给药后时间(1小时),染色方法(Alcian blue/PAS) 阅读提示:参见方法部分“Histological analysis of nasal cavity” |