KrasG12V消融诱导肿瘤消退
验证Kras癌基因连续表达对肿瘤维持和进展的必要性
在KG12VloxPC2小鼠中,通过Ad-FLPo诱导KrasG12V/Trp53肺腺癌,然后给予他莫昔芬饮食激活CreERT2,实现KrasG12V消融,通过CT监测肿瘤体积变化。
Kras oncogene ablation prevents resistance in advanced lung adenocarcinomas
包含体内基因消融模型、药物处理模型、体外细胞系实验、RNA-seq/WES分析及PDX模型验证,涵盖功能验证和机制探索。
KG12VloxPC2小鼠肺腺癌模型 KloxC2小鼠乌拉坦诱导肺腺癌模型 KG12CP小鼠肺腺癌模型 PDX-dc1和MIA PaCa-2人肿瘤细胞系
Kras等位基因消融的完全性(CreERT2介导重组效率) sotorasib给药剂量(100 mg/kg)及给药方案 肿瘤体积测量方法(CT扫描)及反应标准 KrasG12C扩增的检测(WES和FISH) GST活性测定及GSTM表达水平
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证Kras癌基因连续表达对肿瘤维持和进展的必要性
在KG12VloxPC2小鼠中,通过Ad-FLPo诱导KrasG12V/Trp53肺腺癌,然后给予他莫昔芬饮食激活CreERT2,实现KrasG12V消融,通过CT监测肿瘤体积变化。
探究Kras消融诱导肿瘤消退的机制,包括细胞增殖、凋亡和免疫浸润
对TMX处理1或2周的肿瘤组织进行组织学检查,检测Ki67、pERK、cleaved caspase-3、CD8、NK等标志物,并在无T细胞的裸鼠中验证T细胞贡献。
验证Kras消融在化学诱导的Kras突变肿瘤中的效果
KloxC2小鼠注射乌拉坦诱导肺肿瘤,后续给予TMX饮食消融Kras,CT监测肿瘤反应。
鉴定Kras消融后存活的肿瘤细胞的耐药机制
从KG12VloxP小鼠肿瘤中建立细胞系,体外用Ad-Cre消融Kras,获得耐药克隆,进行RNA-seq和Western blot分析NF-κB/STAT3信号通路,并通过shRNA或抑制剂验证功能。
评估sotorasib在KG12CP小鼠中的疗效并建立耐药模型
KG12CP小鼠(Kras+/FSFG12C;Trp53F/F)通过Ad-FLPo诱导肿瘤,给予sotorasib(100 mg/kg)长期治疗,监测肿瘤反应并收集耐药肿瘤。
鉴定sotorasib耐药的分子机制
对耐药和对照肿瘤进行WES和RNA-seq分析,检测拷贝数变化和基因表达差异,识别Kras扩增和异生物质代谢途径激活。
验证异生物质代谢酶(GSTM1/3/5)表达是否赋予sotorasib耐药
在PDX-dc1和MIA PaCa-2细胞中过表达GSTM1/3/5,测定GST活性和细胞对sotorasib的敏感性。
探究耐药是否可逆,并研究Kras扩增的动态变化
将耐药肿瘤在持续或间断sotorasib暴露下传代,观察停药后生长变化;体外培养耐药细胞,撤药后检测敏感性和Kras扩增状态。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 肿瘤诱导 | 腺病毒-FLPo | -- | -- |
| 基因消融 | 腺病毒-Cre | -- | -- |
| 药物处理 | 索托拉西布 | -- | -- |
| 他莫昔芬 | -- | -- | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 组织固定 | 10%缓冲福尔马林 | MilliporeSigma | -- |
| Western blot | cOmplete Mini蛋白酶抑制剂混合物 | Roche | -- |
| 磷酸酶抑制剂混合物2 | MilliporeSigma | -- | |
| 磷酸酶抑制剂混合物3 | MilliporeSigma | -- | |
| NuPAGE 4%-12% Bis-Tris中型凝胶 | Invitrogen | -- | |
| 硝酸纤维素转移膜 | GE Healthcare | -- | |
| 抗Ki67抗体 | Cell Signaling Technology | 12202 | |
| 抗磷酸化ERK抗体 | Cell Signaling Technology | 9101 | |
| 抗裂解caspase-3抗体 | Cell Signaling Technology | 9661 | |
| 免疫组化 | CD8抗体 | Monoclonal Antibodies Core Unit, CNIO | OTO94A |
| Western blot | 抗EGFR抗体 | Abcam | ab52894 |
| 抗磷酸化EGFR抗体 | Abcam | ab40815 | |
| 抗ERK1抗体 | BD Biosciences | 554100 | |
