Kras癌基因消融可防止晚期肺腺癌产生耐药性

Kras oncogene ablation prevents resistance in advanced lung adenocarcinomas

作者信息Marina Salmón, Ruth Álvarez-Díaz, Coral Fustero-Torre, Oksana Brehey, Carmen G Lechuga, Manuel Sanclemente, Fernando Fernández-García, Alejandra López-García, María Carmen Martín-Guijarro, Sandra Rodríguez-Perales, Emily Bousquet-Mur, Lucía Morales-Cacho, Francisca Mulero, Fátima Al-Shahrour, Lola Martínez, Orlando Domínguez, Eduardo Caleiras, Sagrario Ortega, Carmen Guerra, Monica Musteanu, Matthias Drosten, Mariano Barbacid
PMID36928090
发布时间2023-04
DOI10.1172/JCI164413

实验完整度

包含体内基因消融模型、药物处理模型、体外细胞系实验、RNA-seq/WES分析及PDX模型验证,涵盖功能验证和机制探索。

主要模型

KG12VloxPC2小鼠肺腺癌模型 KloxC2小鼠乌拉坦诱导肺腺癌模型 KG12CP小鼠肺腺癌模型 PDX-dc1和MIA PaCa-2人肿瘤细胞系

重点核对

Kras等位基因消融的完全性(CreERT2介导重组效率) sotorasib给药剂量(100 mg/kg)及给药方案 肿瘤体积测量方法(CT扫描)及反应标准 KrasG12C扩增的检测(WES和FISH) GST活性测定及GSTM表达水平

摘要

KRASG12C抑制剂已经彻底改变了KRASG12C突变肺腺癌患者的临床管理。然而,患者接触这些抑制剂会导致耐药性的迅速出现。在本研究中,我们使用基因工程小鼠比较了突变Kras表达的基因消融与致癌KRAS活性的药理学抑制之间的治疗效果和肿瘤耐药性的出现。Kras消融可诱导大量肿瘤消退,并防止体内耐药细胞的出现,而用选择性KRASG12C抑制剂sotorasib治疗KrasG12C/Trp53驱动的肺腺癌,引起的抗肿瘤反应有限,与临床观察到的相似,包括耐药性的迅速出现。与人类肿瘤不同,我们没有观察到RAS信号通路组分的突变。相反,sotorasib耐药肿瘤表现出突变Kras等位基因的扩增和异生物质代谢途径的激活,这表明KRASG12C抑制剂靶向活性的降低是耐药性发生的主要机制。总之,我们的结果表明,通过实现更强烈的KRAS信号抑制,模拟Kras消融所获得的结果,可以防止对KRAS抑制剂的耐药性。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
Kras癌基因消融与药理学KRAS抑制在治疗晚期肺腺癌中的疗效及耐药性出现机制有何不同?
核心机制
Kras消融通过诱导凋亡和重塑肿瘤微环境,防止耐药出现;而sotorasib耐药主要由于突变Kras等位基因扩增(包括ecDNA和HSR)和异生物质代谢途径(如GST)激活,降低药物靶向活性。此外,体外模型中NF-κB和STAT3信号通路激活通过上调BIRC5介导对Kras消融的耐药。
主要证据
KG12VloxPC2和KloxC2小鼠模型中Kras消融导致大部分肿瘤完全消退且无复发;KG12CP小鼠中sotorasib治疗产生耐药,WES显示KrasG12C扩增,RNA-seq显示异生物质代谢基因上调;体外细胞实验证实NF-κB/STAT3/BIRC5通路的作用。
研究意义
研究表明通过更彻底的KRAS信号抑制(模拟基因消融)可能防止耐药,并为联合治疗策略(如针对NF-κB/STAT3或代谢途径)提供了理论依据。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

KrasG12V消融诱导肿瘤消退

验证Kras癌基因连续表达对肿瘤维持和进展的必要性

在KG12VloxPC2小鼠中,通过Ad-FLPo诱导KrasG12V/Trp53肺腺癌,然后给予他莫昔芬饮食激活CreERT2,实现KrasG12V消融,通过CT监测肿瘤体积变化。

2

Kras消融后肿瘤微环境分析

探究Kras消融诱导肿瘤消退的机制,包括细胞增殖、凋亡和免疫浸润

对TMX处理1或2周的肿瘤组织进行组织学检查,检测Ki67、pERK、cleaved caspase-3、CD8、NK等标志物,并在无T细胞的裸鼠中验证T细胞贡献。

3

乌拉坦诱导肿瘤的Kras消融

验证Kras消融在化学诱导的Kras突变肿瘤中的效果

KloxC2小鼠注射乌拉坦诱导肺肿瘤,后续给予TMX饮食消融Kras,CT监测肿瘤反应。

4

细胞自主耐药机制分析

鉴定Kras消融后存活的肿瘤细胞的耐药机制

从KG12VloxP小鼠肿瘤中建立细胞系,体外用Ad-Cre消融Kras,获得耐药克隆,进行RNA-seq和Western blot分析NF-κB/STAT3信号通路,并通过shRNA或抑制剂验证功能。