| 抗ERK2抗体 | BD Biosciences | 610103 | |
| 抗AKT抗体 | Cell Signaling Technology | 9272 | |
| 抗磷酸化AKT抗体 | Cell Signaling Technology | 9271 | |
| 抗MEK1抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-6250 | |
| 抗MEK2抗体 | BD Biosciences | 610235 | |
| 抗磷酸化MEK1/2抗体 | Cell Signaling Technology | 9154 | |
| 抗NF-κB p65抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-372 | |
| 抗磷酸化NF-κB p65抗体 | Cell Signaling Technology | 3031 | |
| 抗STAT3抗体 | Cell Signaling Technology | 9139 | |
| 抗磷酸化STAT3抗体 | Cell Signaling Technology | 9131 | |
| 抗caspase-3抗体 | Cell Signaling Technology | 9662 | |
| 抗pan-RAS抗体 | Calbiochem | OP40 | |
| 抗BIRC5抗体 | Cell Signaling Technology | 2808 | |
| 抗Lamin B抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-6216 | |
| HA.11抗体 | BioLegend | 901513 | |
| 抗GAPDH抗体 | MilliporeSigma | G8795 | |
| 抗Vinculin抗体 | MilliporeSigma | V9131 | |
| 免疫组化 | Axio Scan.Z1切片扫描仪 | Zeiss | -- |
| 成像分析 | ZEISS ZEN软件版本3.1 | Zeiss | -- |
| 统计分析 | GraphPad Prism版本8.4.0 | GraphPad Software | -- |
| 细胞培养 | MIA PaCa-2细胞系 | ATCC | -- |
| PDX-dc1细胞系 | -- | -- | |
| 药物处理 | BAY 11-7082 | -- | -- |
| Stattic | -- | -- | |
| 肿瘤坏死因子-α | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| KrasG12V消融模型 | 等位基因组合(KrasFSFG12Vlox等位基因,CreERT2表达)(如Rosa26-CreERT2和hUBC-CreERT2)、他莫昔芬给药方案(饮食浓度和持续时间) 阅读提示:Methods: Mice; Results: Kras oncogene ablation induces massive regression of advanced KrasG12V/Trp53-driven LUADs; Figure 1 legend |
| sotorasib治疗 | sotorasib剂量(100 mg/kg)、给药途径、治疗持续时间、肿瘤体积评估标准 阅读提示:Results: Pharmacological inhibition of oncogenic KRAS signaling induces rapid tumor resistance; Figure 6 legend; Methods: Mice |
| 细胞培养条件 | 培养基(DMEM+10% FBS)、细胞系来源、Kras消融方法(Ad-Cre感染)、耐药克隆筛选条件 阅读提示:Methods: Cell lines; Supplement Figure 4 and 5 |
| 耐药机制分析 | WES和RNA-seq的样本量、测序平台、数据分析方法(GSEA参数)、拷贝数分析算法 阅读提示:Results: Genomic and transcriptomic analysis of sotorasib-resistant tumors; Methods: Data availability; Supplemental Tables 2 and 4 |
| GST功能验证 | GSTM1/3/5过表达载体、细胞系(PDX-dc1和MIA PaCa-2)、sotorasib处理浓度和时间、GST活性测定方法 阅读提示:Results: Sotorasib-resistant tumors display elevated levels of xenobiotic metabolism pathways; Figure 7, E and F; Supplemental Figure 10 |