5

sotorasib治疗与耐药模型建立

评估sotorasib在KG12CP小鼠中的疗效并建立耐药模型

KG12CP小鼠(Kras+/FSFG12C;Trp53F/F)通过Ad-FLPo诱导肿瘤,给予sotorasib(100 mg/kg)长期治疗,监测肿瘤反应并收集耐药肿瘤。

6

耐药肿瘤基因组和转录组分析

鉴定sotorasib耐药的分子机制

对耐药和对照肿瘤进行WES和RNA-seq分析,检测拷贝数变化和基因表达差异,识别Kras扩增和异生物质代谢途径激活。

7

GST表达对sotorasib敏感性的影响

验证异生物质代谢酶(GSTM1/3/5)表达是否赋予sotorasib耐药

在PDX-dc1和MIA PaCa-2细胞中过表达GSTM1/3/5,测定GST活性和细胞对sotorasib的敏感性。

8

sotorasib耐药可逆性评估

探究耐药是否可逆,并研究Kras扩增的动态变化

将耐药肿瘤在持续或间断sotorasib暴露下传代,观察停药后生长变化;体外培养耐药细胞,撤药后检测敏感性和Kras扩增状态。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
腺病毒-FLPo----
腺病毒-Cre----
索托拉西布----
他莫昔芬----
DMEM培养基----
胎牛血清----
10%缓冲福尔马林MilliporeSigma--
cOmplete Mini蛋白酶抑制剂混合物Roche--
磷酸酶抑制剂混合物2MilliporeSigma--
磷酸酶抑制剂混合物3MilliporeSigma--
NuPAGE 4%-12% Bis-Tris中型凝胶Invitrogen--
硝酸纤维素转移膜GE Healthcare--
抗Ki67抗体Cell Signaling Technology12202
抗磷酸化ERK抗体Cell Signaling Technology9101
抗裂解caspase-3抗体Cell Signaling Technology9661
CD8抗体Monoclonal Antibodies Core Unit, CNIOOTO94A
抗EGFR抗体Abcamab52894
抗磷酸化EGFR抗体Abcamab40815
抗ERK1抗体BD Biosciences554100
抗ERK2抗体BD Biosciences610103
抗AKT抗体Cell Signaling Technology9272
抗磷酸化AKT抗体Cell Signaling Technology9271
抗MEK1抗体Santa Cruz Biotechnologysc-6250
抗MEK2抗体BD Biosciences610235
抗磷酸化MEK1/2抗体Cell Signaling Technology9154
抗NF-κB p65抗体Santa Cruz Biotechnologysc-372
抗磷酸化NF-κB p65抗体Cell Signaling Technology3031
抗STAT3抗体Cell Signaling Technology9139
抗磷酸化STAT3抗体Cell Signaling Technology9131
抗caspase-3抗体Cell Signaling Technology9662
抗pan-RAS抗体CalbiochemOP40
抗BIRC5抗体Cell Signaling Technology2808
抗Lamin B抗体Santa Cruz Biotechnologysc-6216
HA.11抗体BioLegend901513
抗GAPDH抗体MilliporeSigmaG8795
抗Vinculin抗体MilliporeSigmaV9131
Axio Scan.Z1切片扫描仪Zeiss--
ZEISS ZEN软件版本3.1Zeiss--
GraphPad Prism版本8.4.0GraphPad Software--
MIA PaCa-2细胞系ATCC--
PDX-dc1细胞系----
BAY 11-7082----
Stattic----
肿瘤坏死因子-α----

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
KrasG12V消融模型
等位基因组合(KrasFSFG12Vlox等位基因,CreERT2表达)(如Rosa26-CreERT2和hUBC-CreERT2)、他莫昔芬给药方案(饮食浓度和持续时间)
阅读提示:Methods: Mice; Results: Kras oncogene ablation induces massive regression of advanced KrasG12V/Trp53-driven LUADs; Figure 1 legend
sotorasib治疗
sotorasib剂量(100 mg/kg)、给药途径、治疗持续时间、肿瘤体积评估标准
阅读提示:Results: Pharmacological inhibition of oncogenic KRAS signaling induces rapid tumor resistance; Figure 6 legend; Methods: Mice
细胞培养条件
培养基(DMEM+10% FBS)、细胞系来源、Kras消融方法(Ad-Cre感染)、耐药克隆筛选条件
阅读提示:Methods: Cell lines; Supplement Figure 4 and 5
耐药机制分析
WES和RNA-seq的样本量、测序平台、数据分析方法(GSEA参数)、拷贝数分析算法
阅读提示:Results: Genomic and transcriptomic analysis of sotorasib-resistant tumors; Methods: Data availability; Supplemental Tables 2 and 4
GST功能验证
GSTM1/3/5过表达载体、细胞系(PDX-dc1和MIA PaCa-2)、sotorasib处理浓度和时间、GST活性测定方法
阅读提示:Results: Sotorasib-resistant tumors display elevated levels of xenobiotic metabolism pathways; Figure 7, E and F; Supplemental Figure 10